目前大部分地區(qū)使用投入產(chǎn)出法核定農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額，成本法在逐步被淘汰。納稅人購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品根據(jù)主要用途不同可分為以下三類(lèi)，核定方法如下：
（一）用于生產(chǎn)或委托加工貨物，且構(gòu)成產(chǎn)品實(shí)體
1、投入產(chǎn)出法
當(dāng)期允許抵扣農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額=當(dāng)期農(nóng)產(chǎn)品耗用數(shù)量×農(nóng)產(chǎn)品平均購(gòu)買(mǎi)單價(jià)×扣除率/（1＋扣除率）
當(dāng)期農(nóng)產(chǎn)品耗用數(shù)量=當(dāng)期銷(xiāo)售貨物數(shù)量（不含采購(gòu)除農(nóng)產(chǎn)品以外的半成品生產(chǎn)的貨物數(shù)量）×農(nóng)產(chǎn)品單耗數(shù)量
注：農(nóng)產(chǎn)品是指列入《農(nóng)業(yè)產(chǎn)品征稅范圍注釋》（財(cái)稅字〔1995〕52號(hào)）的初級(jí)農(nóng)業(yè)產(chǎn)品，扣除率為銷(xiāo)售貨物的適用稅率，下同。目的是為了體現(xiàn)增值稅對(duì)增值額征稅的特點(diǎn)，使得最終產(chǎn)品銷(xiāo)項(xiàng)計(jì)算稅率和它的原料的進(jìn)項(xiàng)計(jì)算稅率相一致。
案例一：某公司2019年5月1日—5月31日銷(xiāo)售10000噸巴士殺菌羊乳，其主營(yíng)業(yè)務(wù)成本為6000萬(wàn)元，農(nóng)產(chǎn)品耗用率為70%，原乳單耗數(shù)量為1.06，原乳平均購(gòu)買(mǎi)單價(jià)為4000元/噸。使用投入產(chǎn)出法計(jì)算核定的進(jìn)項(xiàng)稅額。
當(dāng)期允許抵扣農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額=當(dāng)期農(nóng)產(chǎn)品耗用數(shù)量×農(nóng)產(chǎn)品平均購(gòu)買(mǎi)單價(jià)×扣除率/（1＋扣除率）=10000噸×1.06×0.4×9%/（1＋9%）=385.45萬(wàn)元。
【提示】如果此例換成生產(chǎn)出的產(chǎn)品是酸奶等13%稅率的貨物，則公式中的扣除率為13%。
案例二：M公司開(kāi)具農(nóng)產(chǎn)品收購(gòu)憑證購(gòu)進(jìn)原乳1000萬(wàn)元，采用核定扣除辦法。
借：原材料—原乳1000萬(wàn)元
貸：銀行存款1000萬(wàn)元
假設(shè)2019年4月核定抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額50萬(wàn)元：
借：應(yīng)交稅費(fèi)—應(yīng)交增值稅（進(jìn)項(xiàng)稅額）50萬(wàn)元
貸：原材料—原乳50萬(wàn)元 或主營(yíng)業(yè)務(wù)成本 50萬(wàn)元
依據(jù)：財(cái)稅〔2012〕38號(hào)、財(cái)政部 稅務(wù)總局 海關(guān)總署公告2019年第39號(hào)
2、成本法
當(dāng)期允許抵扣農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額=當(dāng)期主營(yíng)業(yè)務(wù)成本×農(nóng)產(chǎn)品耗用率×扣除率/（1＋扣除率）
農(nóng)產(chǎn)品耗用率=上年投入生產(chǎn)的農(nóng)產(chǎn)品外購(gòu)金額/上年生產(chǎn)成本
農(nóng)產(chǎn)品外購(gòu)金額（含稅）不包括不構(gòu)成貨物實(shí)體的農(nóng)產(chǎn)品（包括包裝物、輔助材料、燃料、低值易耗品等）和在購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品之外單獨(dú)支付的運(yùn)費(fèi)、入庫(kù)前的整理費(fèi)用。
案例三：某酒廠(chǎng)（一般納稅人）外購(gòu)糧食生產(chǎn)銷(xiāo)售白酒，采用成本法核定增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額。經(jīng)稅務(wù)機(jī)關(guān)核定的糧食耗用率為80%。2019年6月，企業(yè)主營(yíng)業(yè)務(wù)成本為150萬(wàn)元。假設(shè)不考慮其他副產(chǎn)品。
解：當(dāng)期允許抵扣糧食增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額=當(dāng)期主營(yíng)業(yè)務(wù)成本×農(nóng)產(chǎn)品耗用率×扣除率/（1＋扣除率）=150*0.8*0.13/1.13=13.81萬(wàn)元
依據(jù)：財(cái)稅〔2017〕37號(hào)第二條第三項(xiàng)、財(cái)稅〔2012〕38號(hào)
3、參照法
試點(diǎn)納稅人購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)銷(xiāo)售上述產(chǎn)品以外的其他產(chǎn)品，可采取“參照法”，在投產(chǎn)當(dāng)期增值稅納稅申報(bào)時(shí)向主管?chē)?guó)稅機(jī)關(guān)提出申請(qǐng)，參照所屬行業(yè)或者生產(chǎn)結(jié)構(gòu)相近的其他納稅人的平均水平，確定農(nóng)產(chǎn)品單耗數(shù)量，由主管?chē)?guó)稅機(jī)關(guān)據(jù)實(shí)核定，并報(bào)省稅務(wù)局備案。
（二）購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品直接銷(xiāo)售
當(dāng)期允許抵扣農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額=當(dāng)期銷(xiāo)售農(nóng)產(chǎn)品數(shù)量/（1－損耗率）×農(nóng)產(chǎn)品平均購(gòu)買(mǎi)單價(jià)×9%/（1＋9％），
損耗率＝損耗數(shù)量/購(gòu)進(jìn)數(shù)量
案例四：甲食品企業(yè)為增值稅一般納稅人，屬于農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額核定扣除試點(diǎn)范圍企業(yè)。2019年8月期初庫(kù)存農(nóng)產(chǎn)品200噸，期初平均買(mǎi)價(jià)0.21萬(wàn)元/噸；當(dāng)月從農(nóng)民手中購(gòu)入農(nóng)產(chǎn)品400噸，每噸含稅價(jià)格0.24萬(wàn)元，入庫(kù)前發(fā)生挑選整理費(fèi)用1萬(wàn)元；因企業(yè)生產(chǎn)能力下降，當(dāng)月直接銷(xiāo)售外購(gòu)農(nóng)產(chǎn)品260噸，取得不含稅銷(xiāo)售額140萬(wàn)元。已知農(nóng)產(chǎn)品損耗率為3%，則甲企業(yè)當(dāng)月應(yīng)納增值稅額為（?。┤f(wàn)元。
本月加權(quán)平均單價(jià)=（200*0.21+400*0.24）/600=0.23萬(wàn)元/噸，注意平均購(gòu)買(mǎi)單價(jià)不包括買(mǎi)價(jià)之外單獨(dú)支付的運(yùn)費(fèi)和入庫(kù)前的挑選整理費(fèi)用。計(jì)算可以抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額=當(dāng)期銷(xiāo)售農(nóng)產(chǎn)品數(shù)量/（1－損耗率）×農(nóng)產(chǎn)品平均購(gòu)買(mǎi)單價(jià)=260/（1-3%）*0.23*9%/（1+9%）=5.09；應(yīng)納稅額=140*9%-5.09=7.51萬(wàn)元。
1、購(gòu)進(jìn)時(shí)：
借：原材料 960000
貸：應(yīng)付賬款 960000
2、直接銷(xiāo)售時(shí)：
借：應(yīng)收賬款 1526000
貸：其他業(yè)務(wù)收入 1400000
應(yīng)交稅費(fèi)—應(yīng)交增值稅（銷(xiāo)項(xiàng)稅額） 12600
借：其他業(yè)務(wù)成本 565591.60
應(yīng)交稅費(fèi)—應(yīng)交增值稅（進(jìn)項(xiàng)稅額） 50903
貸：原材料 616494.60
（三）購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品用于生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)且不構(gòu)成貨物實(shí)體的（包括包裝物、輔助材料、燃料、低值易耗品等）
當(dāng)期允許抵扣農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額=當(dāng)期耗用農(nóng)產(chǎn)品數(shù)量×農(nóng)產(chǎn)品平均購(gòu)買(mǎi)單價(jià)×（10%或9%）/（1+10%或9%)
注：購(gòu)進(jìn)用于生產(chǎn)銷(xiāo)售或委托加工13%稅率貨物的，扣除率為10%；用于生產(chǎn)銷(xiāo)售或委托加工初級(jí)農(nóng)產(chǎn)品的，扣除率為9%。
案例五：某糧食加工廠(chǎng)2019年5月購(gòu)進(jìn)原木50000元作為燃料，用于生產(chǎn)膠合板,6月生產(chǎn)年糕銷(xiāo)售耗用燃料20000元。
購(gòu)進(jìn)時(shí)：
借：原材料 50000
貸：銀行存款 50000
生產(chǎn)領(lǐng)用時(shí)：
借：主營(yíng)業(yè)務(wù)成本 20000
貸：原材料 20000
核定扣除進(jìn)項(xiàng)稅額=20000/（1+10%）×10%=1818.18元。
借：應(yīng)交稅費(fèi)—應(yīng)交增值稅（進(jìn)項(xiàng)稅額） 1818.18
貸：主營(yíng)業(yè)務(wù)成本 1818.18
小規(guī)模納稅人發(fā)生增值稅應(yīng)稅銷(xiāo)售行為，合計(jì)月銷(xiāo)售額未超過(guò)10萬(wàn)元（以1個(gè)季度為1個(gè)納稅期的，季度銷(xiāo)售額未超過(guò)30萬(wàn)元，下同）的，免征增值稅。
小規(guī)模納稅人發(fā)生增值稅應(yīng)稅銷(xiāo)售行為，合計(jì)月銷(xiāo)售額超過(guò)10萬(wàn)元，但扣除本期發(fā)生的銷(xiāo)售不動(dòng)產(chǎn)的銷(xiāo)售額后未超過(guò)10萬(wàn)元的，其銷(xiāo)售貨物、勞務(wù)、服務(wù)、無(wú)形資產(chǎn)取得的銷(xiāo)售額免征增值稅。
依據(jù)：《財(cái)政部 稅務(wù)總局關(guān)于實(shí)施小微企業(yè)普惠性稅收減免政策的通知》（財(cái)稅〔2019〕13號(hào) ）、《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于小規(guī)模納稅人免征增值稅政策有關(guān)征管問(wèn)題的公告 》（國(guó)家稅務(wù)總局公告2019年第4號(hào) ），執(zhí)行期限為2019年1月1日至2021年12月31日。
四、收購(gòu)發(fā)票
（一）領(lǐng)用
納稅人向農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者個(gè)人購(gòu)買(mǎi)自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品，可以向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申請(qǐng)領(lǐng)用收購(gòu)發(fā)票。主管稅務(wù)機(jī)關(guān)根據(jù)納稅人的經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目和經(jīng)營(yíng)規(guī)模，對(duì)其領(lǐng)用發(fā)票的種類(lèi)、數(shù)量、版面金額以及領(lǐng)用方式按規(guī)定予以確認(rèn)。
納稅人購(gòu)買(mǎi)農(nóng)產(chǎn)品開(kāi)具收購(gòu)發(fā)票，按照收購(gòu)發(fā)票上注明的農(nóng)產(chǎn)品買(mǎi)價(jià)計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。試行農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額核定扣除辦法的納稅人，則根據(jù)《財(cái)政部 國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于在部分行業(yè)試行農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額核定扣除辦法的通知》(財(cái)稅〔2012〕38號(hào))的規(guī)定申報(bào)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。
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