一、三體是一個外星種族，因星球生存條件惡劣（三個太陽），非常希望能夠移民（占領(lǐng)）適宜居住的星球，第一部的主角葉文潔，對人類文明徹底絕望，向外界發(fā)送了宇宙波信號，招來了四光年外的三體人
三體人派出百分之一光速的飛船艦隊，前往地球，同時以光速向地球發(fā)射了鎖死地球科技的質(zhì)子，并協(xié)助地球中反人類的異類組成了三體組織，實施各種迎接三體人降臨的陰謀。
地球人雖然成功地消滅了三體組織，然而暴露出來的真相確讓地球人無可奈何，此時的地球人對于三體而言，只是蟲子！
二、地球人不甘心坐以待斃，發(fā)起了各種自救行動。針對三體人依靠思維傳輸交流（不會欺騙）的特性，擬訂了階梯計劃和面壁計劃。
性格孤僻身患絕的云天明在送給女神一個夢幻禮物（恒星）后，一心求死，卻被女神勸說參與把腦子切割下來，靠運氣送往太空中前行的三體艦隊，而后隨機應(yīng)變，這就是階梯計劃；
面壁計劃則由四名面壁者調(diào)動全球資源以只有自己知道的方式去尋求破局，不需要向任何人解釋；其中三個面壁者都失敗了。
第四個面壁者----三體人唯一要殺死的地球人羅輯，是面壁人中唯一既不是政治家也不是科學(xué)家的奇怪角色，除了莫名其妙地將一個幾十光年外的恒星坐標(biāo)發(fā)射了出去，其他什么也沒干；整個面壁計劃看起來就像個笑話。
地球人在經(jīng)歷了短暫的恐慌后，利用三體艦隊到達(dá)前的四百多年時間，大力發(fā)展了航天科技，建造了數(shù)量眾多的艦隊，信心暴增，危局似乎已經(jīng)解除；直到遭遇三體人派出的超時代武器----水滴（一個），一個照面全軍覆沒，地球再次進(jìn)入必死之局。
三、從冬眠中喚醒的羅輯成為了地球的救世主-----之前發(fā)送坐標(biāo)的那顆恒星被摧毀了，而這印證了羅輯關(guān)于宇宙社會學(xué)的推論〈黑暗森林法則〉——每個文明都是黑暗中潛行的持槍獵人，一旦被發(fā)現(xiàn)，能生存的只能是一方或者都不能生存。
坐標(biāo)的暴露使那顆恒星遭到摧毀；而地球和三體的坐標(biāo)成為懸在三體個地球頭上的達(dá)摩克利斯之劍，而羅輯成為掌握兩個種族命運的執(zhí)劍人，而羅輯高達(dá)90%的威脅指數(shù)（有危險就會發(fā)送坐標(biāo)的概率）迫使三體人非常配合，地球跟三體進(jìn)入和平共處的新局面。
四、長久地和平讓地球人又一次遺忘了自己的局面，仿佛三體從來都是當(dāng)今的綿羊模樣，在羅輯老去將要更換執(zhí)劍人的時候，云天明的女神程心——萬惡的圣母婊，拒絕可前上司維德的勸阻，參與并贏了被三體評測威脅指數(shù)99%的維德，獲得了執(zhí)劍人資格。
就在新老執(zhí)劍人進(jìn)行交接后的十分鐘內(nèi)，三體發(fā)動了攻擊（程心的威脅指數(shù)不到20），摧毀了地球人的坐標(biāo)發(fā)射裝置，解除了地球人唯一的威懾措施，地球人再一次成為待宰羔羊，所有人被要求轉(zhuǎn)移至澳大利亞，并不準(zhǔn)生育繁衍，地球人的滅絕已經(jīng)不可阻擋。
六、一艘飛船幸運地遇到四維空間，擺脫了‘水滴’的追捕，將坐標(biāo)發(fā)射了出去，不久三體的三個太陽被摧毀了，三體艦隊調(diào)整了航向，不再前往地球，因地球也即將面臨被摧毀的命運；臨走前三體人答應(yīng)云天明和程心進(jìn)行一次交流。
在三體人的監(jiān)視下，云天明用三個童話故事偷偷地將拯救地球人的方向告訴了程心；地球人對于云天明告知的方向存在分歧，維德在程心冬眠期間掌管了程心的公司，大力發(fā)展光速技術(shù)，而這違背了當(dāng)時主流的方向——在太陽被摧毀后移民土星；
程心醒來后又一次做了極其愚蠢的決定，終止了光速飛船的科研方向，此時來自其他文明的打擊到了，并不是之前以為的摧毀恒星，而是降維打擊——用二向箔將整個太陽系平面化，整個人類隨著太陽系成為一副無人欣賞的畫卷
七、地球上唯一的光速飛船就是程心的前上司制造的，這艘飛船載著程心飛向云天明送給她的那顆恒星，這里有云天明留給程心的禮物——一個小型宇宙，一個獨立于宇宙體系的特殊空間。
因為文明之間的相互摧毀頻繁使用降維打擊，原本十一維的宇宙變成了三維，于是有高級文明主導(dǎo)重新啟動宇宙，呼吁全宇宙文明主動交出特殊空間——小宇宙，圣母婊最后一次坑了全宇宙——藏起一部分東西沒有交出，導(dǎo)致宇宙總質(zhì)量不足而重啟失敗，宇宙毀滅。（全劇終）
