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武漢科技大學(xué)姚凱團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)新型CRISPR工具,逆轉(zhuǎn)遺傳性失明

來(lái)源:生物世界 2023-03-20 10:22

研究團(tuán)隊(duì)將先導(dǎo)編輯(Prime Editor)與無(wú)PAM序列限制的spCas9突變體SpRY相結(jié)合,構(gòu)建了一種新的、通用型CRISPR系統(tǒng)——PESpRY。PESpRY可以被編程來(lái)糾正許多不同類(lèi)型的基

我們?nèi)祟?lèi)主要通過(guò)視覺(jué)、聽(tīng)覺(jué)、嗅覺(jué)、觸覺(jué)和味覺(jué)5種感官接受外部信息,而其中至少有80%以上的外界信息是通過(guò)視覺(jué)獲取。因此,失去視覺(jué)對(duì)人來(lái)說(shuō)是一件十分糟糕和可怕的事情,它不僅給失明者帶來(lái)諸多生活上的不便,還會(huì)沉重打擊失明者的精神信念。

長(zhǎng)期以來(lái),治療失明極其困難,臨床上一直缺乏治療失明的有效方法。許多先天性失明和進(jìn)行性失明與基因突變相關(guān),近年來(lái)隨著基因治療技術(shù)的成熟,越來(lái)越多的研究嘗試通過(guò)基因療法來(lái)治療失明。例如,張鋒團(tuán)隊(duì)曾使用CRISPR-Cas9基因編技術(shù)恢復(fù)患有先天性黑蒙癥的小鼠的視力,并將其推進(jìn)到人類(lèi)臨床試驗(yàn)。這種疾病影響的是視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞,這是一種非神經(jīng)元細(xì)胞。然而,大多數(shù)遺傳性失明,包括視網(wǎng)膜色素變性,是由于神經(jīng)感光細(xì)胞本身的遺傳缺陷所引起的。

視網(wǎng)膜色素變性(Retinitis Pigmentosa,RP),是一種進(jìn)行性、遺傳性、營(yíng)養(yǎng)不良性退行性病變,主要表現(xiàn)為慢性進(jìn)行性視野缺失,夜盲,色素性視網(wǎng)膜病變和視網(wǎng)膜電圖異常,從而導(dǎo)致視力下降甚至失明,這也是人類(lèi)失明的主要原因之一。

2023年3月17日,武漢科技大學(xué)姚凱教授團(tuán)隊(duì)在 Journal of Experimental Medicine 期刊發(fā)表了題為:Vision rescue via unconstrained in vivo prime editing in degenerating neural retinas 的研究論文。

研究團(tuán)隊(duì)將先導(dǎo)編輯(Prime Editor)與無(wú)PAM序列限制的spCas9突變體SpRY相結(jié)合,構(gòu)建了一種新的、通用型CRISPR系統(tǒng)——PESpRY。PESpRY可以被編程來(lái)糾正許多不同類(lèi)型的基因突變,而不管這些突變發(fā)生在基因組中的哪個(gè)位置。

研究團(tuán)隊(duì)使用雙AAV載體遞送的PESpRY系統(tǒng)治療PDE6B基因突變的視網(wǎng)膜色素變性(RP)小鼠模型,成功恢復(fù)了功能性PDE6B蛋白的產(chǎn)生,挽救了神經(jīng)感光細(xì)胞。進(jìn)一步行為測(cè)試顯示,治療后的小鼠的視覺(jué)能力恢復(fù)良好。

這項(xiàng)研究為在退化的視網(wǎng)膜中進(jìn)行無(wú)PAM序列限制的先導(dǎo)編輯來(lái)預(yù)防視網(wǎng)膜色素變性(RP)相關(guān)基因突變引起的視力喪失提供了令人信服的證據(jù)。

視網(wǎng)膜色素變性(RP)可由超過(guò)100種不同基因的突變引起,據(jù)估計(jì),每4000人中就有一人患病。該疾病也入選了我國(guó)于2018年發(fā)布的《第一批罕見(jiàn)病名錄》。視網(wǎng)膜色素變性開(kāi)始于微弱的光敏桿狀細(xì)胞的功能障礙和死亡,然后擴(kuò)散到色覺(jué)所需的錐狀細(xì)胞,最終導(dǎo)致嚴(yán)重的、不可逆的視力喪失。

此前已有研究表明,堿基編輯(Base Editor,BE)能夠修正先天性黑蒙癥小鼠模型的視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞中的無(wú)義點(diǎn)突變,但堿基編輯(BE)只能對(duì)單個(gè)堿基突變進(jìn)行針對(duì)性修正,對(duì)于視網(wǎng)膜色素變性(RP)這種可由多個(gè)不同基因的突變引起的疾病,治療潛力顯然不夠。

2019年10月,劉如謙(David Liu)教授開(kāi)發(fā)了一種全新的精準(zhǔn)基因編輯工具——先導(dǎo)編輯(Prime Editor,PE),無(wú)需依賴DNA模板便可有效實(shí)現(xiàn)所有12種單堿基的自由轉(zhuǎn)換,而且還能有效實(shí)現(xiàn)多堿基的精準(zhǔn)插入與刪除。先導(dǎo)編輯(PE)能夠克服堿基編輯(BE)的局限性,為體內(nèi)基因編輯治療提供了新的解決方案。

2023年2月,四川大學(xué)華西醫(yī)院魏于全院士、楊陽(yáng)研究員、陸方教授等在 Signal Transduction and Targeted Therapy 期刊發(fā)表論文【2】。

 

該研究以斷裂蛋白質(zhì)內(nèi)含子(split intein)和雙AAV載體為基礎(chǔ),對(duì)先導(dǎo)編輯(PE)進(jìn)行優(yōu)化,并對(duì)先天性黑蒙癥小鼠模型進(jìn)行治療,精確且高效(最高編輯效率達(dá)16%)修復(fù)了小鼠視網(wǎng)膜細(xì)胞的致病基因突變,恢復(fù)了RPE65蛋白的表達(dá),挽救了視網(wǎng)膜和視覺(jué)功能,且沒(méi)有檢測(cè)到脫靶編輯。這項(xiàng)研究為通過(guò)先導(dǎo)編輯治療遺傳性視網(wǎng)膜疾?。↖RD)奠定了基礎(chǔ)。

 

但上述所有應(yīng)用都是針對(duì)視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞,而視網(wǎng)膜色素變性(RP)主要是由視網(wǎng)膜神經(jīng)感光細(xì)胞相關(guān)基因突變引起的?;蚪M編輯工具在退化的視網(wǎng)膜神經(jīng)細(xì)胞中挽救視力的直接效用仍然有限。

此外,在遺傳性視網(wǎng)膜疾病的治療中,特定基因突變位點(diǎn)附近不一定具有基因編輯工具酶(Cas蛋白)所需的PAM序列,這可能限制了基因編輯治療時(shí)的可靶向范圍。

2020年3月,哈佛醫(yī)學(xué)院的研究人員在 Science 期刊發(fā)表論文【3】,開(kāi)發(fā)了一種近乎無(wú)PAM序列要求的spCas9新突變體——SpRY,這為體內(nèi)精準(zhǔn)基因編輯治療帶來(lái)了新的工具。

在這項(xiàng)最新研究中,在這項(xiàng)最新研究中,姚凱團(tuán)隊(duì)嘗試挽救患有視網(wǎng)膜色素變性的小鼠的視力,這些視網(wǎng)膜色素變性的小鼠是由編碼關(guān)鍵酶PDE6β的基因的點(diǎn)突變引起。姚凱團(tuán)隊(duì)將先導(dǎo)編輯(PE)與無(wú)PAM序列限制的spCas9突變體SpRY相結(jié)合,構(gòu)建了一種新的、通用型CRISPR系統(tǒng)——PESpRY。PESpRY可以被編程來(lái)糾正許多不同類(lèi)型的基因突變,而不管這些突變發(fā)生在基因組中的哪個(gè)位置。

當(dāng)編程靶向突變PDE6β基因時(shí),PESpRY系統(tǒng)能夠有效地糾正突變并恢復(fù)小鼠視網(wǎng)膜中的PDE6β酶活性,從而防止了桿狀細(xì)胞和錐狀細(xì)胞的死亡,并恢復(fù)了它們對(duì)光的正常電反應(yīng)。

在四個(gè)月大時(shí),攜帶PDE6β基因突變的小鼠(左)的視網(wǎng)膜變薄,缺乏桿狀感光細(xì)胞(紅色)。但是通過(guò)PESpRY系統(tǒng)糾正這種突變的小鼠(右)有更厚的視網(wǎng)膜,含有大量的桿狀細(xì)胞

接下來(lái),研究團(tuán)隊(duì)對(duì)基因編輯治療后的小鼠進(jìn)行了各種行為測(cè)試,以確認(rèn)治療的小鼠即使到了老年仍能保持視力。例如,這些治療后的小鼠能夠在視覺(jué)引導(dǎo)的水迷宮中找到出路,幾乎和正常健康的老鼠一樣,并且在視覺(jué)刺激下表現(xiàn)出典型的頭部運(yùn)動(dòng)。

姚凱教授

姚凱教授表示,編輯神經(jīng)視網(wǎng)膜細(xì)胞(尤其是不健康或即將死亡的感光細(xì)胞)基因組的能力,將為這些基因組編輯工具在治療視網(wǎng)膜色素變性等疾病方面的潛在應(yīng)用提供更有說(shuō)服力的證據(jù)。

他還表示,將PESpRY系統(tǒng)推進(jìn)到人類(lèi)治療,還需要進(jìn)行進(jìn)一步的安全性和有效性驗(yàn)證,但這項(xiàng)研究為Prime Editing這種新型基因編輯技術(shù)在體內(nèi)基因治療的潛力提供了實(shí)質(zhì)性證據(jù),特別是用于治療視網(wǎng)膜色素變性等遺傳性視網(wǎng)膜疾病。


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