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蛋白核心巖藻糖基化與O-GlcNAc位點(diǎn)解析方面獲進(jìn)展

蛋白糖基化是蛋白翻譯后修飾之中最為復(fù)雜的一類修飾,在藥物研發(fā)和新的藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)中頗具應(yīng)用前景。然而,與生物系統(tǒng)中蛋白質(zhì)糖基化的多樣性相比,聚糖分析的工具仍然有限,直接限制了蛋白糖基化在藥物研發(fā)中的應(yīng)用。中國科學(xué)院上海藥物研究所文留青課題組前期發(fā)展了基于生物素探針分子和糖苷內(nèi)切酶的可逆標(biāo)記策略,實(shí)現(xiàn)了對(duì)核心巖藻糖的可逆標(biāo)記研究,在組學(xué)水平上解析了蛋白核心巖藻糖糖基化在細(xì)胞表面的分布。然而,該團(tuán)隊(duì)在利用先前報(bào)道的方法對(duì)更復(fù)雜的生物學(xué)樣本進(jìn)行分析時(shí)發(fā)現(xiàn),由惡唑環(huán)化的生物素探針分子引起的非特異標(biāo)記反應(yīng)。

上海藥物所文留青課題組與周虎課題組發(fā)展了基于溫敏材料(PNIPAM)探針分子的新一代標(biāo)記方法。實(shí)現(xiàn)了在多肽水平上對(duì)細(xì)胞內(nèi)兩種重要的蛋白糖基化(核心巖藻糖基化和O-GlcNAc糖基化)的同步精準(zhǔn)解析(又名“一石二鳥策略”)。相關(guān)以Two Birds One Stone” Strategy for the Site-Specific Analysis of Core Fucosylation and O-GlcNAcylation為題,作為當(dāng)期封面,在線發(fā)表在《美國化學(xué)會(huì)志》(JACS)上。

該團(tuán)隊(duì)探討了不同細(xì)菌來源的突變型糖苷內(nèi)切酶(N糖合成酶活性)和野生型糖苷內(nèi)切酶(N糖水解酶活性)對(duì)于O-GlcNAc與核心巖藻糖的選擇性。研究發(fā)現(xiàn),EndoCC-N180H能夠特異性地識(shí)別O-GlcNAc糖肽,催化活性優(yōu)于已報(bào)道的EndoM-N175Q。而EndoF3-D165A能夠選擇性地標(biāo)記核心巖藻糖肽(之前報(bào)道發(fā)現(xiàn))。兩種酶同時(shí)都能高效地利用非天然的疊氮化底物分子(探針1),從而對(duì)核心巖藻糖肽和O-GlcNAc糖肽進(jìn)行分別標(biāo)記。在進(jìn)行“one-pot”的標(biāo)記反應(yīng)之后,研究利用二苯并環(huán)辛炔(DBCO)功能化的溫敏材料(探針2),通過無銅催化反應(yīng)對(duì)標(biāo)記的糖肽分子進(jìn)行捕獲富集。富集后的肽段仍可被野生型的糖苷內(nèi)切酶EndoCC與EndoF3識(shí)別并切割釋放,從而實(shí)現(xiàn)“可逆無痕”標(biāo)記。釋放的糖肽,通過質(zhì)譜分析得到蛋白糖基化位點(diǎn)信息。該方法避開了使用傳統(tǒng)生物素探針(非特異性標(biāo)記信號(hào)和探針分子除去困難)和常見固相合成材料(難以被糖苷內(nèi)切酶識(shí)別)。在常溫下,PNIPAM能夠溶解在水中;升溫時(shí),PNIPAM析出,通過簡(jiǎn)單離心即可實(shí)現(xiàn)糖肽的富集,操作便捷。PNIPAM的溫敏特性契合了酶催化的反應(yīng)溫度,并能通過簡(jiǎn)單的升溫和降溫操作實(shí)現(xiàn)富集操作。

科研人員利用新建立的富集策略,研究三種腫瘤細(xì)胞系的糖蛋白組學(xué),獲得了比多數(shù)報(bào)道方法更多的蛋白糖基化位點(diǎn)數(shù)。組學(xué)結(jié)果顯示,核心巖藻糖基化主要與細(xì)胞表面和細(xì)胞外基質(zhì)的功能相關(guān),而O-GlcNAc糖基化主要與細(xì)胞核和DNA轉(zhuǎn)錄過程相關(guān)。保守的糖基化位點(diǎn)分析發(fā)現(xiàn),核心巖藻糖蛋白主要與PI3K-Akt信號(hào)通路相關(guān),而O-GlcNAc糖蛋白主要與Notch通路相關(guān)。這與此前報(bào)道的研究結(jié)果吻合,進(jìn)一步佐證了該方法的可靠性。該方法是在多肽水平對(duì)目標(biāo)樣本進(jìn)行標(biāo)記和富集,因而具有更廣闊的應(yīng)用場(chǎng)景,例如,可實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤組織樣本的分析。

上述成果為活細(xì)胞中復(fù)雜糖基化修飾的解析提供了經(jīng)濟(jì)、便捷和有效的研究工具,有助于推動(dòng)糖基化的化學(xué)酶法標(biāo)記策略在蛋白糖基化的功能研究和潛在藥物新靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)等方面的應(yīng)用。研究工作得到臨港實(shí)驗(yàn)室、上海市和國家自然科學(xué)基金委員會(huì)的支持。

“一石二鳥”策略解析核心巖藻糖基化和O-GlcNAc糖基化位點(diǎn)



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