一、保守治療：保守治療多采用假孕或假絕經療法，如達哪唑和三苯氧胺（三苯氧胺【譯】：是目前最常見的抗雌激素藥物，是乳腺癌內分泌治療中最常用的藥物，已被廣泛應用于臨床。）、內美通、普維拉等，人為的造成月經停止來潮形成假孕狀態(tài)，不來月經就沒有痛經；但副作用較大，并對肝腎有一定的損害，不建議采用。
二、手術治療：保守治療無效時，說明患者子宮內膜異位癥狀已經比較嚴重，需考慮手術治療。手術治療有保守性、根治性和半保守性三種：
1、保守性手術：主要用于年輕、有生育要求者。保留子宮及附件（盡量保留雙側），只是切除病灶、分離粘連、重建卵巢、修復組織。近年來應用顯微外科手術，切除異位病灶，仔細縫合創(chuàng)面、重建盆腔腹膜，仔細止血，徹底沖洗，使手術效果臻于完善，提高手術后妊娠成功率，降低復發(fā)率。
2、半根治手術：無 生育要求，病灶嚴重，而年齡較輕者（即小于45歲），可行子宮和病灶全切，但盡可能保留一側正常的卵巢組織，以避免絕經期癥狀過早出現(xiàn)。切除子宮可去除具有活力的子宮內膜細胞種植的來源，從而可減少復發(fā)機會，但因保留了卵巢仍有可能復發(fā)。一般認為半根治術后復發(fā)率低，后遺癥少。
3、根治性手術：年齡接近絕經期，尤其病情重，有過復發(fā)者，應實行全子宮及雙側附件切除。手術時盡可能避免卵巢內膜囊腫破裂，囊液流出時應盡快吸盡、沖洗。術后出現(xiàn)更年期綜合征者，可用鎮(zhèn)靜劑及尼爾雌醇。
