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Science:體細胞突變刻畫了人類胚胎發(fā)育的里程碑

來源:生物谷 2021-03-25 14:26




體細胞突變使我們的細胞發(fā)生變化,但是由于它們不在種系中,因此不會傳播到下一代。盡管細胞譜系信息對于理解機體發(fā)育至關重要,但幾乎沒有直接的信息可用于人類?;诖耍瑏碜圆ㄊ款D兒童醫(yī)院霍華德·休斯醫(yī)學研究所的 Christopher A Walsh教授帶領團隊,通過對來自三個個體的多個組織進行了深度(250x)全基因組測序,以鑒定數(shù)百種體細胞單核苷酸變體(sSNV)。使用這些變體作為單個細胞中的“內(nèi)源條形碼”,該研究團隊重建了早期的胚胎細胞分裂。相關研究成果以“Landmarks of human embryonic development inscribed in somatic mutations”為題,在線發(fā)表在《Science》雜志上。



研究人員利用成年人體內(nèi)體細胞突變的分布數(shù)據(jù)來回顧人類發(fā)展的最早時刻。基于共有的體細胞突變的細胞譜系的計算顯示了當人類胚胎發(fā)生胃氣化時,身體將從中發(fā)育的細胞數(shù)量以及前腦細胞的譜系是可以確定的,從許多胃細胞中產(chǎn)生的不對稱命運也是可以識別的。

研究人員基于20個神經(jīng)元的單細胞全基因組測序分辨出的297sSNVs個中的82個, 將他們分解為分支進化枝,產(chǎn)生了一個譜系樹,該譜系跨越合子后的早期細胞世代,并將每個變異的起源追溯到胚胎。與預期相同,早期的sSNV顯示更高的MFs。在UMB1465中,該研究團隊鑒定了對應于第三代細胞的8個合子后祖細胞,表明所有主要早期譜系均被捕獲。

研究人員還針對不同器官(約25,000x)和1000多個皮質單細胞中的克隆sSNV的靶向測序,以及用于約100,000個皮質單細胞的轉座酶可及染色質測序的單核RNA測序和單核測定,證明是不對稱的早期祖細胞對胚外組織,不同的細菌層和器官的貢獻。

綜上所述,該研究團隊的數(shù)據(jù)表明,在大約170個細胞和大約50至100個前腦創(chuàng)建者的有效祖細胞集合中開始了胃泌尿。因此,鑲嵌突變以非常高的分辨率提供了人類胚胎發(fā)育的永久記錄。

參考文獻

Bizzotto S, Dou Y, Ganz J, et al. Landmarks of human embryonic development inscribed in somatic mutations. Science. 2021 Mar 19;371(6535):1249-1253. doi: 10.1126/science.abe1544. PMID: 33737485.
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