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教授SCI經(jīng)驗(yàn)傳授:打死也要掌握的6種細(xì)胞實(shí)驗(yàn)與方法描述!

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如果你還處于實(shí)驗(yàn)剛?cè)腴T(mén)階段,細(xì)胞實(shí)驗(yàn)就是必學(xué)技能,很多小伙伴對(duì)于這一塊的知識(shí)點(diǎn)都是“知其然而不知其所以然”,一知半解肯定是對(duì)以后的實(shí)驗(yàn)研究有非常大的影響,所以今天本著授人以魚(yú)不如原則,詳細(xì)解說(shuō)每一個(gè)知識(shí)點(diǎn),讓大家完全get!

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細(xì)胞功能分類(lèi)

6種常見(jiàn)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)原理

一、細(xì)胞增殖

 1. 細(xì)胞增殖的定義 

細(xì)胞以分裂的方式進(jìn)行增殖。單細(xì)胞生物,以細(xì)胞分裂的方式產(chǎn)生新的個(gè)體。多細(xì)胞生物,以細(xì)胞分裂的方式產(chǎn)生新的細(xì) 胞,用來(lái)補(bǔ)充體內(nèi)衰老或死亡的細(xì)胞。

 2. 細(xì)胞增殖的檢測(cè)方法 

① 細(xì)胞代謝活性檢測(cè)

(基于MTT、CCK-8等)

MTT(噻唑藍(lán)):通過(guò)添加四咪唑鹽到細(xì)胞中可進(jìn)行線(xiàn)粒體內(nèi)酶代謝活性的測(cè)定?;罴?xì)胞能將四咪唑鹽(如MTT、XTT、WST-1)還原成藍(lán)紫色的甲瓚或甲瓚鹽(Formazan),可通過(guò)分光光度計(jì)或酶標(biāo)儀進(jìn)行檢測(cè)。

Cell Counting Kit–8 (CCK-8)中的WST-8被細(xì)胞內(nèi)脫氫酶生物還原后生成的橙色甲臜染料能夠溶解在組織培養(yǎng) 基中,生成的甲臜量與活細(xì)胞數(shù)量成正比?;贑CK-8(WST-8)的試劑盒能高度準(zhǔn)確地檢測(cè)細(xì)胞增殖,比MTT法 及XTT法的靈敏度高5倍,能檢測(cè)更低的細(xì)胞數(shù)目。該試劑盒可適用于96孔板培養(yǎng)的貼壁或懸浮細(xì)胞。

②  DNA的合成的檢測(cè)

(基于BrdU的免疫法或EdU的點(diǎn)擊化學(xué)法),可通過(guò)體內(nèi)成像、微孔板或流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè) 等多種技術(shù)進(jìn)行細(xì)胞示蹤。

DNA的新組裝合成是細(xì)胞生長(zhǎng)的必要條件,故經(jīng)常被用來(lái)進(jìn)行細(xì)胞增殖、細(xì)胞活力及凋亡的檢測(cè)。BrdU及EdU,都是胸腺嘧啶的非放射性類(lèi)似物,能摻入增殖細(xì)胞的DNA中,可通過(guò)對(duì)BrdU及EdU的檢測(cè),從而對(duì)DNA的合 成量進(jìn)行測(cè)定。

EdU(5-Ethynyl-2’- deoxyuridine)是一種胸腺嘧啶核苷類(lèi)似物,能夠在細(xì)胞增殖時(shí)期代替胸腺嘧啶(T)滲 入正在復(fù)制的DNA分子中,通過(guò)基于EdU與Apollo?熒光染料的特異性反應(yīng)快速檢測(cè)細(xì)胞DNA復(fù)制活性,適用于細(xì) 胞增殖、細(xì)胞分化、生長(zhǎng)與發(fā)育、DNA修復(fù)、病毒復(fù)制、細(xì)胞標(biāo)記示蹤等方面的研究,尤其適合進(jìn)行siRNA、miRNA、小分子化合物及其他藥物的篩選實(shí)驗(yàn)。

二、細(xì)胞凋亡(apoptosis)

 1. 細(xì)胞凋亡(apoptosis)的定義 

細(xì)胞凋亡指為維持內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定,由基因控制的細(xì)胞自主的有序的死亡。

特點(diǎn):細(xì)胞皺縮、體積縮?。徊糠旨?xì)胞器、核糖體和核碎片被細(xì)胞膜包裹形成 凋亡小體,從細(xì)胞表面出芽脫 落,最后被具有吞噬功能的細(xì)胞吞噬;磷脂酰絲 氨酸外翻;細(xì)胞核染色質(zhì)濃縮、邊緣化、染色質(zhì)DNA斷裂。

 2. 細(xì)胞凋亡的檢測(cè)方法 

包括:Caspase活性檢測(cè);DNA片段化分析和檢測(cè);流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè);膜變化檢測(cè)(AnnexinV染色、膜 電位、線(xiàn)粒體功能完整性分析檢測(cè)實(shí)驗(yàn))及細(xì)胞形態(tài)學(xué)檢測(cè)。

① Annexin V-FITC/PI雙染法流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)細(xì)胞凋亡

細(xì)胞發(fā)生凋亡時(shí),其細(xì)胞膜的通透性也增加,但是其程度介于正常細(xì)胞與壞死細(xì)胞之間。利用這一特點(diǎn),被檢測(cè)細(xì)胞懸液 用熒光素染色,利用流式細(xì)胞儀測(cè)量細(xì)胞懸液中細(xì)胞熒光強(qiáng)度來(lái)區(qū)分正常細(xì)胞、壞死細(xì)胞核凋亡細(xì)胞。

Annexin V可與凋亡早期細(xì)胞的胞膜結(jié)合。因此Annexin V被作為檢測(cè)細(xì)胞早期凋亡的靈敏指標(biāo)之一。

碘化丙啶(Propidium Iodide, PI)能夠透過(guò)凋亡中晚期的細(xì)胞和死細(xì)胞的細(xì)胞膜而使細(xì)胞核染紅。因此將Annexin V與PI匹配 使用,就可以將處于不同凋亡時(shí)期的細(xì)胞區(qū)分開(kāi)來(lái)。

② 細(xì)胞形態(tài)學(xué)檢測(cè)-熒光染色法(Hoechst/DAPI)

細(xì)胞形態(tài)的變化如胞膜皺摺或出泡、核染色質(zhì)致密、胞質(zhì)濃縮等,都可作為細(xì)胞凋亡的證據(jù)。一般以細(xì)胞核染色質(zhì)的形 態(tài)學(xué)改變?yōu)橹笜?biāo)來(lái)評(píng)判細(xì)胞凋亡的進(jìn)展情況。DNA 特異性染料有:HO 33342(Hoechst 33342),HO 33258(Hoechst 33258),DAPI。三種染料與 DNA 的結(jié)合都是非嵌入式的,主要結(jié)合在 DNA 的 A-T 堿基區(qū)。紫外光激發(fā)時(shí)發(fā)射明亮的藍(lán)色熒光。

 結(jié)果評(píng)判 

Ⅰ 期:細(xì)胞核呈波紋狀(rippled)或呈折縫樣(creased),  部分染色質(zhì)出現(xiàn)濃縮狀態(tài);

Ⅱa 期:細(xì)胞核的染色質(zhì)高度凝聚、邊緣化;

Ⅱb 期:的細(xì)胞核裂解為碎塊,產(chǎn)生凋亡小體

③  TUNEL(原位缺口末端標(biāo)記技術(shù)(in situ end labelling technique,ISEL))

細(xì)胞凋亡中,染色體DNA雙鏈/單鏈斷裂二產(chǎn)生大量的粘性3‘-OH末端,在細(xì)胞(或組織)結(jié)構(gòu)保持不變的情況下,用熒 光素、地高辛或生物素標(biāo)記的脫氧尿三磷酸(deoxyuridinetriphate,DUTP)和末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶(TdT)相反應(yīng)與凋亡細(xì) 胞裂解后3‘-OH端結(jié)合,經(jīng)顯色反應(yīng)(細(xì)胞染成棕黃色)后檢測(cè)DNA裂解點(diǎn)的技術(shù)。

三、細(xì)胞自噬(Autophagy)

1.細(xì)胞自噬的定義

自噬(Autophagy)是普遍存在于真核細(xì)胞中的一種高度保守的代謝過(guò)程,是細(xì)胞內(nèi)的一種“自食(Self-eating)”現(xiàn)象。它作為細(xì)胞內(nèi)的主要降解途徑,將胞內(nèi)物質(zhì)運(yùn)輸?shù)饺苊阁w內(nèi)降解。

它主要有三 種形式:大自噬,小自噬和分子伴侶介導(dǎo)的自噬。

2、細(xì)胞自噬檢測(cè)方法

① 自噬標(biāo)志物( LC3)檢測(cè)

自噬形成時(shí),胞漿型 LC3(即 LC3-I)會(huì)酶解掉一小段多肽,轉(zhuǎn)變?yōu)椋ㄗ允审w)膜型(即 LC3-II),LC3-II/I 比值的大小可 估計(jì)自噬水平的高低。LC3 這一轉(zhuǎn)變過(guò)程可被 Western Blot 和熒光顯微鏡檢測(cè)到,現(xiàn)已成為監(jiān)測(cè)自噬體形成的推薦方法。在哺 乳動(dòng)物中,LC3 包含 3 種亞型:LC3A、LC3B、LC3C,分布在不同的組織中,因此需要用不同的抗體去鑒定這3種亞型。

② GFP-LC3 單熒光自噬指示體系

利用 LC3 在自噬形成過(guò)程中發(fā)生聚集的現(xiàn)象構(gòu)建了 GFP-LC3 指示體系,無(wú)自噬時(shí),GFP-LC3 融合蛋白彌散在胞漿中;自噬形成 時(shí),GFP-LC3 融合蛋白轉(zhuǎn)位至自噬體膜,在熒光顯微鏡下形成多個(gè)明亮的綠色熒光斑點(diǎn),一個(gè)斑點(diǎn)相當(dāng)于一個(gè)自噬體,可以通 過(guò)計(jì)數(shù)來(lái)評(píng)價(jià)自噬活性的高低。

③ mRFP-GFP-LC3 雙熒光自噬指示體系

mRFP-GFP-LC3 融合蛋白的病毒產(chǎn)品 mRFP 用于標(biāo)記及追蹤 LC3,GFP 的減弱可指示溶酶體與自噬小體的融合形成自噬溶酶體。 由于 GFP 熒光蛋白對(duì)酸性敏感(pH 敏感),當(dāng)自噬體與溶酶體融合后 GFP 熒光發(fā)生淬滅,而 mRFP 相對(duì)穩(wěn)定,因此只能檢測(cè)到紅色熒光。

 要點(diǎn):細(xì)胞凋亡、自噬和壞死的區(qū)別 

凋亡:細(xì)胞皺縮、體積縮??;部分細(xì)胞器、核糖體和核碎片被細(xì)胞膜包裹形成 凋亡小體,從細(xì)胞表面出芽脫落,最 后被具有吞噬功能的細(xì)胞吞噬;磷脂酰絲 氨酸外翻;細(xì)胞核染色質(zhì)濃縮、邊緣化、染色質(zhì)DNA斷裂。

自噬:部分細(xì)胞器腫大,在細(xì)胞質(zhì)中形成包裹細(xì)胞質(zhì)內(nèi)容物的雙層膜囊泡結(jié)構(gòu) ,再與溶酶體結(jié)合實(shí)現(xiàn)內(nèi)容物的降解。

壞死:細(xì)胞脹大,胞膜破裂,細(xì)胞內(nèi)容物外溢,核變化較慢,DNA降解不充分 ,引起局部嚴(yán)重的炎癥。

四、細(xì)胞衰老(cell aging)

1. 細(xì)胞衰老的定義

細(xì)胞衰老是細(xì)胞周期調(diào)控下多基因參與的復(fù)雜的生理病理過(guò)程,是一種抑癌機(jī)制,也是生物衰老的潛在原 因之一.細(xì)胞衰老最顯著的特征是細(xì)胞在很長(zhǎng)一段時(shí)間內(nèi)仍然維持代謝活性,但因阻滯于G1期,失去了對(duì)有絲 分裂原的反應(yīng)能力和合成DNA的能力,不能進(jìn)入S期.衰老細(xì)胞有著顯著的特性,衰老細(xì)胞細(xì)胞通常體積變大,  表達(dá)pH 6.0時(shí)有高酶活性的β-半乳糖苷酶。

2.細(xì)胞衰老的檢測(cè)方法

① β-半乳糖苷酶試劑盒檢測(cè)

SA-β-gal試劑盒檢測(cè)細(xì)胞衰老。以X-Gal為底物,通過(guò)細(xì)胞內(nèi)SA?β-gal在酸性條件下穩(wěn)定表達(dá),催化底物生成藍(lán)色 產(chǎn)物,表達(dá)SA-β-gal的細(xì)胞為陽(yáng)性細(xì)胞,呈現(xiàn)藍(lán)色,從而在光學(xué)顯微鏡下觀察顏色變化以分析細(xì)胞的衰老狀況。 僅對(duì)衰老細(xì)胞進(jìn)行染色,不會(huì)染色衰老前的細(xì)胞(presenescent?cells)、靜止期細(xì)胞(quiescent?cells)、永生 細(xì)胞(immortal?cells)或腫瘤細(xì)胞。

② western blot與qPCR檢測(cè)衰老相關(guān)基因(P16、P21、P53、SIRT1、PCNA)表達(dá)。

③ 流式細(xì)胞術(shù)(PI染色)檢測(cè)細(xì)胞周期變化

細(xì)胞周期(cell cycle):指細(xì)胞從前一次分裂結(jié)束起到下一次分裂結(jié)束為止的活動(dòng)過(guò)程,通常由G0/G1期、S  期、G2期和M期組成。衰老的細(xì)胞阻滯于G1期,失去了對(duì)有絲分裂原的反應(yīng)能力和合成DNA的能力,不能進(jìn)入S 期。

PI為插入性核酸熒光染料,能選擇性的嵌入核酸DNA和RNA雙鏈螺旋的堿基之間與之結(jié)合,其結(jié)合的量與 DNA的含量成正比例關(guān)系,用流式細(xì)胞儀進(jìn)行分析,就可以得到細(xì)胞周期各個(gè)階段的DNA分布狀態(tài),從而計(jì)算出 各個(gè)期的百分含量。

流式細(xì)胞周期結(jié)果圖解讀

五、細(xì)胞遷移和侵襲

1. 細(xì)胞遷移和侵襲的定義

①侵襲:腫瘤細(xì)胞向器官表面靠攏→腫瘤細(xì)胞用偽足貼在表面與內(nèi)皮細(xì)胞粘連→腫瘤細(xì)胞用偽足從細(xì)胞的天然間隙 到達(dá)基底層→腫瘤細(xì)胞深入器官深部→形成癌巢搜索

②轉(zhuǎn)移:腫瘤細(xì)胞離開(kāi)原發(fā)瘤,侵入淋巴管(或血管)→腫瘤細(xì)胞在淋巴管(或血管)內(nèi)運(yùn)行→腫瘤細(xì)胞從管中出 來(lái),再轉(zhuǎn)移到其他淋巴結(jié)(或毛細(xì)血管)中→到達(dá)其他組織或器官

2.細(xì)胞遷移和侵襲的檢測(cè)方法

①  細(xì)胞劃痕檢測(cè)細(xì)胞遷移

細(xì)胞劃痕是一種簡(jiǎn)單易行的檢測(cè)細(xì)胞運(yùn)動(dòng)的方法,實(shí)驗(yàn)成本低,可以用來(lái)檢測(cè)貼壁生長(zhǎng)腫瘤細(xì)胞的侵襲轉(zhuǎn)移能力。 注意事項(xiàng):一般做劃痕實(shí)驗(yàn),都是在無(wú)血清或者低血清狀態(tài)下培養(yǎng)的,否則細(xì)胞增殖就不能忽略。

按照6孔板背后畫(huà)線(xiàn)的垂直方向劃痕,可以形成若干交叉點(diǎn),作為固定的檢測(cè)點(diǎn),這就解決了前后觀察時(shí)位置不固 定的問(wèn)題。

② Transwell檢測(cè)細(xì)胞遷移和侵襲

細(xì)胞遷移與侵襲實(shí)驗(yàn)將Transwell小室放入培養(yǎng)板中,小室內(nèi)稱(chēng)上室,培養(yǎng)板內(nèi)稱(chēng)下室,上下層培養(yǎng)液以聚碳酸 酯膜相隔,將研究的細(xì)胞種在上室內(nèi),由于聚碳酸酯膜有通透性,下層培養(yǎng)液中的成分可以影響到上室內(nèi)的細(xì)胞, 應(yīng)用不同孔徑和經(jīng)過(guò)不同處理的聚碳酸酯膜,就可以進(jìn)行共培養(yǎng)、細(xì)胞趨化、細(xì)胞遷移、細(xì)胞侵襲等多種方面的研 究。侵襲實(shí)驗(yàn)需鋪Matrigel,而遷移實(shí)驗(yàn)不需要。

六、腫瘤血管形成

1. 腫瘤血管生成的定義

血管生成是腫瘤發(fā)生過(guò)程中新血管的形成。它是指源于已存在的毛細(xì)血管和毛細(xì)血管后微靜脈的新的毛 細(xì)血管性血管的生長(zhǎng)。腫瘤血管生成是一個(gè)極其復(fù)雜的過(guò)程,一般包括包括血管內(nèi)皮基質(zhì)降解、內(nèi)皮細(xì)胞移 行、內(nèi)皮細(xì)胞增殖、內(nèi)皮細(xì)胞管道化分支形成血管環(huán)和形成新的基底膜等步驟。

2.體外管形成實(shí)驗(yàn)方法

細(xì)胞實(shí)驗(yàn)方法描述

具體從以下四個(gè)步驟弄清細(xì)胞實(shí)驗(yàn)方法描述

1.文獻(xiàn)檢索

2.方法確認(rèn)

3.方法提取

4.方法完善

案例分析:

miR-488靶向調(diào)控FZD7基因介導(dǎo)wnt信號(hào)通路對(duì)胃癌細(xì)胞的增殖、遷移及侵襲

1、文獻(xiàn)檢索

(關(guān)鍵詞查找文獻(xiàn)了解相關(guān)對(duì)象的檢測(cè)內(nèi)容)

 miR-488靶向調(diào)控FZD7基因介導(dǎo)wnt信號(hào)通路對(duì)胃癌細(xì)胞的增殖、遷移及侵襲。

2、方法確認(rèn)

(確認(rèn)相關(guān)對(duì)象的檢測(cè)方法)

方法一: 關(guān)鍵詞搜索(于百度學(xué)術(shù))

方法二:圖片搜索(PMC和OPEN)

PMC:搜索NCBI-選擇PMC,輸入關(guān)鍵詞,看圖找方法

網(wǎng)址:https://www.NCbi.nlm.nih.gov/pmc/?term=

OPEN:輸入關(guān)鍵詞,看圖找方法

網(wǎng)址:https://openi.nlm.nih.gov

方法三: 試劑盒查找文獻(xiàn)或方法

關(guān)鍵詞搜索相關(guān)方法的試劑盒;

根據(jù)公司網(wǎng)站查找文獻(xiàn)或具體方法步驟。

3、方法提取

(中文文獻(xiàn)參考,英文文獻(xiàn)為主提取實(shí)驗(yàn)方法。)

① 中文文獻(xiàn)參考,英文文獻(xiàn)為準(zhǔn)

② 關(guān)鍵信息需明確

4、方法完善

(包括特殊方法特殊說(shuō)明; 試劑儀器需明確;分組,時(shí)間點(diǎn),劑量不能少。)

具體說(shuō)明:

CCK-8檢測(cè)細(xì)胞增殖通過(guò) CCK-8 試劑盒(96992-500TESTS-F ,Sigma,美國(guó))檢測(cè) miR-488 對(duì) MKN-45胃癌細(xì)胞增殖的影響。將 MKN-45細(xì)胞接種于96孔板中, 將實(shí)驗(yàn)分成空白對(duì)照組(未處理組) 、miR-488 mimic NC ( miR-488表達(dá)對(duì)照組)和 miR-488 mimic (miR-488表達(dá)組) , 分別于1、2、3、4d 進(jìn)行 CCK-8 檢測(cè)。 每孔中加入 10 μL CCK-8, 孵育3.5h后利用酶標(biāo)儀(Safire2,TECAN,瑞士)在 450nm處檢測(cè)光密度值[D(450)] ,每次實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。

注意事項(xiàng):

1、實(shí)驗(yàn)對(duì)象需明確

2、相關(guān)分組需明確;

3、劑量、濃度以及檢測(cè)時(shí)間點(diǎn)需明確;

4、實(shí)驗(yàn)重復(fù)次數(shù)需表明

5、試劑、設(shè)備需明確產(chǎn)品信息(貨號(hào)、生產(chǎn)商、地址);

1)參考文獻(xiàn)產(chǎn)品信息

2)選擇相關(guān)試劑盒產(chǎn)品信息

3)百度搜索產(chǎn)品信息(選擇國(guó)外公司為主)

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