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轉(zhuǎn)錄組學(xué):為特應(yīng)性皮炎治療打開一扇窗

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隨著基因研究的不斷發(fā)展,從全基因組層面研究各種生理病理過程是目前重要的研究方向之一。轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)指特定生物體在某種狀態(tài)下所有基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的總和。蛋白質(zhì)是行使細(xì)胞功能的主要承擔(dān)者,轉(zhuǎn)錄組是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的必然紐帶,也是生物體最重要的調(diào)控方式。特應(yīng)性皮炎(atopic dermatitis,AD)是一種遺傳相關(guān)的慢性炎性皮膚疾病,有較強(qiáng)的遺傳背景性,現(xiàn)在認(rèn)為遺傳易感性、環(huán)境因素以及免疫因素相互作用導(dǎo)致AD的發(fā)病,從轉(zhuǎn)錄組入手,可以進(jìn)一步認(rèn)識(shí)疾病發(fā)病機(jī)制,是打開遺傳、環(huán)境、免疫等相互作用的鑰匙,為尋找新的干預(yù)靶點(diǎn)提供新思路。

特應(yīng)性皮炎轉(zhuǎn)錄組學(xué)及靶點(diǎn)治療研究進(jìn)展

陳麗潔    梁景耀    劉玉梅    邵蕾    王建琴


作者單位:廣州醫(yī)科大學(xué)皮膚病研究所  廣州市皮膚病防治所

DOI:10.3760/cma.j.issn.0412-4030.2018.02.025

《中華皮膚科雜志》,2018,51(2):157-159



一、轉(zhuǎn)錄組的歷史與進(jìn)展


1995年Velculescu等發(fā)現(xiàn)第一個(gè)轉(zhuǎn)錄組,10年后第2代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)RNA序列分析(RNA-seq)為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究帶來了很大的進(jìn)展,近幾年,Streets等利用微流控芯片技術(shù)實(shí)現(xiàn)了高質(zhì)量單細(xì)胞的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。2016年,表觀轉(zhuǎn)錄組分析(epitranscriptome analysis)榮膺《自然方法》生命科學(xué)技術(shù)稱號(hào)。表觀轉(zhuǎn)錄組指的是添加到核糖核苷酸中的任何修飾,但不考慮該修飾的已知功能或遺傳性。科學(xué)家們?cè)絹碓揭庾R(shí)到,核糖核苷酸的化學(xué)修飾也就是表觀轉(zhuǎn)錄組在調(diào)控細(xì)胞特性中發(fā)揮的重要作用。


二、轉(zhuǎn)錄組學(xué)的應(yīng)用


在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,轉(zhuǎn)錄組已應(yīng)用于基因診斷、基因治療和基于基因組知識(shí)的治療、基于基因組信息的疾病預(yù)防、疾病易感基因的識(shí)別、風(fēng)險(xiǎn)人群生活方式、環(huán)境因子的干預(yù)等方面。轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究可進(jìn)一步認(rèn)識(shí)疾病發(fā)生發(fā)展過程中的機(jī)制,揭示基因突變規(guī)律,發(fā)現(xiàn)致病基因調(diào)控關(guān)鍵靶點(diǎn),以及尋找新的干預(yù)靶點(diǎn)。



三、轉(zhuǎn)錄組在AD的研究進(jìn)展


遺傳因素在AD的病因中占據(jù)重要地位,為研究遺傳與環(huán)境因素如何誘發(fā)AD等過敏性疾病發(fā)病提供了全新的思路和途徑,表觀遺傳調(diào)控主要包括DNA甲基化、組蛋白修飾和非編碼RNA(ncRNA)等,其中ncRNA是轉(zhuǎn)錄組的重要內(nèi)容。

1. 在動(dòng)物模型上的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究:過度表達(dá)IL?4轉(zhuǎn)基因小鼠中,上皮過度表達(dá)可導(dǎo)致各種趨化因子、細(xì)胞因子、炎癥因子異常調(diào)節(jié);AD犬動(dòng)物模型的絲聚蛋白mRNA與健康犬比較有顯著的高表達(dá);AD犬皮損和非皮損中有16個(gè)基因異常表達(dá),26個(gè)基因只在非皮損表達(dá),12個(gè)基因在皮損表達(dá)。 

2. 在AD患者及健康人群的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究:多種白介素在AD皮損與正常皮膚表達(dá)或治療前后表達(dá)有差異;AD患者皮膚上Th1和Th2細(xì)胞MicroRNA-155高表達(dá),MicroRNA-155可通過調(diào)節(jié)分化和輔助Th17功能來參與AD發(fā)病,MicroRNA-146a通過抑制角質(zhì)形成細(xì)胞的先天免疫應(yīng)答來減輕AD的慢性炎癥。此外,有研究通過多種轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析顯示除免疫介導(dǎo)途徑外,皮膚屏障通路,如角質(zhì)形成細(xì)胞分化通路在AD發(fā)病機(jī)制中起關(guān)鍵作用。

3. 體外模型的建立:近期有學(xué)者用Th2細(xì)胞因子誘導(dǎo)重建表皮,構(gòu)建具有AD形態(tài)學(xué)及轉(zhuǎn)錄組學(xué)特點(diǎn)的體外模型,為治療AD的天然分子篩選提供工具。


四、AD的靶點(diǎn)治療藥物


有了轉(zhuǎn)錄組學(xué)基因研究作厚實(shí)的奠基,相關(guān)的藥物治療也運(yùn)用到臨床當(dāng)中,AD的靶點(diǎn)治療藥物也在不斷發(fā)展。Beck等用dupilumab單抗(抗IL-4和IL-13單克隆抗體)阻斷Th2調(diào)節(jié)IL-4及IL-13的信號(hào)傳導(dǎo)途徑,從而抑制過敏性疾病的過程,發(fā)現(xiàn)治療過敏性哮喘的部分藥物可能同樣也可以治療AD。近期一項(xiàng)靶點(diǎn)治療發(fā)現(xiàn)皮下注射人源化抗人IL-31受體單克隆抗體CIM331可以明顯改善AD患者的瘙癢狀況。


五、結(jié)語


AD病因復(fù)雜,發(fā)病機(jī)制普遍認(rèn)為與遺傳、環(huán)境、免疫、感染等相互調(diào)控相關(guān),轉(zhuǎn)錄組從細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控水平上進(jìn)一步認(rèn)識(shí)其生理病理學(xué)機(jī)制。AD的病因在不斷完善,需要發(fā)現(xiàn)更多治療AD的新靶點(diǎn),對(duì)該病的預(yù)防和治療都有重要意義。



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