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SAT技術,洪荒助力分子診斷


精準醫(yī)療是未來醫(yī)療的方向,而醫(yī)療的起點是診斷,只有精確的診斷才可能談得上精確治療。隨著分子檢測技術的發(fā)展,越來越多的病原體檢測都可實現(xiàn)精準診斷。分子檢測技術以DNA和RNA檢測技術為主要代表,由于RNA僅在活的病原體中存在,故以RNA為靶標的診斷技術可以反應病原體的存活狀態(tài),可以用于療效監(jiān)測,指導臨床精準用藥,達到精準醫(yī)療的目的。目前實現(xiàn)RNA檢測的主要有三種技術,分別為TMA,NASBA和SAT技術。


DNA檢測技術


主要包括了聚合酶鏈反應(polymerase chain reaction,PCR)和連接酶鏈反應(link chain reaction,LCR)。PCR電泳因其檢測結果存在假陽性而導致特異性下降;而熒光定量PCR雜交法、PCR微孔板雜交法及套式PCR等方法,較好地解決了敏感性和特異性問題。LCR法可解決PCR中存在的假陽性問題,敏感性也有所提高,是一種較好的檢測方法。


基于DNA的體外擴增其模板既可以來自于活菌也可來自死菌,因此不能作為非病毒病原體的活菌診斷,即使病人得到了有效的治療,病原體死亡DNA仍然能夠穩(wěn)定存在至少3周時間,檢驗結果無法及時反應治愈結果,不利于臨床獲取有價值的診斷信息,從而導致錯誤治療和抗生素過度使用.并且DNA穩(wěn)定而不容易降解的特性,也較易在實驗過程中產(chǎn)生污染。


RNA檢測技術


RNA為單鏈結構,容易降解,在死菌中不易被檢測到同時也不易造成污染。最早由美國Gen-Probe公司開發(fā)的TMA技術是逆轉錄酶介導的體外特異性擴增rRNA直接進行檢測的一項新的RNA檢測技術。rRNA即核糖體RNA,是細菌核糖體的主要成分,在每個原核生物中存在約103-104個拷貝。


國內(nèi)自主研發(fā)的RNA檢測技術稱為RNA實時熒光恒溫擴增檢測技術(Simultaneous Amplification and Testing),簡稱SAT技術,其基本原理如下:


1.SAT技術以rRNA為靶標,在M-MLV反轉錄酶作用下產(chǎn)生一條cDNA鏈


2.M-MLV反轉錄酶的RNaseH酶活性將雜合的RNA/DNA中RNA降解,再經(jīng)M-MLV反轉錄酶作用產(chǎn)生一個cDNA拷貝


3.隨后T7RNA多聚酶以反轉錄的DNA為模板擴增產(chǎn)生100-1000個RNA拷貝


4.每一個RNA拷貝從反轉錄開始再一次進入擴增循環(huán),同時擴增產(chǎn)生的RNA拷貝與優(yōu)化的探針特異結合產(chǎn)生熒光信號


5.由熒光檢測儀捕獲熒光信號進行分析。

 



SAT技術的特點:


1)快速


■  SAT技術在恒溫42℃經(jīng)40-60鐘即可獲得理想的實驗結果。


2準確


■  特異性提取、特異性引物以及特異性探針保證了檢測結果的高特異性和準確性。


3特異性提取、特異性引物以及特異性探針保證了檢測結果的高特異性和準確性。低污染


■  由于擴增產(chǎn)物為RNA,減少了PCR過程中對實驗儀器和環(huán)境造成的污染,避免了交叉污染及假陽性。


4抗抑制


■  為了減少樣本的抑制反應,SAT對于樣本的制備采用磁珠吸附法,特異性捕獲靶標確保了高特異性的提取,通過水相洗滌最大程度地去除各種雜質,進而避免了假陰性結果的出現(xiàn)。


5高靈敏


■  此外為了減少樣本的抑制反應,SAT對于樣本的制備采用磁珠吸附法,特異性捕獲靶標確保了高特異性的提取,通過水相洗滌最大程度地去除各種雜質,進而避免了假陰性結果的出現(xiàn)。SAT擴增效率極高,30min即可獲得109倍的擴增,再通過實時檢測,整個過程僅需要2.5h即可完成診斷,提高了檢測的靈敏度。同時SAT的特異性提取、特異性引物以及特異性探針保證了檢測結果的高特異性和準確性。


6無創(chuàng)檢測


■  該技術可以檢測包括尿液在內(nèi)的多種樣本,無需抽血穿刺,實現(xiàn)無創(chuàng)檢測。大量臨床數(shù)據(jù)表明,SAT技術檢測不同部位的樣本結果一致性很好。


7輔助判愈


■  由于RNA只存在于活的細菌中,所以RNA檢測結果可以用于療效判斷,符合目前精準醫(yī)療的要求。


作為一項成熟的檢測技術,SAT目前已成功地應用于沙眼衣原體、淋病奈瑟菌、解脲脲原體、生殖支原體、結核分枝桿菌、肺炎支原體、腸道病毒以及甲流病毒等多種臨床檢測。


上海肺科醫(yī)院Zhenling C等采用SAT技術檢測結核分枝桿菌,其靈敏度可達100CFU/ml。廣州胸科醫(yī)院譚耀駒等收集疑似結核病患者的痰液734份、體液標本94份(包括68份胸腔積液、21份腦脊液、5份關節(jié)積液,以下統(tǒng)稱“體液”)及病灶組織標本76份,共計904份標本。同時采用SAT法、改良羅氏培養(yǎng)法進行檢測,培養(yǎng)陽性者進行基因芯片菌種鑒定。擴大金標準(培養(yǎng) PCR法)作比對,SAT法在痰液、體液、病灶組織標本的靈敏度和特異度分別為96.30%(260/270)、99.35%(461/464);96.97%(32/33)、100.00%(61/61);100.00%(27/27)、97.96%(48/49)。說明SAT具有極高的靈敏度和特異性。另外,Zhenling C等的研究結果顯示,通過SAT技術檢測,在涂陰患者標本中的陽性率為39.2%,其結果與臨床診斷結果一致。上海復旦兒科醫(yī)院Jin X等人使用SAT-CA16試劑對CA16病原體進行的檢測,SAT檢測CA16的靈敏度和特異性分別達到100%和99.2%。南方醫(yī)科大廣濟醫(yī)院高志華等人,以及浙江金華市中心醫(yī)院鄭雅萍等人采用SAT技術對同一患者的拭子和尿液標本進行檢測,檢測結果符合率高達100%,充分說明SAT檢測生殖道病原體可兼并尿液和拭子檢測。


這些研究均表明,SAT檢測技術準確度非常高,并可采用多種樣本類型,可為臨床醫(yī)生提供有力的臨床診斷依據(jù)。


參考文獻

[1] Zhenling Cui, et al. Novel Real-Time Simultaneous Amplification and Testing Method To Accurately and Rapidly Detect Mycobacterium tuberculosis Complex. Journal of Clinical Microbiology. 2012(50): 646-650.

[2] 蔡杏珊,馬品云,張院良,譚耀駒. 實時熒光核酸恒溫擴增檢測技術在結核病診斷中的臨床應用[J].中國防癆雜志,2014年,6月第36卷第(6)期.

[3] Jin Xu, A new accurate assay for Coxsackievirus A 16 by fluorescence detection of isothermal RNA amplification,Journal of Virological Methods 193(2013) 459-462. 

[4] 高志華,金印,陳峰.實時熒光核酸恒溫擴增技術檢測尿液中淋球菌的分析[J].國際檢驗醫(yī)學雜志,2012年2月第,33卷第(4)期.

[5] 鄭雅萍,袁青,陳偉. 實時核酸恒溫擴增技術在奈瑟菌感染檢測中的應用. 浙江實用醫(yī)學,2015,年2月第20卷第(1期).



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