公元1662年，國姓爺去世，臨終前交代由自己的弟弟鄭襲代理招討大將軍。但國姓爺長子鄭經(jīng)發(fā)動軍事政變，軟禁了鄭襲，公元1663年鄭襲出逃，向清軍投降，鄭經(jīng)宣布繼承延平郡王爵位。
清廷趁此機會，招攬了一大批隨鄭襲出逃、熟悉金廈及臺灣內(nèi)情的將領(lǐng)，并趁鄭軍內(nèi)部不穩(wěn)的機會，攻陷金門、廈門。從此，鄭經(jīng)只能困守臺灣島，失去了臺灣海峽的完全控制，海貿(mào)利潤大為縮減。國姓爺生前曾想攻打菲律賓，擴大土地、財源的同時，也懲戒當(dāng)時實際控制菲律賓的西班牙人（西班牙人統(tǒng)治菲律賓時期，對待當(dāng)?shù)厝A人華僑極為殘酷），經(jīng)此內(nèi)亂，也化為泡影。
鄭經(jīng)塑像
鄭經(jīng)主臺后，鄭軍實力大減，但仍然拒絕向清廷投降，轉(zhuǎn)而希望能依朝鮮例，以藩屬的身份加入朝貢體系，又被清朝康熙皇帝拒絕。雙方仍然沖突不斷。公元1673年，三藩之亂爆發(fā)，鄭經(jīng)也派兵反攻大陸。但三藩之間本來就各懷鬼胎，鄭經(jīng)也有著自己的私心，結(jié)果就是鄭經(jīng)竟然是在反清的耿精忠和尚之信的地盤上“收復(fù)失地”。本來耿精忠與清廷重兵對峙，雙方勝負難分，卻被鄭經(jīng)在背后不停的捅刀子，陷入了莫名其妙被明清兩軍“夾擊”的局面，最終向清廷投降。
倒霉的耿精忠，竟然受到了明清兩軍的夾擊
耿精忠投降后，鄭經(jīng)直面清軍進攻，與清軍在福建沿海地區(qū)互有勝負，但終究因綜合實力差距過大，退出大陸孤守臺灣。公元1681年，鄭經(jīng)去世，傳令由他與奶媽生的孩子鄭克臧繼承爵位。但由于鄭克臧在當(dāng)時人的眼中接近于是“亂倫”的產(chǎn)物，鄭軍內(nèi)部再次發(fā)生火并，鄭克臧被馮錫范絞死，鄭經(jīng)次子鄭克塽上臺（鄭軍此次內(nèi)部火并，也有很多人反對馮錫范的主張，因為鄭克臧雖然出身不好，但本人卻堅毅果斷，被視為有鄭成功的風(fēng)范）。
鄭經(jīng)去世兩年后，公元1683年，鄭軍叛將施瑯（此時他已官拜清朝水師提督）在澎湖海戰(zhàn)中擊敗鄭軍艦隊，鄭軍主將劉國軒逃回臺灣。馮錫范將鄭克塽交給施瑯，鄭家投降（劉國軒亦投降）。托庇于鄭家的明朝寧靖王朱術(shù)桂，與五位妃子一同自殺殉國。至此，大明朝跟鄭家一起，終于咽下了自己的最后一口氣。
鄭克塽畫像
鄭家的故事結(jié)束了，但國姓爺?shù)挠⒚麉s流傳至今。或許清朝康熙皇帝為鄭成功書寫的挽聯(lián)，可以一窺國姓爺?shù)膲雅e給時人與后人的震撼和感慨：四鎮(zhèn)多異心，兩島屯師，敢向東南爭半壁；諸王無寸土，一隅抗志，方知海外有孤忠！
