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1979年12月成立于昆明，首任理事長由馬世駿擔(dān)任。學(xué)會(huì)于1980年加入中國科學(xué)技術(shù)協(xié)會(huì)，1984年作為團(tuán)體會(huì)員加入國際生態(tài)學(xué)學(xué)會(huì)（International Association for Ecology，INTCOL）。

主要任務(wù)包括：①開展國內(nèi)外學(xué)術(shù)交流，普及生態(tài)科學(xué)知識(shí)，傳播生態(tài)學(xué)思想，推廣生態(tài)技術(shù)；②編輯、出版、發(fā)行生態(tài)學(xué)科技書刊及相關(guān)的音像制品；③組織全國生態(tài)學(xué)工作者參與國家生態(tài)環(huán)境建設(shè)政策、法律法規(guī)制定和科學(xué)決策工作；④對(duì)國家經(jīng)濟(jì)建設(shè)中的重大決策進(jìn)行科學(xué)論證和科技咨詢，提出政策建議；⑤促進(jìn)民間國際科技合作；開展對(duì)會(huì)員和科技人員的繼續(xù)教育和培訓(xùn)工作。

截至2020年10月，中國生態(tài)學(xué)學(xué)會(huì)現(xiàn)有會(huì)員10000余人，下設(shè)農(nóng)業(yè)生態(tài)、城市生態(tài)、理論生態(tài)、海洋生態(tài)、微生物生態(tài)、動(dòng)物生態(tài)、化學(xué)生態(tài)、景觀生態(tài)、濕地生態(tài)、種群生態(tài)、生態(tài)工程、長期生態(tài)、民族生態(tài)、生態(tài)健康與人類生態(tài)、污染生態(tài)、旅游生態(tài)、生態(tài)水文、中藥資源生態(tài)、淡水生態(tài)、紅樹林生態(tài)、穩(wěn)定同位素生態(tài)、生態(tài)遙感、生物入侵、流域生態(tài)、產(chǎn)業(yè)生態(tài)、區(qū)域生態(tài)、生態(tài)氣象、恢復(fù)生態(tài)、高寒生態(tài)等29個(gè)專業(yè)委員會(huì)，以及青年、科普、教育、期刊和咨詢5個(gè)工作委員會(huì)。

主辦中文學(xué)術(shù)期刊《生態(tài)學(xué)報(bào)》《應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào)》《生態(tài)學(xué)雜志》《濕地科學(xué)》以及英文學(xué)術(shù)期刊《生態(tài)系統(tǒng)健康與可持續(xù)性》（Ecosystem Health and Sustainability）、《林業(yè)研究》（Journal of Forestry Research）、《資源與生態(tài)學(xué)報(bào)》（Journal of Resources and Ecology）等。