內(nèi)嵌幫助
內(nèi)聯(lián)幫助可通過(guò)點(diǎn)擊任何地方的鏈接
中找到。
全球工具欄是從QuickGO的任何頁(yè)面訪問(wèn)。下列功能可以從全局工具欄進(jìn)行訪問(wèn);
1. QuickGO搜索框 - 可通過(guò)關(guān)鍵字或標(biāo)識(shí)符搜索GO術(shù)語(yǔ)或搜索蛋白的名稱或加入。
2. Web服務(wù) - QuickGO用品GO術(shù)語(yǔ)信息,并通過(guò)REST Web服務(wù)GO注釋數(shù)據(jù)。
3.數(shù)據(jù)集 - 即QuickGO包含的數(shù)據(jù)的細(xì)節(jié)
4.期限籃- GO術(shù)語(yǔ)可以通過(guò)點(diǎn)擊添加到您的籃子一詞
出現(xiàn)毗鄰GO方面的圖標(biāo)。
欲了解更多信息,請(qǐng)參見下面的期限籃“部分。
注釋工具欄無(wú)法顯示頁(yè)面的注釋,如注釋下載頁(yè)面訪問(wèn)。
下列功能可在注解工具欄進(jìn)行訪問(wèn);
1.顯示 - 注釋表是按客戶需要選擇顯示哪些列
2. ID映射 ??- 這種過(guò)濾器用于不同的序列標(biāo)識(shí)符類型之間切換,默認(rèn)為UniProtKB的加入。
3.過(guò)濾 - 注釋集可以由幾個(gè)參數(shù),包括序列標(biāo)識(shí)符,??類群,GO ID和證據(jù)碼進(jìn)行過(guò)濾。
4.統(tǒng)計(jì) - 各種統(tǒng)計(jì)信息計(jì)算當(dāng)前的注解集,包括許多不同的蛋白質(zhì),GO ID的數(shù)量,證據(jù)碼數(shù)和類群標(biāo)識(shí)符的數(shù)量。統(tǒng)計(jì)上更新即時(shí)對(duì)注解數(shù)據(jù)集中的每個(gè)過(guò)濾動(dòng)作。
5.下載 - 注釋集可以以多種格式,包括基因關(guān)聯(lián)的文件,蛋白質(zhì)列表和FASTA下載。的'限制'應(yīng)該增加,以確保在該組的所有注解被下載(在一組注解的總數(shù)目被發(fā)現(xiàn)在注解表的左上方)。有一個(gè)選項(xiàng),輸出文件gzip壓縮。
歷史記錄選項(xiàng)
默認(rèn)GO項(xiàng)歷史記錄顯示過(guò)去的500修改為所有GO條款。然而,除了點(diǎn)擊選項(xiàng)卡,時(shí)間戳和走在默認(rèn)的顯示標(biāo)識(shí)符,用戶還可以通過(guò)添加參數(shù)輸入頁(yè)面的URL,使用歷史記錄選項(xiàng)的形式定制的GO長(zhǎng)期變化的顯示。因此,用戶可以使用指定最感興趣,對(duì)他們的書簽定期更新所產(chǎn)生的URL變化的類型。
日期規(guī)格
在歷史記錄選項(xiàng)對(duì)話框允許用戶通過(guò)設(shè)置“從”,指定感興趣的明確日期范圍和“到”參數(shù); 這將限制顯示到(含)日期范圍內(nèi)記錄這些修改的數(shù)據(jù)。
另外,在“周期”參數(shù),用戶可以查看指定日期之前發(fā)生過(guò)天(S),周(S),月(S)或年(S)特定數(shù)量的GO長(zhǎng)期變化。
如果沒(méi)有“到”日期值被輸入,則周期將是相對(duì)于當(dāng)前日期。然而,如果指定了“到”值,則“周期”的值將顯示在時(shí)間表記錄直到和包括該指定的日期。
例如,如果“到”設(shè)置為2011-06-01和“期間”設(shè)定為6瓦特,然后QuickGO將顯示記錄在大小周期,2011年六月結(jié)束了第一這些變化。
分類
用戶可以使用此字段來(lái)指定哪些類型的長(zhǎng)期變化,他們?cè)敢夥祷亍?/p>
條款
GO條款可以在此字段中輸入限制所顯示的長(zhǎng)期變化。請(qǐng)注意,只有變化做出直接列出的條款將被顯示出來(lái),不稱之為后代。
限制
記錄返回的默認(rèn)數(shù)量為500,但這個(gè)限制可以增加/減少用戶。為了防止可能的瀏覽器的問(wèn)題,最大的上限為10,000。
GO術(shù)語(yǔ)可以通過(guò)點(diǎn)擊被添加到期限籃
出現(xiàn)相鄰GO術(shù)語(yǔ)圖標(biāo)。
以這種方式,一組的GO術(shù)語(yǔ)可以被選擇,然后可以用于檢索相關(guān)聯(lián)的注釋
從的UniProt-GOA網(wǎng)站下載基因關(guān)聯(lián)的文件。
從GO術(shù)語(yǔ)關(guān)鍵字搜索返回的檢索GO術(shù)語(yǔ)列表時(shí)列的說(shuō)明顯示
該GO包含三個(gè)本體術(shù)語(yǔ):分子功能,生物過(guò)程和細(xì)胞組分。
顯示的值表示,其中三個(gè)本體一個(gè)GO長(zhǎng)期駐留的。
GO術(shù)語(yǔ)標(biāo)識(shí)符
為顯示GO術(shù)語(yǔ)獨(dú)特的,穩(wěn)定的數(shù)值GO術(shù)語(yǔ)標(biāo)識(shí)符
點(diǎn)擊一個(gè)GO標(biāo)識(shí)符將帶你到GO術(shù)語(yǔ)詳細(xì)信息頁(yè)面,在GO來(lái)看,其中的詳細(xì)信息,以及對(duì)使用這一術(shù)語(yǔ)的任何注釋的列表。
單擊其中一個(gè)
圖標(biāo),使用戶可以添加鄰GO期限為期限籃
這樣產(chǎn)生的GO術(shù)語(yǔ)列表可用于檢索包含一個(gè)或多個(gè)這些GO術(shù)語(yǔ)注解
當(dāng)GO期限已過(guò)時(shí),一個(gè)紅色的“過(guò)時(shí)”的標(biāo)簽會(huì)出現(xiàn)相鄰的上市GO術(shù)語(yǔ)。
點(diǎn)擊這種“過(guò)時(shí)的”標(biāo)記將生成一個(gè)彈出窗口,將詳細(xì)說(shuō)明原因,后面的詞的obsoletion。
當(dāng)搜索返回基于匹配無(wú)論是在GO術(shù)語(yǔ)的描述或同義詞部分找到單詞GO術(shù)語(yǔ),
然后是一個(gè)“說(shuō)明”或“同”的標(biāo)簽會(huì)出現(xiàn)毗鄰上市GO術(shù)語(yǔ)。
點(diǎn)擊這樣的標(biāo)簽將產(chǎn)生彈出窗口示出的術(shù)語(yǔ)的定義或同義詞,具有匹配字(多個(gè))突出。
從蛋白質(zhì)的關(guān)鍵字搜索返回的檢索到的蛋白質(zhì)列表時(shí)列的說(shuō)明顯示
點(diǎn)擊加入將帶你到一個(gè)包含所有GO注釋蛋白質(zhì)的頁(yè)面。
該匹配于UniProtKB登錄號(hào)基因符號(hào)
通過(guò)UniProtKB提供蛋白質(zhì)名
該值的GO術(shù)語(yǔ)的詳細(xì)信息頁(yè)面說(shuō)明
二級(jí)GO術(shù)語(yǔ)標(biāo)識(shí)符列表這個(gè)詞替換
同義詞在意到術(shù)語(yǔ)名稱,與由同義詞范圍給定的名稱和同義詞之間的關(guān)系的指示密切相關(guān)的替代單詞或短語(yǔ)。
該作用域GO同義詞:
確切 - 完全等效互換的術(shù)語(yǔ)名稱,如鳥氨酸循環(huán)是尿素循環(huán)的精確同義詞
廣 - 同義詞是比一屆更廣泛的名稱,例如,細(xì)胞分裂是細(xì)胞分裂的一個(gè)廣泛的代名詞
窄 - 同義詞是窄或比一屆名字更精確,例如,嘧啶二聚體修復(fù)通過(guò)光解是光反應(yīng)修窄的代名詞
相關(guān) - 這些術(shù)語(yǔ)在某種程度上上面沒(méi)有涉及,如細(xì)胞色素BC1復(fù)雜的輔酶,細(xì)胞色素C還原酶活性相關(guān)同義詞相關(guān),毒力是發(fā)病的相關(guān)代名詞
有關(guān)詳情,請(qǐng)參閱http://www.geneontology.org/GO.ontology.structure.shtml#opt。
交叉引用外部數(shù)據(jù)庫(kù)條目相關(guān)的術(shù)語(yǔ)。
在GO的截面的視覺(jué)顯示器
向非循環(huán)圖(DAG)的單個(gè)或一組GO術(shù)語(yǔ)。條款中的GO是由一個(gè)或多個(gè)“關(guān)系”聯(lián)系到父(更普遍的)條款和常子(更具體的)條款
在GO的部分替代顯示,提供連接GO方面關(guān)系的簡(jiǎn)明視圖
條款中的GO可以彼此連接由三個(gè)不同的關(guān)系:
is_a
部分
調(diào)整對(duì)象
有關(guān)關(guān)系的更多詳細(xì)信息,請(qǐng)參見
這里。兒童來(lái)講是,現(xiàn)有的時(shí)候,直接鏈接到選定的GO術(shù)語(yǔ)更專業(yè)的GO術(shù)語(yǔ)。
GO條款和蛋白質(zhì)標(biāo)識(shí)之間建立關(guān)聯(lián)。
蛋白質(zhì)注解共同occurence的GO方面的統(tǒng)計(jì)。
列在表中注釋的描述
此列顯示數(shù)據(jù)庫(kù)的名稱來(lái)自其注釋的基因或蛋白質(zhì)識(shí)別發(fā)送器(例如,UniProtKB,以RefSeq,MGI)。
請(qǐng)點(diǎn)擊工具欄中的“ID映射”按鈕,如果你想有顯示的標(biāo)識(shí)映射到不同的序列數(shù)據(jù)庫(kù)。
此列顯示已注明去序列標(biāo)識(shí)符。
請(qǐng)點(diǎn)擊工具欄中的“濾鏡”按鈕,如果你想看到注解序列標(biāo)識(shí)符的具體名單。
另外,點(diǎn)擊工具欄中的“ID映射”按鈕,如果你想有顯示的標(biāo)識(shí)映射到不同的序列數(shù)據(jù)庫(kù)。
此列顯示任何亞型標(biāo)識(shí)符(剪接變異體)的GO條款已明確注明為。
如果沒(méi)有同種型標(biāo)識(shí)符的注釋被指定,那么就沒(méi)有在此列中顯示的值。
此列顯示相匹配的“ID”欄提供的標(biāo)識(shí)符號(hào)。
一個(gè)官方批準(zhǔn)的基因符號(hào)將被用于在該領(lǐng)域時(shí)可用。可替代地,其他基因符號(hào)或基因座的名稱被應(yīng)用。
如果沒(méi)有符號(hào)是可用的,該標(biāo)識(shí)符在塔2施加(DB_Object_ID)將被使用。
此列用于修改注釋的解釋。
當(dāng)一個(gè)注解應(yīng)用,值可以等于'沒(méi)','contributes_to“或”colocalizes_with“之一。
在預(yù)選賽進(jìn)一步的細(xì)節(jié)可以發(fā)現(xiàn)
這里。
如果你想明確地篩選限定值,這個(gè)注解集,請(qǐng)單擊工具欄中的“過(guò)濾器”按鈕。
該列顯示GO術(shù)語(yǔ)的獨(dú)特,穩(wěn)定的標(biāo)識(shí)符。
此列顯示原始注釋的GO ID時(shí),注釋已經(jīng)精簡(jiǎn)到更高級(jí)別的條款。
此列顯示一個(gè)引用到一個(gè)參考,或者一個(gè)搜索PubMed引用或GO_REF標(biāo)識(shí)符,它包含任一支撐所述注解或電子方法的細(xì)節(jié)的數(shù)據(jù)施加到產(chǎn)生的注釋。
GO術(shù)語(yǔ)被分配給基于不同證據(jù)蛋白質(zhì)。這是通過(guò)一個(gè)證據(jù)碼表示。又見
GO聯(lián)盟文檔 此列顯示一個(gè)附加標(biāo)識(shí),以支持使用某些證據(jù)的代碼(包括國(guó)際能源署(IEA),工業(yè)生產(chǎn)指數(shù),IGI,IC和ISS的證據(jù))的注釋。
示例:UniProtKB:O00341,InterPro的:IPROO1878,ENSEMBL:ENSG00000136141,GO:0000001,EC:3.1.22.1
這列顯示該GO術(shù)語(yǔ)所屬的本體的單個(gè)字母縮寫。一的任一F(分子F油膏),P(生物P rocess)或C(蜂窩?omponent)。
此列顯示與蛋白質(zhì)相關(guān)的同義詞或基因符號(hào)。
此列顯示的分類標(biāo)識(shí)的品種被注釋。
此列顯示相匹配的分類標(biāo)識(shí)符被注釋的品種名稱。
此列指示其創(chuàng)建的注釋的數(shù)據(jù)庫(kù)。在GO注解可以不是沒(méi)有數(shù)據(jù)源的確認(rèn)被復(fù)制。
此列顯示匹配在注釋中使用的GO標(biāo)識(shí)的GO術(shù)語(yǔ)名稱。
此列顯示原始注釋時(shí),注釋已經(jīng)精簡(jiǎn)到更高的層次來(lái)講GO術(shù)語(yǔ)名稱。
該列顯示注釋序列的氨基酸長(zhǎng)度。點(diǎn)擊的長(zhǎng)度將導(dǎo)致包含實(shí)際序列的彈出框。
列在長(zhǎng)期的歷史/更改日志說(shuō)明
變更條款顯示在根據(jù)由的UniProt-GOA數(shù)據(jù)庫(kù)中登記的時(shí)間戳日期降序排列。
點(diǎn)擊一個(gè)日期將顯示被記錄在該日的所有條款,這些改變。
不同的變化在GO術(shù)語(yǔ)重點(diǎn)圍繞穩(wěn)定GO標(biāo)識(shí)符。
點(diǎn)擊一個(gè)GO標(biāo)識(shí)符將提供所選擇的GO術(shù)語(yǔ),其中包括記錄這個(gè)詞的所有更改的完整歷史(在更改日志選項(xiàng)卡),完整的數(shù)據(jù)。
相關(guān)GO標(biāo)識(shí)符的GO術(shù)語(yǔ)名稱。
改變本體被記錄在的UniProt-GOA數(shù)據(jù)庫(kù)作為“新增”,“更新”或“刪除”動(dòng)作。
請(qǐng)注意,在這些變化的顯示順序是由在其中的行動(dòng)是在數(shù)據(jù)庫(kù)中執(zhí)行的順序決定。
這可能會(huì)導(dǎo)致在那里記錄為相同的整體本體更新的一部分該動(dòng)作可能會(huì)被顯示在一個(gè)非直觀順序的情況; 這是不幸的是,不可避免的。
變化是通過(guò)記錄到GO術(shù)語(yǔ)的具體方面的變化識(shí)別。
當(dāng)前審計(jì)的類別有:TERM,OBSOLETION,定義,同義詞關(guān)系,XREF??,中學(xué)和苗條。
除了“所有更改”選項(xiàng)卡,其中顯示的變化在所有類別中,也有對(duì)各個(gè)類別單獨(dú)的標(biāo)簽。
這列包含關(guān)于變更的其他詳細(xì)信息; 它的內(nèi)容可能有所不同取決于變更類別。
例如,對(duì)于關(guān)系類別它顯示目標(biāo)的GO術(shù)語(yǔ)的關(guān)系和所述標(biāo)識(shí)符和名稱的類型。
預(yù)選賽
'Contributes_to“出現(xiàn)在一個(gè)GO注釋時(shí)的蛋白復(fù)合物的功能變得容易,但不直接由它的亞基1進(jìn)行
。GO 聯(lián)盟的文檔 'Colocalizes_with“出現(xiàn)在一個(gè)GO注解以指示與細(xì)胞器或復(fù)雜的蛋白的一過(guò)性或外圍關(guān)聯(lián)
。GO 聯(lián)盟的文檔GO參考
手工標(biāo)注創(chuàng)建時(shí)策展人已經(jīng)找遍了所有相關(guān)文獻(xiàn)的注釋蛋白,沒(méi)有發(fā)現(xiàn)信息支持注釋任何GO長(zhǎng)期在一個(gè)特定的本體。這個(gè)參考只能與三個(gè)術(shù)語(yǔ)使用; 分子功能GO:0003674,生物制程GO:0008150和細(xì)胞組分
GO:0005575。GO 協(xié)會(huì)文件從實(shí)驗(yàn)證實(shí)手工GO注釋的數(shù)據(jù)傳送到使用ENSEMBL直向同源基因數(shù)據(jù)創(chuàng)建電子注解。
的UniProt-GOA文檔證據(jù)法
聯(lián)合occurence
術(shù)語(yǔ)的列表,其中最常注釋以相同的蛋白質(zhì)作為所選術(shù)語(yǔ),且術(shù)語(yǔ)至少經(jīng)常注釋以相同的蛋白質(zhì)。
該條款在注釋選定的期限,并按概率比蛋白質(zhì)超過(guò)限額。
相比術(shù)語(yǔ):這是相對(duì)于所選擇的術(shù)語(yǔ)
概率比
比較長(zhǎng)期的概率比給出選擇的術(shù)語(yǔ)來(lái)比較長(zhǎng)期的概率
=(#在一起/選擇)/(#比較/#全)
長(zhǎng)期的概率估計(jì)這里的注釋,以長(zhǎng)期的蛋白質(zhì)部分。
概率相似比
這兩個(gè)詞的概率比任任期的可能性
=#一起/(#選定+#compared-#在一起)
長(zhǎng)期的概率估計(jì)這里的注釋,以長(zhǎng)期的蛋白質(zhì)部分。
伯爵的蛋白質(zhì),其中既選擇和比較的術(shù)語(yǔ)注釋
伯爵的蛋白質(zhì),其中較長(zhǎng)期被標(biāo)注
GO注釋集可以使用一組布爾操作的定制。
輸入一個(gè)查詢(可用字段和運(yùn)算符如下所示)到輸入框高級(jí)篩選對(duì)話框中的選項(xiàng)卡,然后按提交按鈕提交查詢。如果還設(shè)置過(guò)濾條件上的任何其他選項(xiàng)卡,它們也將被包括在查詢,及編著與您在高級(jí)選項(xiàng)卡中輸入的條件。
一般形式
查詢是做出來(lái)的標(biāo)注標(biāo)準(zhǔn),結(jié)合運(yùn)營(yíng)商的集合。注釋標(biāo)準(zhǔn)是表單字段= value,其中??多個(gè)字段和值可以用逗號(hào)分隔的前提。該標(biāo)準(zhǔn)匹配的注釋中任何指定的字段有任何指定的值。例如,要找到任何注釋與ISA,partof或身份關(guān)系方面去:0005515或GO:0005634:
身份,ISA,partof = GO:0005515,GO:0005634
標(biāo)準(zhǔn)相結(jié)合,與下面的運(yùn)算:
操作者 | 用途 | 示例 | 說(shuō)明 |
(X) | 集團(tuán)運(yùn)營(yíng)商一起 - 用于澄清 | (長(zhǎng)期= GO:0005515 |證據(jù)= IPI)稅率= 9606 | 所有批注蛋白結(jié)合或使用人類蛋白質(zhì)的IPI證據(jù)碼 |
!X | 沒(méi)有 - 所有注釋不賽果 | !證據(jù)=國(guó)際能源署(IEA) | 所有非電子注解 |
X?? | 像 - 這賽果所有注釋,其中每個(gè)蛋白質(zhì)其中之一匹配? | 長(zhǎng)期= GO:0005515?證據(jù)= IDA | 找到所有的蛋白質(zhì)結(jié)合的注釋,其中各蛋白的注解中的至少一個(gè)是證據(jù)IDA |
X | 像 - 所有注釋為每個(gè)蛋白質(zhì),其中一人符合X | 證據(jù)= IDA | 發(fā)現(xiàn)所有注解到所有的蛋白質(zhì),其中所述注釋中的至少一個(gè)是證據(jù)IDA |
X和Y | 而且 - 所有注釋匹配的X和Y | 長(zhǎng)期= GO:0005515&稅= 9606 | 所有人類蛋白結(jié)合的注解 |
X | Y | 或者 - 任何標(biāo)注符合標(biāo)準(zhǔn)的X或Y | 稅= 9606 |稅額= 10090 | 所有批注人或小鼠蛋白質(zhì) |
查詢示例:
(祖先= GO:0005515&REF =結(jié)論:*)證據(jù)= ISS
領(lǐng)域
字段名稱 | 值 | 示例 | 說(shuō)明 |
DB | 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)(標(biāo)識(shí)符類型) | UniProtKB,的UniGene,ENSEMBL | 注釋要在這些數(shù)據(jù)庫(kù)中的蛋白質(zhì) |
術(shù)語(yǔ) | GO標(biāo)識(shí)符直接用于注解 | GO:0005515 | 注釋蛋白質(zhì)結(jié)合(而不是更specfic術(shù)語(yǔ)) |
祖先 | GO標(biāo)識(shí)符直接或間接(后代GO標(biāo)識(shí)符)的注解應(yīng)用 | GO:0002080 | 任何其子項(xiàng)002080或:注釋GO GO:0002079,GO:0002081,GO:0033282 |
特性 | GO標(biāo)識(shí)符直接用于注解 | GO:0005515 | (相同的術(shù)語(yǔ)標(biāo)準(zhǔn)) |
ISA | GO標(biāo)識(shí)符與具有關(guān)系到指定的期限 | GO:0005634 | 發(fā)現(xiàn)標(biāo)注的條款,如:GO:0043073 生殖細(xì)胞細(xì)胞核,但不要去:0005634 核本身 |
部分 | 有關(guān)系的一個(gè)部分轉(zhuǎn)到標(biāo)識(shí)符指定的期限 | GO:0005634 | 找到注解GO:0044428 核的一部分,但不要去:0005634 核本身 |
調(diào)整對(duì)象 | GO識(shí)別符與一個(gè)調(diào)節(jié)相對(duì)于指定的術(shù)語(yǔ) |
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positiveregulates | GO標(biāo)識(shí)符與正調(diào)節(jié)關(guān)系到指定的期限 |
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negativeregulates | GO標(biāo)識(shí)符與負(fù)調(diào)控關(guān)系到指定的期限 |
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haspart | GO標(biāo)識(shí)符與HAS部位關(guān)系到指定的期限 |
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證據(jù) | 注釋代碼證(EV)類別 | IDA,IC,ISS,國(guó)際能源署(IEA) | 注釋與任何這些證據(jù) |
資源 | 注釋供應(yīng)商 | 的UniProt,HGNC |
|
REF | 考研還是去參考支持注釋??梢詤⒖季唧w的參考標(biāo)識(shí)符或類別(類別級(jí)別,使用*后ref類型) | PUBMED:*,GO_REF:0000002,16262699 | 注釋參照任何醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)符,向InterPro的數(shù)據(jù)庫(kù)(參見 GO REF文檔)或以任何標(biāo)識(shí)符16262699 |
同 | 在國(guó)際能源署(IEA),國(guó)際空間站,IPI提供的其他證明資料,IC證明注釋; 見 :GO 文檔??桑ê鬄轭惣?jí)別,使用*類型)是指一個(gè)特定的標(biāo)識(shí)或類別 | EC:2.5.1.30,IPR000092,HAMAP:* | 注釋指的是這個(gè)特殊的EC代碼,這InterPro項(xiàng)目或任何HAMAP代碼 |
稅 | 注釋蛋白質(zhì)的NCBI分類標(biāo)識(shí)符 | 9606 | 人類注解 |
蛋白質(zhì) | 指定從現(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫(kù)中的特定序列標(biāo)識(shí)符(S)或加入(S)(見DB過(guò)濾柱) | Mm.363225,P99999 | 注釋任何這些收集品 |
此選項(xiàng)將導(dǎo)致注釋被精簡(jiǎn)高達(dá)請(qǐng)求GO術(shù)語(yǔ)的所有祖先,利用一切關(guān)系的路線。
它將使用不僅is_a,part_of,調(diào)節(jié)positively_regulates和negatively_regulates的關(guān)系,但是也未定義組合關(guān)系,如:
part_of +調(diào)控對(duì)
part_of + negatively_regulates
part_of + positively_regulates
調(diào)節(jié)+調(diào)控對(duì)
關(guān)系類型
| ? | (祖先) |
| = | (身份) |
| 一世 | (is_a) |
| P | (部分) |
|
| (occurs_in) |
|
| (調(diào)節(jié)) |
| + | (positively_regulates) |
| - | (negatively_regulates) |
聯(lián)系goa@ebi.ac.uk如果您對(duì)結(jié)果數(shù)據(jù)的查詢。
使用此選項(xiàng)可以查看,GO注釋的過(guò)濾器和下載集。
QuickGO可以篩選注釋集與特定的基因或蛋白質(zhì)的標(biāo)識(shí)符,GO術(shù)語(yǔ)標(biāo)識(shí)符,分類標(biāo)識(shí)符或證據(jù)碼。
該頁(yè)面還為您提供了不同的序列標(biāo)識(shí)符類型(例如UniProtKB,ENSEMBL,以RefSeq或MGI標(biāo)識(shí)符)之間的映射,并下載注釋數(shù)據(jù)的能力。
使用此選項(xiàng)找出QuickGO如何幫助您創(chuàng)建自己的GO苗條,或使用預(yù)定義的GO GO財(cái)團(tuán)以SLIMS產(chǎn)生本體結(jié)構(gòu)的具體意見,或注釋集。
使用此選項(xiàng)可以查看歷史的變遷中去,作為記錄在的UniProt-GOA數(shù)據(jù)庫(kù)。
在此頁(yè)面,您可以指定可選的過(guò)濾器來(lái)查看基于日期范圍的修改,規(guī)定的條件和/或改變的類型。
GO細(xì)長(zhǎng)型和GO期限比較 - 選擇條款 - 期限籃
本節(jié)將選擇條款頁(yè)面顯示你的任期籃子的內(nèi)容。
您可以通過(guò)點(diǎn)擊它添加一個(gè)詞來(lái)選擇術(shù)語(yǔ)列表
圖標(biāo); 您可以通過(guò)點(diǎn)擊添加所有的條款,以列表
的標(biāo)題行中的圖標(biāo)。
您可以通過(guò)點(diǎn)擊它添加一個(gè)詞來(lái)對(duì)比圖
按鈕。執(zhí)行此操作時(shí),該條款將被添加到圖表和列表項(xiàng)將用來(lái)突出圖表中的術(shù)語(yǔ)相同的顏色突出顯示。此外,該
按鈕變?yōu)?div id="fu8ihs5fyo3" class='imgcenter'>

; 點(diǎn)擊這個(gè)按鈕刪除從圖表中的術(shù)語(yǔ)。
您可以通過(guò)點(diǎn)擊添加所有的術(shù)語(yǔ)來(lái)對(duì)比圖
的標(biāo)題行中鍵。