這座名山古剎位于池尾后山水庫西側馬山。唐朝真元十八年（802）這里屬潮陽縣轄區(qū)。相傳有一名僧，法號大顛，云游至此，見這座山雄偉壯觀，狀似臥馬，山腰有二塊巨石雄迭，形成天然巖室，猶如臥馬長嘶。巖深一丈，寬二丈，環(huán)巖老樹參天，古藤蔽日，泉水潺潺，景色幽雅，因而選定在此創(chuàng)建道場。在古洞寨主、告老還鄉(xiāng)的唐朝都尉杜竹軒（字均莆，西隴村一世祖）的幫助下，建成庵寺。杜竹軒還將巖前糧田施為寺田，以作佛前香油之用。
大顛建成庵寺后，把這座無名山命名為馬山，稱這天然石室為馬嘶巖。自此，他甘心避世，木石與居，白云為侶，奉佛傳道。
唐元和十三年（818），憲宗皇帝遣使至鳳翔，迎佛骨入宮祀拜，刑部侍郎韓愈（世稱韓昌黎）上《諫迎佛骨表》奏帝，極力諫阻，觸怒憲宗，要將他處死，幸賴裴度、崔群求赦，才被貶為潮州刺史。
韓愈到潮州后，聞知轄下潮陽縣有此名山和道場，意欲訪察。為避朝野譏議，韓愈只帶隨從一名，微服私訪，策馬而來。到了馬嘶巖，把馬拴在一塊形似大柱的石頭上，然后入寺拜見大顛。大顛見韓愈氣宇軒昂，儀表不凡，讓座奉茶。在言談中，韓愈發(fā)現(xiàn)大顛出口成章，也非庸僧，兩人談得十分投機，吟詩作對，以助清興。當韓愈告辭時，大顛依依不舍，奉送下山。
唐穆宗即位（821），宣召韓愈進京為國子祭酒，復封兵部侍郎。臨進京前一天，韓愈還專程到馬嘶巖寺向大顛告別，由于韓愈在潮州執(zhí)政時，反對橫征暴斂，關心百姓疾苦，重視文化教育，深得民眾愛戴。韓愈上京赴任之后，大顛為紀念這位名儒的相訪，提議在馬嘶巖前原韓愈拴馬石的地方，建起一個歇馬亭。附近村民得悉，熱情募捐，把亭建成，也為馬嘶巖增添光彩。
從唐朝至清朝，馬嘶巖香火很旺，流傳有靈光寺拍牒馬山寺蓋印之稱?？滴跞?，潮陽陳升曾捐資修葺寺宇；乾隆六年，馬嘶巖寺住僧源正也曾募化修建；1922年，住僧鄭錦云又募化修葺寺；1995年，西隴村及鄰近鄉(xiāng)民、海外華僑又捐資擴建。
歷代文人逸士也常到此相訪，并題詩作對留念。據(jù)普寧縣志記載，清朝雍正二年，舉人陳元德曾賦詩，題大顛馬嘶巖遺跡。 “四大皆空莫更疑，笑他佛骨自支離。名儒仙釋原相契，還有東坡解帶時。水僻山幽偶作庵，天花隨意寫瞿曇。居廬書火傳真偈，除卻昌黎未許參”。
