導(dǎo) 讀
2016年11月29日,由華大基因研發(fā)的國內(nèi)首款病原微生物基因檢測軟件獲得藥監(jiān)局批文,進(jìn)入臨床應(yīng)用。這標(biāo)志著基于宏基因組學(xué)方法的NGS感染病診斷獲得重大突破,將會(huì)推動(dòng)感染病診療進(jìn)入精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代。
感染病診斷迫切需要精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)
感染性疾病是人類生命安全的巨大威脅。在中國,每年的感染病例數(shù)以百萬計(jì),而急性危重疑難感染以“病情高風(fēng)險(xiǎn),病程發(fā)展快”為特征。ICU科室里的膿毒血癥和重癥肺炎,死亡率往往達(dá)到30-50%;神經(jīng)內(nèi)科的腦膜炎更是異常兇險(xiǎn),致死致殘率超過15%;而超過兩周的兒童不明發(fā)熱待查,更讓無數(shù)家長揪心。目前的感染病診療以經(jīng)驗(yàn)性、指向性的方法為主,臨床醫(yī)患迫切需要?jiǎng)?chuàng)新性的診斷方法,更加精準(zhǔn)快速的鑒定感染病原,檢測耐藥毒力基因。
侵襲癥真菌重癥感染:煙曲霉菌
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首款NGS病原微生物基因檢測軟件
獲批臨床應(yīng)用
繼2015年初發(fā)布精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計(jì)劃之后,美國白宮于2016年5月13日發(fā)布國家微生物組計(jì)劃。同日, 美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)發(fā)布了感染疾病二代測序診斷設(shè)備指南,標(biāo)志著感染疾病的診療也將進(jìn)入精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代。華大基因于2014年提前布局,開展了感染病原二代測序診斷方法的研發(fā)。2016年11月29日,華大基因研發(fā)的國內(nèi)首款病原微生物基因檢測軟件獲得藥監(jiān)局批文進(jìn)入臨床應(yīng)用,標(biāo)志著基于宏基因組學(xué)方法的NGS感染病診斷獲得重大突破,將會(huì)推動(dòng)感染病診療進(jìn)入精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代。
病原微生物基因檢測軟件獲得藥監(jiān)局批文
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基于宏基因組學(xué)的NGS病原檢測
感染診斷新利器
剛剛獲批的病原微生物基因檢測軟件, 是基于二代高通量測序平臺(tái)產(chǎn)品的序列數(shù)據(jù),通過微生物專用數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)分析,經(jīng)過智能化算法獲得疑似致病微生物的種屬信息,并提供全面深入的報(bào)告參數(shù)輔助臨床診療決策。該軟件的主要技術(shù)優(yōu)勢如下:
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標(biāo)本直接測序:
針對(duì)血流感染、神經(jīng)系統(tǒng)感染、呼吸道感染癥候群,采集相應(yīng)感染部位的臨床樣本,如血漿、腦脊液、肺泡灌洗液等,對(duì)樣本直接進(jìn)行DNA提取建庫,然后進(jìn)行二代高通量測序獲得原始序列數(shù)據(jù),以進(jìn)行軟件分析。
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病原廣泛覆蓋:
該軟件以微生物宏基因組學(xué)方法為基礎(chǔ),此次注冊(cè)獲批軟件版本的病原檢測范圍覆蓋臨床重要致病細(xì)菌、病毒、支原體、衣原體、立克次氏體、螺旋體等,共488種病原。
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自動(dòng)快速報(bào)告:
此軟件分析一個(gè)上機(jī)文庫(10個(gè)樣本)數(shù)據(jù)總時(shí)間不超過120分鐘。自動(dòng)化智能化的數(shù)據(jù)分析和報(bào)告生成,可在15~30分鐘內(nèi)完成,快速響應(yīng)臨床需求。
病原快速檢測流程
剛剛獲批的病原微生物基因檢測軟件,與特定的測序儀與試劑盒配套使用,可在醫(yī)院實(shí)驗(yàn)室平臺(tái)上進(jìn)行病原微生物基因測序與本地化數(shù)據(jù)分析, 滿足感染病診斷的時(shí)效性與安全性要求,這標(biāo)志著感染病診治開始進(jìn)入精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代。NGS診斷技術(shù)正在高速發(fā)展,更需要結(jié)合醫(yī)院綜合診斷,有力支撐臨床實(shí)踐。唯有多學(xué)科合作,才能持續(xù)推進(jìn)感染病精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)。
擴(kuò)展閱讀:華大基因病原研究大事記
2003年
華大基因與相關(guān)單位合作完成了中國第一例SARS病毒基因組測序
2011年
德國爆發(fā)腸出血性大腸桿菌(EHEC)疫情, 全球首先破解EHEC全基因組序列
2012年
破解第一株感染人的豬鏈球菌全基因組序列
2014年
非洲埃博拉疫情爆發(fā), 參與中國疾控中心援非計(jì)劃,完成上百株病毒基因組破譯
2016年
7月
與檢驗(yàn)檢疫局合作,完成首例輸入性裂谷熱病毒基因組高通量測序
8月
與北京協(xié)和醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科合作發(fā)表病毒性神經(jīng)系統(tǒng)感染NGS診斷文章
10月
與北京協(xié)和醫(yī)院ICU科合作發(fā)表重癥膿毒血癥NGS診斷文章
降低出生缺陷 加強(qiáng)腫瘤防控
精確治愈感染 助力精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)
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