腹瀉分為急性腹瀉及慢性腹瀉，其病因也不盡相同，具體如下：
一、急性腹瀉病程多不超過3星期，腸道感染，包括食物中毒在內(nèi)，是引起急性腹瀉最常見的病因，可分為：
1、細(xì)菌感染：常見病原菌包括痢疾桿菌、大腸埃希桿菌、沙門菌屬、小腸彎曲菌、小腸結(jié)腸耶爾森菌、腸道金黃色葡萄球菌、產(chǎn)氣莢膜桿菌、魏氏梭狀芽孢桿菌、難辨梭狀芽孢桿菌、霍亂弧菌等。
2、原蟲與寄生蟲感染：包括阿米巴、血吸蟲、滴蟲、梨形鞭毛蟲等。
3、病毒感染：多見于腸道輪狀病毒感染、腸道腺病毒感毒感毒感染。
4、真菌感染：可導(dǎo)致腹瀉的真菌有很多，如過期食物中的霉菌等。
5、食物中毒：常見致病菌包括金黃色葡萄球菌、沙門菌、嗜鹽桿菌、蠟樣芽胞桿菌、產(chǎn)氣夾膜梭狀芽胞桿菌或肉毒桿菌；毒蕈、河豚魚、較大的魚膽及毒鼠藥、農(nóng)藥等其他有毒化學(xué)性毒物。
6、變態(tài)反應(yīng)：如食物過敏（牛奶、魚、蝦、海鮮產(chǎn)品等）可引起腹痛、腹瀉；過敏性紫癜等疾病可伴有腸蠕動(dòng)增快而發(fā)生腹瀉。
7、藥物：多種藥物可導(dǎo)致腹瀉，如紅霉素、氫氧化化化鎂、新霉素、林可霉素、硫酸鎂、山梨醇、甘露醇、5-氟脲密啶、利舍平（利血平）、普萘洛爾（心得安）等，這些藥物導(dǎo)致腹瀉的機(jī)制不盡相同；某些化學(xué)物質(zhì)如磷、砷、汞及酒精中毒等均可導(dǎo)致急性腹瀉。
二、慢性腹瀉的病期在2個(gè)月以上，病因比急性的更復(fù)雜，因此診斷和治療有時(shí)很困難。引起慢性腹瀉的病因甚多，包括：
1、腸道感染：是引起慢性腹瀉最常見的病因，包括細(xì)菌感染、原蟲和寄生蟲感染、真菌。
2、腸道非特異性炎癥或非感染性炎癥：自體免疫性疾病、自體免疫性疾病，放射治療引起的腸炎，吸收不良綜合征等。
3、吸收不良綜合征：吸收不良綜合征的分類十分復(fù)雜。吸收不良可因胃及小腸疾病而引起，也可因肝膽、胰腺疾病所致。
4、內(nèi)分泌疾?。憾喾N內(nèi)分泌疾病都伴有腹瀉的癥狀，如甲狀腺功能亢進(jìn)癥、糖尿病、甲狀旁腺功能減退癥與甲狀腺髓樣瘤、腎上腺皮質(zhì)功能減退癥、胰性霍亂綜合征、WDHA綜合征、水瀉-低鉀-無胃酸綜合征或血管活性腸肽瘤、胃泌素瘤。
5、腫瘤性疾病：胃腸道惡性淋巴瘤、類癌綜合綜合征、結(jié)腸癌、腸道腺瘤性息肉或息肉病。
6、胃腸道功能障礙性疾?。耗c易激綜合征包括黏液性結(jié)腸炎、易激惹結(jié)腸或過敏性結(jié)腸炎。
7、其他因素：腸道菌群失調(diào)、尿毒癥。
