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《國家稅務總局關于印發(fā)<跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法>的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號）第二條規(guī)定：居民企業(yè)在中國境內跨地區(qū)（指跨省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市，下同）設立不具有法人資格分支機構的，該居民企業(yè)為跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)（無論是否獨立核算），除另有規(guī)定外，其企業(yè)所得稅征收管理適用本辦法。
統(tǒng)一計算，分級管理，就地預繳，匯總清算，財政調庫。
一、只設跨地區(qū)項目部的建筑企業(yè)
跨地區(qū)項目部預繳稅款：應按項目實際經(jīng)營收入的0.2%按月或按季由總機構向項目所在地預分企業(yè)所得稅，并由項目部向所在地主管稅務機關預繳（只限于跨省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市設立的項目部。如果是非跨省的異地施工，國家并沒有規(guī)定要預繳企業(yè)所得稅）。
總機構預繳稅款：扣除已由項目部預繳的企業(yè)所得稅后，按照其余額在機構所在地預繳。
二、只設二級分支機構的建筑企業(yè)
二級分支機構分攤預繳稅款：總機構在每月或每季終了之日起十日內，按照上年度各省市分支機構的營業(yè)收入、職工薪酬和資產(chǎn)總額三個因素，將統(tǒng)一計算的企業(yè)當期應納稅額的50％在各分支機構之間進行分攤（總機構所在省市同時設有分支機構的，同樣按三個因素分攤），各分支機構根據(jù)分攤稅款就地辦理繳庫。分攤時三個因素權重依次為0.35、0.35和0.3。
所有分支機構應分攤的預繳總額=統(tǒng)一計算的企業(yè)當期應納所得稅額×50％
各分支機構分攤預繳額=所有分支機構應分攤的預繳總額×該分支機構分攤比例。
該分支機構分攤比例=（該分支機構營業(yè)收入／各分支機構營業(yè)收入之和）×0.35+（該分支機構職工薪酬／各分支機構職工薪酬之和）×0.35+（該分支機構資產(chǎn)總額／各分支機構資產(chǎn)總額之和）×0.30
注：建筑企業(yè)所屬二級或二級以下分支機構直接管理的項目部（包括與項目部性質相同的工程指揮部、合同段等，下同）不就地預繳企業(yè)所得稅，其經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額應匯總到二級分支機構統(tǒng)一核算。
總機構預繳稅款：就地預繳稅款。
總機構應預繳總額=統(tǒng)一計算的企業(yè)當期應納稅額×50％
三、既設直管跨地區(qū)項目部又設跨地區(qū)二級分支機構的建筑企業(yè)
總機構先扣除已由項目部預繳的企業(yè)所得稅后，再按照“只設二級分支機構”方法計算總、分支機構應繳納的稅款?？倷C構、項目部、各分支機構在各自所在地就地預繳稅款。
四、以下二級分支機構不就地分攤繳納企業(yè)所得稅：
（一）不具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能，且在當?shù)夭焕U納增值稅、營業(yè)稅的產(chǎn)品售后服務、內部研發(fā)、倉儲等匯總納稅企業(yè)內部輔助性的二級分支機構，不就地分攤繳納企業(yè)所得稅。
（二）上年度認定為小型微利企業(yè)的，其二級分支機構不就地分攤繳納企業(yè)所得稅。
（三）新設立的二級分支機構，設立當年不就地分攤繳納企業(yè)所得稅。
（四）當年撤銷的二級分支機構，自辦理注銷稅務登記之日所屬企業(yè)所得稅預繳期間起，不就地分攤繳納企業(yè)所得稅。
（五）匯總納稅企業(yè)在中國境外設立的不具有法人資格的二級分支機構，不就地分攤繳納企業(yè)所得稅。
建筑企業(yè)總機構應按照有關規(guī)定辦理企業(yè)所得稅年度匯算清繳，各分支機構和項目部不進行匯算清繳?？倷C構年終匯算清繳后應納所得稅額小于已預繳的稅款時，由總機構主管稅務機關辦理退稅或抵扣以后年度的應繳企業(yè)所得稅。
總機構預繳和匯算清繳時，除正常報送匯算清繳相關資料外，還應附送其所直接管理的跨地區(qū)經(jīng)營項目部就地預繳稅款的完稅證明。
總機構應將其所有二級及以下分支機構信息報其所在地主管稅務機關備案，內容包括分支機構名稱、層級、地址、郵編、納稅人識別號及企業(yè)所得稅主管稅務機關名稱、地址和郵編。
分支機構應將其總機構、上級分支機構和下屬分支機構信息報其所在地主管稅務機關備案，內容包括總機構、上級機構和下屬分支機構名稱、層級、地址、郵編、納稅人識別號及企業(yè)所得稅主管稅務機關名稱、地址和郵編。
一、總機構
若下屬的分支機構有一家（含）以上需要就地繳納企業(yè)所得稅的，總機構在申報企業(yè)所得稅報表時，申報系統(tǒng)會自動將其“企業(yè)類型”勾選為“跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)總機構”，除填報一般報表外，還需填報《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)年度分攤企業(yè)所得稅明細表》（年報適用）、《企業(yè)所得稅匯總納稅分支機構所得稅分配表》（年報和預繳申報表均適用）。
若所有分支機構均無需就地繳納企業(yè)所得稅，則總機構在申報時系統(tǒng)會自動將其“企業(yè)類型”勾選為“一般企業(yè)”，申報要求與一般企業(yè)相同，無需填寫《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)年度分攤企業(yè)所得稅明細表》和《企業(yè)所得稅匯總納稅分支機構所得稅分配表》。
建筑企業(yè)總機構在辦理企業(yè)所得稅預繳申報時，應附送其所直接管理的跨地區(qū)經(jīng)營項目部就地預繳稅款的完稅證明，由主管稅務機關進行預繳稅款臺賬維護，再將分支機構已預繳的稅款在主表第14行“特定業(yè)務預繳（征）所得稅額”填報相關數(shù)據(jù)。
二、分支機構
自2018年二季度起，分支機構申報企業(yè)所得稅報表時無需填報《企業(yè)所得稅匯總納稅分支機構所得稅分配表》，僅需填報主表第20行“分支機構本期分攤比例”和21行“分支機構本期分攤應補（退）所得稅額”。
若所屬總機構在省內（不含寧波），則這兩行數(shù)據(jù)由系統(tǒng)根據(jù)總機構填報的分配表信息自動取數(shù)；若所屬總機構在省外或寧波，則這兩行數(shù)據(jù)由分支機構自行填寫。
以總機構名義進行生產(chǎn)經(jīng)營的非法人分支機構，若無法提供匯總納稅企業(yè)分支機構所得稅分配表，也無法提供相關證據(jù)證明其二級及以下分支機構身份的，應視同獨立納稅人計算并就地繳納企業(yè)所得稅。其獨立納稅人身份一個年度內不得變更。
證明其二級及以下分支機構身份的資料包括非法人營業(yè)執(zhí)照（或登記證書）的復印件、由總機構出具的二級及以下分支機構的有效證明和支持有效證明的相關材料（包括總機構撥款證明、總分機構協(xié)議或合同、公司章程、管理制度等）。
1、關于印發(fā)《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法》的公告（國家稅務總局公告2012年第57號）
2、關于印發(fā)《跨省市總分機構企業(yè)所得稅分配及預算管理辦法》的通知 （財預[2012]40號）
3、關于建筑企業(yè)所得稅征管有關問題的通知（國稅函〔2010〕39號）
4、關于跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)所得稅征收管理問題的通知（國稅函[2010]156號）
