免费视频淫片aa毛片_日韩高清在线亚洲专区vr_日韩大片免费观看视频播放_亚洲欧美国产精品完整版

打開APP
userphoto
未登錄

開通VIP，暢享免費(fèi)電子書等14項(xiàng)超值服

開通VIP

首頁

好書

留言交流

下載APP

聯(lián)系客服
『銳幫讀』宏基因組研究土壤的生物降解潛能
Forest harvesting reduces the soil metagenomic potential for biomass decomposition
The ISME Journal , 2015, IF=9.302


土壤是維持森林生產(chǎn)能力的關(guān)鍵資源，其中土壤微生物可調(diào)節(jié)諸多重要的生態(tài)功能，近年研究發(fā)現(xiàn)砍伐森林對(duì)土壤群落構(gòu)成影響很大。一個(gè)長期的關(guān)于土壤微生物的研究在英國哥倫比亞松柏森林中開展，該研究對(duì)21個(gè)森林土壤樣品進(jìn)行了宏基因組測序。
材料與方法
四種處理?xiàng)l件的土壤樣品，沒有森林砍伐（OM0），莖被砍伐，只剩下根冠和分枝（OM1），整個(gè)樹被砍伐（OM2），整個(gè)樹被砍伐后無有機(jī)土壤層（OM3）。OM0-OM2三個(gè)地方分別取有機(jī)層表層和礦質(zhì)層上方20cm土壤樣品，OM3只取礦質(zhì)層上方20cm樣品，各3個(gè)生物學(xué)重復(fù)，共21個(gè)樣品，進(jìn)行宏基因組測序。
Illumna Hiseq2000, PE75bp測序平臺(tái)，共得到187Gb數(shù)據(jù)量。
圖1 4種土壤樣品的取樣示意圖
研究結(jié)果
1)森林砍伐后12年后，土壤有機(jī)層和礦質(zhì)層生物質(zhì)降解基因的相對(duì)豐度分別下降16%和8%
2)有機(jī)層和礦質(zhì)層在生物降解的遺傳潛能上是顯著不同的，有機(jī)層更易受砍伐的影響。
3)基因家族不成比例地受到森林砍伐的影響，其中有41個(gè)基因家族一致性受砍伐影響，包括與木質(zhì)素、纖維素、半纖維素及果膠相關(guān)的基因家族。
圖2 森林砍伐處理對(duì)CAZy基因家族的影響效果
圖3 CAZy基因家族的變異分析
圖4 不同土壤層預(yù)測基因家族的分布
結(jié)論
砍伐森林極大地改變了對(duì)森林再生起重要作用的地下碳和其他營養(yǎng)，因此，確定這些變化是預(yù)示森林生產(chǎn)力和應(yīng)變能力的長期變化還是砍伐森林得到的廣泛特征，顯得非常重要。
亮點(diǎn)
1）取樣比較全面，分4種處理，且設(shè)置了多個(gè)重復(fù)，結(jié)果具有說服力；
2）以基因家族為主線進(jìn)行相關(guān)分析，思路清晰；
3）采用了比較前沿的宏基因組方法進(jìn)行了測序，不僅可以分析物種的豐度和差異，還可以關(guān)注基因及參與的代謝通路，使研究更加深入。
銳翌基因服務(wù)
宏基因組測序用的是最新的Illumina Hiseq平臺(tái)，對(duì)宏基因組測序我們具有以下優(yōu)勢：
·全面的研究方案：對(duì)測序結(jié)果組裝分析后，得到微生物群體基因組及功能、分析微生物群體中物種和基因的多樣性和豐度，微生物菌落結(jié)構(gòu)與宿主（或環(huán)境）之間的相互關(guān)系等。
·更合理的研究方法：在分析過程中，采用一些更為準(zhǔn)確的方法，從而得到更為可靠的分析結(jié)果。
·新的分析方法：增加了最前沿的MGS等宏基因組分析的方法，對(duì)樣品中的信息得到更大的解析。
供稿：劉婉輝
編輯：黃蓉



本站僅提供存儲(chǔ)服務(wù)，所有內(nèi)容均由用戶發(fā)布，如發(fā)現(xiàn)有害或侵權(quán)內(nèi)容，請(qǐng)點(diǎn)擊舉報(bào)。
打開APP，閱讀全文并永久保存 查看更多類似文章
猜你喜歡
類似文章
宏基因組學(xué)研究在塑料生物降解方面的應(yīng)用前景
SBB | 森林生態(tài)系統(tǒng)恢復(fù)過程中土壤宏基因組內(nèi)微生物功能基因的變化
塑料降解基因來了
一作解讀Microbiome：多維宏組學(xué)揭示復(fù)雜細(xì)菌群落間的相互關(guān)系
華南師大王璋、廣東省中醫(yī)院黃清春、黃閏月等揭示痛風(fēng)患者腸道菌群特征
宏基因組學(xué)[宏基因組學(xué)]
更多類似文章 >>
生活服務(wù)
分享 收藏 導(dǎo)長圖 關(guān)注 下載文章
綁定賬號(hào)成功
后續(xù)可登錄賬號(hào)暢享VIP特權(quán)！
如果VIP功能使用有故障，
可點(diǎn)擊這里聯(lián)系客服！

聯(lián)系客服