鄧老對中西醫(yī)結(jié)合的看法是一貫的，不因政治氣候和形勢的低谷、高潮而改變，堅持原則，而不見風使舵。他的主要見解是：
毛主席和周總理的中西醫(yī)結(jié)合的思想是正確的，它需要我國中、西醫(yī)的長期共同努力，最后在理論高度上結(jié)合起來，才能建立起有中國特色的醫(yī)學。只有積以時日，融會貫通，才能達到水到渠成；切戒急于求成，搞簡單的“湊合”。
實現(xiàn)中西醫(yī)結(jié)合的關(guān)鍵不在于“西醫(yī)學習中醫(yī)”，要求全體西醫(yī)學習中醫(yī)是不現(xiàn)實的，也是不可能的。需要重視中醫(yī)隊伍的發(fā)展建設(shè)，國家在政策上要給以重視和傾斜，通過中醫(yī)學的繼承和發(fā)揚把中醫(yī)傳統(tǒng)的特色保留繼承下來，通過現(xiàn)代化不斷提高，與現(xiàn)代科學包括現(xiàn)代醫(yī)學結(jié)合起來，發(fā)展創(chuàng)新，才能實現(xiàn)中西醫(yī)結(jié)合的理想。
中醫(yī)和西醫(yī)兩種醫(yī)學都要發(fā)展，只有在高層次上的結(jié)合才能創(chuàng)造有特色的中國醫(yī)學，說中醫(yī)學和西醫(yī)學是兩種醫(yī)學體系不能結(jié)合是錯誤的。
西醫(yī)學習中醫(yī)的科研成果應當肯定，“西學中”隊伍是一支重要力量，不容忽視，應該發(fā)展。他們過去在經(jīng)絡(luò)研究、針麻研究、小夾板固定治療骨折、急腹癥非手術(shù)治療等方面所取得的成果不容否定，應該支持他們發(fā)展。對西醫(yī)學習中醫(yī)，實行中西醫(yī)結(jié)合應該鼓勵。
中醫(yī)院的建設(shè)思想。他認為中醫(yī)院要有一流的中醫(yī)，也要有一流的西醫(yī)。就是說要把中醫(yī)院建設(shè)成“西醫(yī)院有的我也有；西醫(yī)院沒有的我也有”，要突出中醫(yī)的特色。現(xiàn)在廣州中醫(yī)藥大學的附屬醫(yī)院都是按照這種思想建設(shè)的。如對廣東省中醫(yī)院，鄧師首先要求中醫(yī)骨干們認真溫課，進而穿針引線地邀請全國名老中醫(yī)十余人來院，讓骨干們向其拜師學習，繼承名老中醫(yī)們的學術(shù)；此外，還倡導、組織這些骨干外出學習中醫(yī)、西醫(yī)，使他們成為拔尖的人才。
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鄧師還認為西醫(yī)的發(fā)展、新手術(shù)的開展為中醫(yī)提供了新的展現(xiàn)才華的舞臺，是自古以來中醫(yī)所未有，是與時俱進的產(chǎn)物。例如，西醫(yī)對冠心病心肌梗死的搶救用搭橋、放支架等手術(shù)，在圍手術(shù)期、手術(shù)后，中醫(yī)大有用武之地，改善癥狀、防止粘連、消除血流動力學和血液流變學的病理改變，中醫(yī)都能派上好用場。鄧師曾作為廣州中醫(yī)藥大學第二附屬醫(yī)院廣東省中醫(yī)院心臟科帶頭人，這方面進行了深入研究，并已取得成果。
在中西醫(yī)結(jié)合中創(chuàng)新。中醫(yī)在幾千年的實踐中積累了豐富的經(jīng)驗，可以運用其理論與辨證方法處理許多未識的疾病。2003年SARS突然襲來廣東，在西醫(yī)與中醫(yī)，都屬于未識之病，西醫(yī)在病源學不明確的條件下無法突出對因治療，中醫(yī)則按溫病的衛(wèi)氣營血、三焦辨證治療，中西醫(yī)結(jié)合，取得了很好的療效。鄧師在廣東抗擊SARS中出謀劃策，認為是春溫伏濕，歲時濕熱太甚。幫助二附院制定辨證治療方案，分早、中、極、恢復四期，九個型，以十個基本方治療。他還在二線指導重癥病人救治，對赴港援助抗擊SARS的專家進行遠程指導，付出了很大的精力。并上書黨中央、國務院，建議全國中醫(yī)應盡早介入SARS的治療。他認為對SARS的抗擊說明了中西醫(yī)學結(jié)合的必要性和可能性；也說明中醫(yī)只有在學術(shù)上具有良好的水平和豐富的臨床經(jīng)驗才能介入其中，取得療效和創(chuàng)新的經(jīng)驗。中國香港醫(yī)館局的統(tǒng)計學處理認為中西醫(yī)結(jié)合治療SARS，可以改善癥狀，縮短住院天數(shù)，減少類固醇使用量和天數(shù)。當年WHO公布的SARS死亡率（%）全球13%～14%，中國香港17%，中國臺灣11%，中國大陸是6.6%（60%中醫(yī)介入），其中廣東為5.1%，最低。
