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基于機(jī)器學(xué)習(xí)的情緒障礙診斷:功能網(wǎng)絡(luò)預(yù)測藥物反應(yīng)

來自倫敦健康科學(xué)中心勞森健康研究所(Lawson Health Research Institute, London HealthSciences Centre)的Osuch E等研究人員在Acta Psychiatrica ScandinavicaAPS)期刊上發(fā)表了基于功能磁共振成像(fMRI)的情感障礙患者的分類和預(yù)測的相關(guān)研究。結(jié)果表明,他們提出的分類算法能夠?qū)η楦姓系K患者進(jìn)行較好的診斷,并且對復(fù)雜患者的藥物反應(yīng)進(jìn)行準(zhǔn)確預(yù)測。

本研究采集了99名受試者的功能磁共振數(shù)據(jù)。其中,受試者被分為雙相障礙患者(bipolar disorder, BD)、重度抑郁癥患者(major depressive disorder, MDD)和健康被試。其次,本研究采用已確診的受試者對模型進(jìn)行訓(xùn)練和驗(yàn)證。其主要步驟包括:提取了最大空間獨(dú)立成分、構(gòu)建了受試者之間的相似矩陣、核空間劃分(kernel space)相似矩陣、優(yōu)化支持向量機(jī)(Support Vector Machine, SVM)分類器和獨(dú)立成分組合。最后,本研究將訓(xùn)練好的分類器應(yīng)用到12名已確診的情緒障礙患者。結(jié)果表明,本研究提出的算法對已確診患者的分類正確率高達(dá)92.4%,并確定了最優(yōu)的5個獨(dú)立成分組合。此外,本研究將此分類模型應(yīng)用于12例未確診的情感障礙患者,其分類準(zhǔn)確率高達(dá)92%。

關(guān)鍵字:功能磁共振成像(fMRI)、獨(dú)立成分分析、支持向量機(jī)、雙相情感障礙、抑郁癥

被試招募

99名(年齡16-27歲)受試者,包括32名雙相情感障礙I型(Bipolar Disorder type I, BD-I)患者、34名重度抑郁癥(Major Depressive Disorder, MDD)患者和33名健康受試者(Healthy Control, HC)。其中,BDMDD患者由First Episode Mood and Anxiety Program (FEMAP)和倫敦健康中心進(jìn)行招募。所有病人均通過 Structured Clinical Interview for DSM disorders-IV (SCID-IV)theDiagnostic Interview for Genetic Studies (DIGS)診斷并經(jīng)過臨床精神病學(xué)診斷與評估。同時(shí),本研究中存在12名未能確診的患者(unknown, UNK)。此外,所有病人治療藥物被簡化為抗抑郁癥類(antidepressants,AD)和情緒穩(wěn)定(mood stabilizersMS)兩類。

數(shù)據(jù)采集與處理

本研究對所有受試者進(jìn)行了磁共振成像掃描,采集了T1加權(quán)MRIfMRI功能影像。其中,BDMDD患者在掃描前的3周服用藥物維持不變,同時(shí)掃描期間情緒正常(sustained euthymia)。本研究采用SPM工具包進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理,其步驟主要包括前10個時(shí)間點(diǎn)去除、時(shí)間層校正、頭動校正、分割、空間標(biāo)準(zhǔn)化和空間平滑。

基于先前的分類方法,本研究改進(jìn)了分類算法。其主要包括四個部分:(1)基于fMRI數(shù)據(jù)估計(jì)空間獨(dú)立成分(Independent Components, ICs);(2)基于sigmoid核函數(shù)構(gòu)建被試間相似性矩陣;

3)在核空間對相似性矩陣進(jìn)行劃分;

4)嵌套交叉驗(yàn)證支持向量機(jī)(support vector machine, SVM)分類器的構(gòu)建和獨(dú)立成分組合的優(yōu)化。詳細(xì)如圖1所示。

1. 分類器構(gòu)建框架

1.     基于fMRI數(shù)據(jù)估計(jì)空間獨(dú)立成分(independent components, ICs):本研究在BD、MDDHC三組上采用了組信息引導(dǎo)的獨(dú)立成分分析(Group information guided ICA, GIG-ICA)方法分解了20個獨(dú)立成分.

2.     基于sigmoid核構(gòu)建被試間相似性矩陣:為探討?yīng)毩⒊煞值慕M合以提高分類正確率,本研究構(gòu)建了由判別成分組合張成的子空間,并在此基礎(chǔ)上計(jì)算了被試成分之間的黎曼相似度/距離測度。如圖1.a所示

3.     采用SVM分類器進(jìn)行前向成分選擇(Forward component selection):已確診的BDMDD的分類器的嵌套交叉驗(yàn)證如圖1.a所示,未確診的UNK受試的分類器的測試如圖1.b所示。本研究采用步進(jìn)式(step-wise)前向特征選擇的方法對成分進(jìn)行選擇和組合優(yōu)化。最后,本研究基于已確診的BDMDD100個最優(yōu)獨(dú)立成分組合構(gòu)建了具有900個投票的分類器。

4.     未知標(biāo)簽的被試分類:本研究采用訓(xùn)練好的分類器對未確診的UNK患者進(jìn)行投票以便確定每個UNK患者的標(biāo)簽。

研究結(jié)果

BD、MDDHC受試者的人口統(tǒng)計(jì)學(xué)信息如表1所示。雖然三組受試者無性別差異,BD患者的年齡大于MDD患者,但本研究采用MANCOVA統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)在性別和年齡未發(fā)現(xiàn)顯著的差異。另外,研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)在每個IC上回歸人口統(tǒng)計(jì)信息協(xié)變量和未回歸協(xié)變量的結(jié)果表現(xiàn)相同。

為說明了人口統(tǒng)計(jì)信息的影響,本研究僅基于年齡和性別采用相同參數(shù)的SVM分類器對BDMDD患者進(jìn)行了分類。其中正確率為49.32%、敏感性為89.19%和特異性為8.33%。

已確診的HCBDMDD的分類

針對BDMDD的分類,本研究訓(xùn)練的分類器對不同數(shù)目的IC分類正確率均保持在84%以上。其中,最好的分類正確率為92.4%,敏感性87.5%和特異性97.1%,同時(shí)該分類器包含了5個獨(dú)立成分。本研究訓(xùn)練的分類器在BDHC間的分類精度為91.4%,在MDDHC間的分類精度為94.2%。同時(shí),與以前的方法相比,本研究在模型精確度和耗時(shí)方面均有所提高。其中,本研究每個10折交叉僅耗時(shí)39.8小時(shí),以前的方法則需耗時(shí)143.1小時(shí)。如圖2a所示。

已知的BDMDD組之間的判別成分

本研究中在1010折交叉驗(yàn)證中存在100種獨(dú)立成分的組合。圖2b中展示了最優(yōu)組合中20個成分出現(xiàn)的頻率。本研究選擇了5個成分(116、16、1、2,如圖2c所示)作為最具有判別能力的功能網(wǎng)絡(luò)來區(qū)分BDMDD。上述5個成分主要包含了背側(cè)注意網(wǎng)絡(luò)、默認(rèn)網(wǎng)絡(luò)、額頂中心執(zhí)行網(wǎng)絡(luò)和突顯網(wǎng)絡(luò),同時(shí)也包含了尾狀核、腦島和丘腦。

2. 分類結(jié)果

未確診UNK患者的分類

12UNK受試者的BD vs. MDD的投票比例和分類器預(yù)測結(jié)果、掃描期間和情緒正常(sustained euthymia)狀態(tài)下的臨床診斷和藥物類別(medication-classes)和其他變量如表2所示。在本研究提出的具有二分類的SVM的診斷預(yù)測模型中,每個UNK受試者都被假定為BDMDD患者。具體的病例信息和介紹可參考原文?;谑茉囌叩乃幬锓磻?yīng),本研究提出的算法對12個受試者中的11個預(yù)測分類是正確的。值得注意的是,該算法以患者對藥物反應(yīng)為金標(biāo)準(zhǔn)(gold standard)。其中,該算法對5名腦功能更像BD的患者(具有MS藥物反應(yīng))和2名腦功能更像MDD的患者(具有AD藥物反應(yīng))進(jìn)行了正確的分類。同時(shí),該算法對4名腦功能更像MDD的患者(未服用藥物且情緒正常)進(jìn)行保守的分類。此外,本研究對1名患有精神分裂障礙和腦功能更像MDD患者(對MSAP藥物有反應(yīng),而對AD藥物未有反應(yīng))進(jìn)行了錯誤分類。

2. 分類器投票、DIGS情緒診斷、臨床診斷和藥物類別信息

本研究基于fMRI提出了針對情感障礙的機(jī)器分類算法。該算法對確診的雙相障礙患者(BD)和重度抑郁癥患者(MDD)能夠進(jìn)行較好的區(qū)分(正確率高達(dá)92.4%)。同時(shí),本研究對未確診的復(fù)雜患者也能正確分類(12名患者中11名正確分類)。結(jié)果表明本研究提出的算法對于復(fù)雜情感障礙的患者的診斷具有臨床價(jià)值。

參考文獻(xiàn):Osuch E, Gao S, Wammes M, et al. Complexity in mood disorder diagnosis:fMRI connectivity networks predicted medication‐class of response in complexpatients[J]. Acta Psychiatrica Scandinavica, 2018, 138(5): 472-482

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