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產(chǎn)品|021期-PCR實驗室的污染來源及控制策略

來源:IVD從業(yè)者

作者:鎖炎

PCR技術(shù)是一種體外模擬DNA復(fù)制過程的核酸擴(kuò)增技術(shù),主要通過重復(fù)高溫變性、低溫退火和延伸三個循環(huán),然后將靶DNA擴(kuò)增數(shù)百萬倍,因此PCR技術(shù)的優(yōu)勢就是極高的靈敏度,但是任何事物都有其兩面性,PCR技術(shù)最大的一個缺點就是—易污染,極其微量的污染都有可能導(dǎo)致假陽性的產(chǎn)生。
一旦發(fā)生實驗室核酸污染,正常開展的實驗就必須要停止,然后花費大量物力、人力直到尋找污染源,或者實驗室清潔達(dá)標(biāo)為止,而且實驗報告結(jié)果必須作廢,需重新實驗,結(jié)果才可靠。
為了有效的避免污染,獲得穩(wěn)定可靠的檢驗結(jié)果,我們在實際的工作當(dāng)中往往需要采用一定的措施來預(yù)防或者消除污染。

污染的來源

(1)試劑污染

由于在PCR試劑配制過程中,由于加樣器、容器、水及其他溶液被核酸污染。

(2)設(shè)備污染

半自動核酸提取儀、全自動核酸提取儀在提取過程導(dǎo)致濺灑樣本或者核酸模板,污染機(jī)器?;蛘咴O(shè)備內(nèi)垃圾筒清潔不徹底,殘留液體或結(jié)晶揮發(fā)形成氣溶膠對造成污染。

(3)標(biāo)本交叉污染

可能是由于收集標(biāo)本的容器被污染,標(biāo)本放置時由于密封不嚴(yán)溢于容器外,容器外黏有標(biāo)本,吸樣器污染及空氣中的氣溶膠導(dǎo)致的標(biāo)本間交叉污染。尤其是病毒類可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴(kuò)散,導(dǎo)致彼此間的污染。

(4)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染

這是PCR中最常見的污染問題,常見于需要在擴(kuò)增后開蓋的檢測項目,或者是擴(kuò)增后產(chǎn)物處理不當(dāng),因為PCR產(chǎn)物拷貝量大,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于PCR檢測數(shù)個拷貝的極限,所以極微量的PCR產(chǎn)物污染就可形成假陽性。

(5)克隆質(zhì)粒的污染

在實驗室操作中經(jīng)常會用到陽性參考品,這些陽性參考品大多數(shù)是由某些用克隆質(zhì)粒制作而成,克隆質(zhì)粒在單位容積內(nèi)濃度高,不小心使用極易造成污染。

有些實驗室自己克隆質(zhì)粒做質(zhì)控品,配制過程后,垃圾的處理方式不嚴(yán)格等,從而造成質(zhì)控品對實驗室的污染進(jìn)而造成實驗室對標(biāo)本的污染。

控制污染的措施

(1)實驗分區(qū)域

合理分隔實驗室。將樣品的處理、配制PCR反應(yīng)液、PCR循環(huán)擴(kuò)增及PCR產(chǎn)物的鑒定等步驟分區(qū)或分室進(jìn)行,特別注意標(biāo)本處理及PCR產(chǎn)物的鑒定應(yīng)與其他步驟嚴(yán)格分開。

最好能劃分:標(biāo)本處理區(qū),PCR反應(yīng)液制備區(qū),PCR循環(huán)擴(kuò)增區(qū),PCR產(chǎn)物鑒定區(qū)。其實驗用品及吸樣槍應(yīng)專用。

實驗前應(yīng)將實驗室用紫外線消毒以破壞殘留的 DNA 或RNA.

(2) 各區(qū)物品不得混用

各個實驗區(qū)域要對不同設(shè)備、物品顏色有明顯的標(biāo)記,如各區(qū)域使用專門的工作服、工作鞋、垃圾桶、拖把、抹布、筆等,避免不同工作區(qū)域內(nèi)的設(shè)備、物品混用。

使用一次性用具吸頭、離心管、無粉塵手套、口罩等

(3)設(shè)置規(guī)范的空調(diào)通風(fēng)系統(tǒng)

盡可能采用全送全排空調(diào)系統(tǒng)。在進(jìn)入各個操作區(qū)域需要嚴(yán)格單一流向進(jìn)行,即試劑準(zhǔn)備和貯存區(qū)→樣品制備區(qū)→PCR擴(kuò)增區(qū)→擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū),不得逆行。

(4)污染監(jiān)測

設(shè)立陽性對照、陰性對照,進(jìn)行重復(fù)試驗,選擇不相同區(qū)域的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增等,做好污染監(jiān)測,以便采取措施防止和消除污染。

(5)定期實驗室清潔

配制含有效氯 0.5% 的消毒液對設(shè)備表面、臺面、地面、物品表面、傳遞窗內(nèi)及門窗進(jìn)行擦拭,對設(shè)備內(nèi)垃圾桶進(jìn)行浸泡。

根據(jù)從上到下、從里到外的原則進(jìn)行酒精對空噴灑。

酒精擦拭(75%)移液器、八連管離心機(jī)、混勻振蕩器等小型設(shè)備。

純化水對設(shè)備表面、臺面、地面進(jìn)行擦拭,對設(shè)備垃圾桶進(jìn)行沖洗。

》》》》》文中圖片引自 pixabay.com

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