上周我們公布了，蛋白質(zhì)組學(xué)習(xí)小組起飛啦！ 短短幾天就獲得了200多小伙伴的支持，讓我們也更有信心的帶領(lǐng)大家掌握一個蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)處理的實戰(zhàn)，我們第2期學(xué)習(xí)內(nèi)容是認(rèn)識一下蛋白質(zhì)組學(xué)的原始數(shù)據(jù)
第一期
《The Primary Effect on the Proteome of ARID1A-mutated Ovarian Clear Cell Carcinoma is Downregulation of the Mevalonate Pathway at the Post-transcriptional Level》
理清文章思路
總結(jié)蛋白質(zhì)組學(xué)部分的流程
標(biāo)出所用的軟件及需要下載的內(nèi)容
網(wǎng)址：https://www.maxquant.org/
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文中描述
(http://proteomecentral.proteomexchange.org)在搜索框輸入 ID號 PXD004570
出現(xiàn)文章信息
Database FTP location
raw 一共12個質(zhì)譜原始文件全部下載。
友情提示：
數(shù)據(jù)量稍微有一點大，如果你是個人電腦，建議跳過前面3個原始數(shù)據(jù)處理的步驟，直接從第5講開始跟著練習(xí)，或者你可以考慮配置生物信息學(xué)數(shù)據(jù)處理服務(wù)器：72核心、72GB內(nèi)存服務(wù)器集群（不到1000美元）
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