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一文匯總│ 分子檢測(cè)在消化道腫瘤全面開花(上)

導(dǎo)讀
2019年國(guó)家癌癥中心發(fā)布的數(shù)據(jù)報(bào)告顯示,排在中國(guó)前5位的癌種為:肺癌、胃癌、肝癌、食管癌和結(jié)直腸癌。除肺癌外,其余四種都屬于消化系統(tǒng)腫瘤,約占所有因癌癥死亡人數(shù)的四分之三。另外,消化道腫瘤的早期篩查困難,約85%患者在確診時(shí)已經(jīng)處于中晚期,生存率僅為36%。需要注意的是消化道腫瘤臨床治療中整體治療進(jìn)展緩慢,缺乏有效的生物標(biāo)志物輔助篩查、診斷、預(yù)測(cè)療效和預(yù)后。近年來隨著NGS測(cè)序技術(shù)的不斷進(jìn)步,分子檢測(cè)飛速改變了腫瘤的的診療格局。消化道腫瘤是否能順應(yīng)當(dāng)下的趨勢(shì),真正實(shí)現(xiàn)個(gè)體化精準(zhǔn)診療了呢?今天有幸邀請(qǐng)到上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬龍華醫(yī)院錢建新副主任醫(yī)師一起來聊一聊,分子檢測(cè)在消化道腫瘤精準(zhǔn)診療(尤其是早篩和預(yù)后監(jiān)測(cè))中的那些事。而分子檢測(cè)在消化道腫瘤治療,尤其是靶向治療和免疫治療等方面的進(jìn)展會(huì)在下期推送文章中詳細(xì)闡述,不容錯(cuò)過哦。

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專家介紹

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早篩篇

消化道腫瘤如果能做到早診早治,5年生存率可達(dá)到90%以上。因此,如何做到更早更精準(zhǔn)的篩查腫瘤是如今臨床研究的熱點(diǎn)之一,也取得了一定的研究成果。目前最常用的篩查方式是通過內(nèi)窺鏡或者血清學(xué)生物標(biāo)志物進(jìn)行診斷,但敏感性/特異性不高,現(xiàn)今的研究方向主要是開發(fā)非入侵性的精準(zhǔn)早篩手段。而循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA),循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)或循環(huán)microRNA(miRNA),正在補(bǔ)充和改進(jìn)目前的消化道腫瘤篩查和管理策略1。2017年徐瑞華團(tuán)隊(duì)通過ctDNA甲基化早期輔助診斷肝癌,敏感性在85%以上,特異性高達(dá)94.3%2。2019 CSCO大會(huì)上又報(bào)道了一項(xiàng)大樣本(N=16890)前瞻性研究的結(jié)果,驗(yàn)證了ctDNA甲基化用于早篩的價(jià)值。應(yīng)用ctDNA甲基化進(jìn)行腸癌早篩,敏感性高達(dá)89.7%,準(zhǔn)確性遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于常規(guī)的標(biāo)志物,如CEA等。

Xu RH et al,2019 CSCO 
2019 ESMO報(bào)道了血清miRNA panel是一種有效的非侵入性胃癌篩查方式。通過RT-qPCR構(gòu)建12-miRNA胃癌早篩panel,納入4566位參與者(新加坡、韓國(guó))進(jìn)行效能分析,這些參與者均接受內(nèi)窺鏡檢查,其中125例確診為胃癌。結(jié)果發(fā)現(xiàn),miRNA在檢測(cè)早期(0-2期)和晚期(3-4期)胃癌中的敏感性為82.6%(95%Cl,68.6%-92.2%)和88.4%(95%Cl,78.4%-94.9%),特異性為70.0%(95%CI,67.8%-71.9%),顯著優(yōu)于(p<0.01)幽門螺桿菌(H.pylori,AUC 0.64)和胃蛋白酶原(PG,AUC 0.62)。同時(shí),使用miRNA作為預(yù)篩選工具可以減少62%的內(nèi)窺鏡檢查。

2019 ASCO 4065 Poster Session (Board #170)

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預(yù)后篇

療效和預(yù)后標(biāo)志物探索

通過檢測(cè)生物標(biāo)志物預(yù)測(cè)療效和預(yù)后也是消化道腫瘤研究領(lǐng)域的熱門。2019年ESMO大會(huì)上報(bào)道了一項(xiàng)結(jié)直腸癌大樣本(n=2334)臨床研究,探索貝伐單抗和西妥昔單抗治療結(jié)直腸癌患者療效和預(yù)后的生物標(biāo)志物。

入組患者經(jīng)過一線治療進(jìn)展,KRAS(Exon 12、13)野生型,接受化療聯(lián)合西妥昔單抗/貝伐珠單抗治療。NGS測(cè)序發(fā)現(xiàn)新的基因如LRP1B、SMAD4和ZNF103突變與患者預(yù)后不良相關(guān)(p<0.05),其中LRP1B基因突變的患者對(duì)貝伐珠單抗更敏感。而LRP1B, RNF43, FAT3 和 ARID1A 基因突變提示西妥昔單抗響應(yīng)性差。未來這些基因可能納入指導(dǎo)患者選擇最佳治療的生物標(biāo)志物。

轉(zhuǎn)移相關(guān)分子標(biāo)志物探索

原發(fā)性胃癌(GC)或胃食管連接癌(GEJ)的腹膜轉(zhuǎn)移(PM)預(yù)示預(yù)后不良,分子差異尚不確定。2019 ASCO公布的檢測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn),多個(gè)基因突變可能與GC/GEJ的轉(zhuǎn)移相關(guān)。通過對(duì)GC(N=707)和GEJ(N=325)腹膜轉(zhuǎn)移和其他轉(zhuǎn)移患者(OM)的基因組信息檢測(cè)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),與原發(fā)性胃癌相比,發(fā)生轉(zhuǎn)移的(腹膜或其他轉(zhuǎn)移)胃癌患者M(jìn)UTYH基因突變率更高,且發(fā)生腹膜轉(zhuǎn)移的患者更多出現(xiàn)CDH1突變。另外,PD-L1 CPS 1+(%),HER2 IHC和ERBB2 CNA在發(fā)生腹膜轉(zhuǎn)移的胃癌與原發(fā)性胃癌相比顯著降低。這些基因突變有助于提示腫瘤復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移,其臨床應(yīng)用價(jià)值還需更多研究證實(shí)。

2019 ASCO 4053 Poster Session (Board #158)

ctDNA監(jiān)測(cè)MRD和復(fù)發(fā)

2019年ESMO大會(huì)上報(bào)道了一項(xiàng)通過ctDNA動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)局部治療的結(jié)直腸癌微小殘留病灶(MRD)和復(fù)發(fā)的臨床試驗(yàn),研究納入150例I-III期結(jié)腸癌患者,中位隨訪近24.7個(gè)月,對(duì)150個(gè)組織樣本進(jìn)行靶向基因測(cè)序,同時(shí)收集了69個(gè)術(shù)后、55例接受輔助化療和95例未接受輔助化療的血漿樣本進(jìn)行動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),相對(duì)于監(jiān)測(cè)單個(gè)突變,同時(shí)監(jiān)測(cè)2個(gè)突變可顯著提高檢測(cè)MRD的檢出率。同時(shí),手術(shù)切除后ctDNA陽(yáng)性預(yù)示著MRD的出現(xiàn)和高的復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn),且比影像學(xué)預(yù)測(cè)復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)還要早11.5個(gè)月。輔助治療后檢測(cè)到ctDNA陽(yáng)性可能和標(biāo)準(zhǔn)治療耐藥相關(guān)。不難看出,ctDNA監(jiān)測(cè)對(duì)預(yù)測(cè)局部結(jié)腸癌MRD、術(shù)后復(fù)發(fā),輔助化療耐藥等具有重要的預(yù)后意義。

單個(gè)術(shù)后樣本(左)和連續(xù)采樣血漿樣本(右)

耐藥機(jī)制探索


除了監(jiān)測(cè)復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移之外,ctDNA在耐藥機(jī)制探索上也發(fā)揮著重要作用。2019年發(fā)表于Gut.雜志(IF 17.016)的一項(xiàng)研究3:通過ctDNA監(jiān)測(cè),探索HER2+胃癌應(yīng)用曲妥珠單抗的耐藥機(jī)制。對(duì)24例HER2+轉(zhuǎn)移性胃癌患者的97個(gè)血漿樣本進(jìn)行動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),與基線相比,多數(shù)對(duì)曲妥珠單抗原發(fā)性耐藥的患者在進(jìn)展期具有更高的HER2體細(xì)胞拷貝數(shù)變異(SCNA),而獲得性耐藥的患者HER2 SCNA水平較低。此外,PIK3CA突變?cè)谠l(fā)性耐藥患者中顯著富集,基線和進(jìn)展期血漿中分別有6例(35.3%)基線和5例(29.4%)攜帶ERBB2/4基因突變的患者對(duì)曲妥珠單抗耐藥?;€血漿中具有PIK3CA/R1/C3或ERBB2/4突變的患者具有顯著更差的PFS。這些差異的檢出可以推動(dòng)通過ctDNA進(jìn)行耐藥相關(guān)動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)的開發(fā),以期更早提示患者耐藥的出現(xiàn),從而及時(shí)更改治療策略。

Gut. 2019 Jul;68(7):1152-1161. 

專家點(diǎn)評(píng)

消化道腫瘤的地域性特別明顯,僅食管、胃、肝這幾個(gè)癌種在中國(guó)的發(fā)病人數(shù)超過了全球的一半。在個(gè)體化治療廣泛開展的今天,研究中國(guó)人群特有的分子特征,實(shí)現(xiàn)早篩早診和精準(zhǔn)分型,探索新的預(yù)測(cè)及預(yù)后生物標(biāo)志物,是近年來消化道領(lǐng)域的重要研究方向。據(jù)上海市腸癌百萬(wàn)人群篩查結(jié)果來看,66%的初篩陽(yáng)性人數(shù)拒絕腸鏡,而97%拒絕腸鏡檢查的人愿意接受無(wú)創(chuàng)篩查。而液體活檢基于其敏感性和特異性高、無(wú)創(chuàng)、取材方便等優(yōu)勢(shì),很大程度上解決了消化道腫瘤篩查的困境。基于NGS的飛速發(fā)展,分子檢測(cè)在消化道腫瘤早篩、輔助診斷和預(yù)后分子標(biāo)志物探索方面大展拳腳,發(fā)現(xiàn)了多個(gè)新的輔助診斷和復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移相關(guān)的生物標(biāo)志物,逐步實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)篩查和預(yù)后指導(dǎo)。

獻(xiàn)

1.Mol Aspects Med..2019 Oct;69:107-122.

2.Nat Rev Clin Oncol.2017 Apr;14(4):235-246.

3.Gut.2019 Jul;68(7):1152-1161.

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