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工業(yè)微生物菌種的分離與篩選

工業(yè)微生物菌種的分離與篩選

來源:青島海博

 

一、微生物工業(yè)對(duì)菌種的要求
(一)、微生物工業(yè)的生產(chǎn)水平由三個(gè)要素決定:生產(chǎn)菌種的性能、發(fā)酵及提純工藝條件、生產(chǎn)設(shè)備。其中生產(chǎn)菌種的性能是最重要的因素。
(二)、微生物工業(yè)對(duì)菌種的要求是:
(1)菌株高產(chǎn),在較短的時(shí)間內(nèi)發(fā)酵產(chǎn)生大量發(fā)酵產(chǎn)物的能力;
(2)在發(fā)酵過程中不產(chǎn)生或少產(chǎn)生與目標(biāo)產(chǎn)品相近的副產(chǎn)品及其他產(chǎn)物;
(3)生長(zhǎng)繁殖能力強(qiáng),較強(qiáng)的生長(zhǎng)速率,產(chǎn)孢子的菌種應(yīng)該具有較強(qiáng)的產(chǎn)孢子能力;
(4)能夠高效地將原理轉(zhuǎn)化為產(chǎn)品;
(5)能利用廣泛的原材料,并對(duì)發(fā)酵原料成分的波動(dòng)敏感性小;
(6)對(duì)需要添加的前體物質(zhì)有耐受能力,并且不能將這些前體物質(zhì)作為一般碳源利用;
(7)在發(fā)酵過程中產(chǎn)生的泡沫要少;
(8)具有抗噬菌體的能力;
(9)遺傳穩(wěn)定性,
 
二、工業(yè)用微生物菌種的來源及選育
(一)微生物菌種的來源
一般通過以下幾個(gè)途徑收集菌種、采集樣品和分離篩選:
(1)是根據(jù)資料直接向有科研單位、高等院校、工廠或菌種保藏部門索取或購買;
(2)從大自然中采集樣品分離;
(3)從一些發(fā)酵制品中分離篩選目的菌株。
當(dāng)前發(fā)酵工業(yè)所用菌種總趨勢(shì)是從野生菌轉(zhuǎn)向變異菌,自然選用轉(zhuǎn)向代謝育種,從誘發(fā)基因突變轉(zhuǎn)向基因重組的定向育種。
(二)微生物工業(yè)菌種的分離
1、野生菌株的分離、篩選過程
(1)新菌種分離與篩選的步驟
菌種分離的流程如下:
標(biāo)本采集 →標(biāo)本材料的預(yù)處理→富集培養(yǎng)→菌種初篩→ 菌種復(fù)篩→性能鑒定→ 菌種保藏
①采樣
采樣季節(jié):以溫度適中,雨量不多的秋初為好。
采土方式:在選好適當(dāng)?shù)攸c(diǎn)后,用小鏟子除去表土,取離地面5-15cm處的土約10g,盛入清潔的牛皮紙袋或塑料袋中,扎好,標(biāo)記,記錄采樣時(shí)間、地點(diǎn)、環(huán)境條件等,以備查考。為了使土樣中微生物的數(shù)量和類型盡少變化,宜將樣品逐步分批寄回,以便及時(shí)分離。
②標(biāo)本預(yù)處理
④純種分離:采用劃線分離法、稀釋分離法等純化方法獲取單菌落。
⑤高產(chǎn)菌株的篩選:這一步是采用與生產(chǎn)相近的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,通過三角瓶的容量進(jìn)行小型發(fā)酵試驗(yàn),獲得適合于工業(yè)生產(chǎn)用菌種。還要對(duì)菌種進(jìn)行發(fā)酵性能測(cè)定,
⑥毒性試驗(yàn):據(jù)有的國家規(guī)定,微生物中除啤酒酵母、脆壁酵母、黑曲霉、米曲霉和枯草桿菌作為食用無須作毒性試驗(yàn)外,其他微生物作為食用,均需通過兩年以上的毒性試驗(yàn)。
 
2、菌種的分離方法
(1)施加選擇性壓力分離法
主要是利用不同種類的微生物其生長(zhǎng)繁殖對(duì)環(huán)境和營(yíng)養(yǎng)的要求不同,如溫度、pH、滲透壓、氧氣、碳源、氮源等,人為控制這些條件,使之利于某類或某種微生物生長(zhǎng),而不利于其他種類微生物的生存,以達(dá)到使目的菌種占優(yōu)勢(shì).而得以快速分離純化的目的。如可以控制培養(yǎng)時(shí)的氧,可將好氧微生物和厭氧微生物分開;通過控制溫度,可將嗜熱微生物和非嗜熱微生物分開;控制pH,可將嗜酸、嗜堿微生物分離等。在分離培養(yǎng)基中也可以加入不同的抗生素或試劑來增加選擇性。如在分離放線菌和細(xì)菌時(shí),可加入抗真菌抗生素;分離真菌時(shí),可加入抗細(xì)菌藥物。
(2)隨機(jī)分離方法
有些微生物的產(chǎn)物對(duì)篩選沒有直接的選擇性指示作用,因此常采用隨機(jī)分離方法分離。
A、抗生素產(chǎn)生菌的分離
抗生素產(chǎn)生菌的分離常用抑菌圈法。實(shí)驗(yàn)必須用工具菌:采用抗生素的敏感菌,傳統(tǒng)上常用金黃色葡萄球菌和枯草桿菌。
B、抗腫瘤藥物產(chǎn)生菌的分離
抗腫瘤藥物產(chǎn)生菌的分離常用方法:生化誘導(dǎo)法、SOS生色檢測(cè)法、DNA修復(fù)能力突變株。原理是利用DNA的損傷,微生物發(fā)生突變。
B1、生化誘導(dǎo)法:將大腸桿菌的lacZ基因連接在λ噬菌體的PL啟動(dòng)子下,當(dāng)DNA損傷時(shí),誘發(fā)λ阻遏物CI分解,PL啟動(dòng)子啟動(dòng)lacZ基因轉(zhuǎn)錄,測(cè)定表達(dá)的ß-半乳糖苷酶活性,來檢測(cè)藥物的存在。
B2、SOS生色檢測(cè)法:利用當(dāng)DNA損傷時(shí),可活化yecA蛋白,進(jìn)而分解噬菌體的阻遏蛋白,再引起sifA基因啟動(dòng)lacZ基因轉(zhuǎn)錄,測(cè)定表達(dá)的ß-半乳糖苷酶活性,來檢測(cè)藥物的存在。
C、生長(zhǎng)因子產(chǎn)生菌的分離
以氨基酸產(chǎn)生菌為例,介紹篩選方法。首先將待試菌接入加了抗真菌的化合物(如亞胺環(huán)己酮)的分離培養(yǎng)基中生長(zhǎng),然后采用影印法,將菌落復(fù)印到能支持氨基酸產(chǎn)生菌生長(zhǎng)的培養(yǎng)基中,培養(yǎng)2-3天后,用紫外線殺司長(zhǎng)好的菌落,再往此平板上面鋪一層相應(yīng)營(yíng)養(yǎng)缺陷型菌株菌懸液,培養(yǎng)16小時(shí)后,被殺死的氨基酸產(chǎn)生菌的菌落周圍應(yīng)有一檢測(cè)菌的生長(zhǎng)圈。
(3)目的微生物分離
A、根據(jù)形態(tài)篩選突變株
B、根據(jù)平板菌落生化反應(yīng)篩選變株
透明圈法、呈色圈法、抑菌圈法、渾濁圈法等。
①透明圈法:在平板培養(yǎng)基中加入溶解性較差的底物,使培養(yǎng)基混濁。能分解底物的微生物便會(huì)在菌落周圍產(chǎn)生透明圈,圈的大小初步反應(yīng)該菌株利用底物的能力。該法在分離水解酶產(chǎn)生菌時(shí)采用較多,如脂肪酶、淀粉酶、蛋白酶、核酸酶產(chǎn)生菌都會(huì)在含有底物的選擇性培養(yǎng)基平板上形成肉眼可見的透明圈。
 
在分離某種產(chǎn)生有機(jī)酸的菌株時(shí),也通常采用透明圈法進(jìn)行初篩。在選擇性培養(yǎng)基中加入碳酸鈣,使平板成混狀,將樣品懸浮液涂抹到平板上進(jìn)行培養(yǎng),由于產(chǎn)生菌能夠把菌落周圍的碳酸鈣水解,形成清晰的透明圈,可以輕易地鑒別出來。分離乳酸產(chǎn)生菌時(shí),由于乳酸是一種較強(qiáng)的有機(jī)酸,因此,在培養(yǎng)基中加入的碳酸鈣不僅有鑒別作用,還有酸中和作用。
 
②變色圈法:對(duì)于一些不易產(chǎn)生透明圈產(chǎn)物的產(chǎn)生菌,可在底物平板中加入指示劑或顯色劑,使所需微生物能被快速鑒別出來。如篩選果膠酶產(chǎn)生菌時(shí),用含0.2%果膠為惟一碳源的培養(yǎng)基平板,對(duì)含微生物樣品進(jìn)行分離,待菌落長(zhǎng)成后,加入0.2%剛果紅溶液染色4h,具有分解果膠能力的菌落周圍便會(huì)出現(xiàn)絳紅色水解圈。在分離谷氨酸產(chǎn)生菌時(shí),可在培養(yǎng)基中加入溴百里酚藍(lán),它是一種酸堿指示劑,變色范圍在pH6.2~7.6,當(dāng)pH在6.2以下時(shí)為黃色,pH7.6以上為藍(lán)色。若平板上出現(xiàn)產(chǎn)酸菌,其菌落周圍會(huì)變成黃色,可以從這些產(chǎn)酸菌中篩選谷氨酸產(chǎn)生菌。
 
③生長(zhǎng)圈法:生長(zhǎng)圈法通常用于分離篩選氨基酸、核苷酸和維生素的產(chǎn)生菌。工具菌是一些相對(duì)應(yīng)的營(yíng)養(yǎng)缺陷型菌株。將待檢菌涂布于含高濃度的工具菌并缺少所需營(yíng)養(yǎng)物的平板上進(jìn)行培養(yǎng),若某菌株能合成平板所需的營(yíng)養(yǎng)物,在該菌株的菌落周圍便會(huì)形成一個(gè)混濁的生長(zhǎng)圈。如嘌呤營(yíng)養(yǎng)缺陷型大腸桿菌(如E.coliP264)與不含嘌呤的瓊脂混合倒平板,在其上涂布含菌樣品保溫培養(yǎng),周圍出現(xiàn)生長(zhǎng)圈的菌落即為嘌呤產(chǎn)生菌。
 
④抑菌圈法:常用于抗生素產(chǎn)生菌的分離篩選,工具菌采用抗生素的敏感菌。若被檢菌能分泌某些抑制菌生長(zhǎng)的物質(zhì),如抗生素等,便會(huì)在該菌落周圍形成工具菌不能生長(zhǎng)的抑菌圈,很容易被鑒別出來。
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