歷代王朝一般都設(shè)有或留都或陪都，比如選擇原來的都城或者重點(diǎn)城市。明代陪都是南京，中央機(jī)構(gòu)基本保留了一套。
1644年清軍入關(guān)并遷都北京后，原來首都盛京改為留都，先以內(nèi)大臣一人為留守，順治三年（1646）改為昂邦章京。順治十四年清朝以“奉天承運(yùn)”之意在沈陽設(shè)奉天府（北京稱順天府），設(shè)府尹1人，掌盛京地方之事?？滴踉辏?662）改統(tǒng)轄今遼寧地區(qū)的“昂邦章京”為漢稱“鎮(zhèn)守遼東等處將軍”，并徙遼東?？滴跛哪辏?665），又改稱“鎮(zhèn)守奉天等處將軍”，即“奉天將軍”。乾隆十二年（1747）移駐盛京后，定稱“鎮(zhèn)守盛京等處將軍”，即“盛京將軍”；乾隆二十七年（公元1762年）規(guī)定，奉天府尹由盛京將軍節(jié)制。盛京將軍原為正一品武職，乾隆三十三年（1768）降為從一品武職。盛京將軍是統(tǒng)轄奉天的最高軍政長官。
奉天府下共設(shè)二府、四廳、五州、十四縣。奉天府尹為滿缺，秩正三品。按清代官制，奉天府例由光祿寺卿、太仆寺卿升任，若缺位無人，可由通政司副使、大理寺卿升任。府尹轄有治中，通判等官職。
并在盛京設(shè)盛京內(nèi)務(wù)府和盛京五部（順治三年（1646）清朝設(shè)立奉天昂邦章京，給予鎮(zhèn)守總管之?。皇哪辏?657）設(shè)奉天府，第二年在盛京設(shè)立禮部，次年又設(shè)戶部、工部?？滴踉辏?662）再設(shè)刑部，三十年（1691）又設(shè)兵部。當(dāng)時(shí)，為了使各地行政官員任免權(quán)統(tǒng)歸中央吏部管理，因此在盛京未設(shè)吏部）。
盛京內(nèi)務(wù)府設(shè)總管大臣一名，由盛京將軍兼任，因此盛京將軍衙門也叫總管內(nèi)務(wù)府衙門。盛京內(nèi)務(wù)府以處理盛京皇宮、盛京皇莊、圍場等方面事務(wù)。在總管大臣之下設(shè)上三旗佐領(lǐng)3人，主事1人，委署主事1人，掌盛京三旗包衣之政令。其下仿照京師內(nèi)務(wù)府建制，設(shè)有廣儲(chǔ)司、會(huì)計(jì)司、掌儀司、都虞司、營造司五司，只比京師內(nèi)務(wù)府少了慶豐司和慎行司兩個(gè)機(jī)構(gòu)。
盛京五部不設(shè)尚書，早先各設(shè)理事官一人，秩正四品，后各部改設(shè)侍郎1人，秩正二品。其下又設(shè)郎中、堂主事等官。盛京五部雖受中央六部節(jié)制，在行政管理上仍要會(huì)同盛京將軍、奉天府尹商辦。但五部也可直接向皇帝奏事，負(fù)有地方行政管理之責(zé)。盛京五部屬下各設(shè)有不同分司，以掌管不同職責(zé)。
盛京地區(qū)作為清王朝的龍興之地，駐防的兵力僅次于京畿地區(qū)。盛京將軍以下設(shè)副都統(tǒng)4人、副都統(tǒng)銜總管1人、城守尉8人、協(xié)領(lǐng)15人、防守尉2人、佐領(lǐng)131人、驍騎校207人；駐防盛京、興京、鳳凰城、義州、牛莊、錦州、金州、遼陽、熊岳、復(fù)州、寧遠(yuǎn)、廣寧、鐵嶺、開原等。乾隆末年，盛京將軍屬下共有八旗官兵7232人，八旗官兵連同家眷，近十萬之眾。
奉天府下的京縣承德縣，該縣類似于京師的大興、宛平二縣，其知縣級別地位較高?？滴醵辏?663年），以盛京城附郭設(shè)縣制，設(shè)正六品知縣一名，主管各項(xiàng)事宜。
