作者:小丫 來(lái)源:
嘉因同樣算read counts,為什么公司跟師兄算的結(jié)果不一樣?| Ensembl、UCSC、Refseq,該用哪個(gè)一文推薦用ensembl的gene model,哪些已經(jīng)測(cè)序的植物有ensembl基因組注釋呢?
列在這里,加上了中文名和漢語(yǔ)拼音,便于小伙伴兒們查找。
Species中文名
Aegilops tauschii節(jié)節(jié)麥
Amborella trichopoda無(wú)油樟
Arabidopsis lyrata琴葉擬南芥
Arabidopsis thaliana擬南芥
Beta vulgaris甜菜
Brachypodium distachyon二穗短柄草
Brassica napus油菜
Brassica oleracea甘藍(lán)
Brassica rapa白菜
Chlamydomonas reinhardtii萊茵衣藻
Chondrus crispus皺波角叉菜
Corchorus capsularis圓果黃麻
Cyanidioschyzon merolae紅藻
Galdieria sulphuraria紅藻
Glycine max大豆
Hordeum vulgare大麥
Leersia perrieri假稻屬
Medicago truncatula蒺藜苜蓿
Musa acuminata小果野蕉
Oryza barthii稻屬
Oryza brachyantha花藥野生稻
Oryza glaberrima非洲栽培稻
Oryza glumaepatula展穎野生稻
Oryza indica秈稻
Oryza longistaminata長(zhǎng)雄野生稻
Oryza meridionalis南方野生稻
Oryza nivara野生稻
Oryza punctata斑點(diǎn)稻
Oryza rufipogon野生稻
Oryza sativa稻
Ostreococcus lucimarinus鞭毛藻
Physcomitrella patens小立碗蘚
Populus trichocarpa楊樹(shù)
Prunus persica桃
Selaginella moellendorffii江南卷柏
Setaria italica小米
Solanum lycopersicum番茄
Solanum tuberosum馬鈴薯
Sorghum bicolor高粱
Theobroma cacao可可樹(shù)
Trifolium pratense紅三葉草
Triticum aestivum小麥
Triticum urartu烏拉爾圖小麥
Vitis vinifera葡萄
Zea mays玉米
用ensembl基因組的理由:
同樣用Ensembl算TPM,結(jié)果還是不一樣? | Ensembl的注意事項(xiàng)http://blog.sciencenet.cn/blog-3372875-1090618.html
本站僅提供存儲(chǔ)服務(wù),所有內(nèi)容均由用戶(hù)發(fā)布,如發(fā)現(xiàn)有害或侵權(quán)內(nèi)容,請(qǐng)
點(diǎn)擊舉報(bào)。