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DNA計算機
DNA計算機是一種生物形式的計算機。它是利用DNA(脫氧核糖核酸)建立的一種完整的信息技術(shù)形式,以編碼的DNA序列(通常意義上計算機內(nèi)存)為運算對象,通過分子生物學的運算操作以解決復雜的數(shù)學難題。
基本信息
中文名稱
DNA計算機
目    的
解決復雜的數(shù)學難題
屬    于
一種生物形式的計算機
利    用
DNA(脫氧核糖核酸)
目錄1簡介
2特點
3基本原理
4研究進展
5應用前景
折疊編輯本段簡介
DNA計算機
由于起初的DNA計算要將DNA溶于
DNA計算機"輸入"的是細胞質(zhì)中的RNA、蛋白質(zhì)以及其他化學物質(zhì),"輸出"的則是很容易辨別的分子信號。在生物醫(yī)學應用上,DNA計算機能夠探測和監(jiān)控基因突變等細胞內(nèi)一切活動的特征信息,確定癌細胞等病變細胞以及自動激發(fā)微小劑量的治療行 。
折疊編輯本段特點
與傳統(tǒng)
DNA計算機
的電子計算機相比,DNA計算機有著很多優(yōu)點,比如:
1)體積小。其體積之小,可同時容納1萬億個此類計算機于一支試管中。
2)存貯量大。1立方米的DNA溶液,可以存貯1萬億億的二進制數(shù)據(jù)。1立方厘米空間的DNA可儲存的資料量超過1兆片CD容量。
3)運算快。其運算速度可以達到每秒10億次,十幾個小時的DNA計算,相當于所有電腦問世以來的總運算量。
4)耗能低。DNA計算機的能耗非常低,僅相當于普通電腦的10億分之一。如果放置在活體細胞內(nèi),能耗還會更低。
5)并行性。普通電腦采用的都是以順序執(zhí)行指令的方式運算,由于DNA獨特的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),數(shù)以億計的DNA計算機可以同時從不同角度處理一個問題,工作一次可以進行10億次運算,即并行的方式工作,大大提高了效率。
此外,DNA計算機能夠使科學觀察與化學反應同步,節(jié)省大筆的科研經(jīng)費。
折疊編輯本段基本原理
機器計算的歷史可以追溯到1641年,當年18歲的法國數(shù)學家帕斯卡爾成功地制造了一臺齒輪傳動的八位加法計算機。這使人類計算方式、計算技術(shù)進入了一個新的階段。后經(jīng)過人們數(shù)百年的艱辛努力,終于在1945年成功地研制出了世界上第一臺電子計算機。從此,人類進入了一個全新的計算技術(shù)時代。
從最早的帕斯卡爾齒輪機到今天最先進的電子計算機,其計算方式都是一種物理性質(zhì)的符號變換,具體是由"加"和"減"這種基本動作構(gòu)成的。然而,目前的DNA計算則有了本質(zhì)性的變化。計算不再是一種物理性質(zhì)的符號變換,而是一種化學性質(zhì)的符號變換,即不再是物理性質(zhì)的"加"、"減"操作而是化學性質(zhì)的切割和粘貼、插入和刪除。這種計算方式的變革是前所未有的。具有劃時代的意義。
我們知道,DNA分子是一條雙螺旋的長鏈,上面布滿了"珍珠"即核苷酸,其上擁有四種堿基,分別為:腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)。DNA分子通過這些核苷酸的不同排列,能夠表達出生物體各種細胞擁有的大量信息。數(shù)學家、生物學家、化學家以及計算機專家從中得到啟迪。他們利用DNA能夠編碼信息的特點,先合成具有特定序列的DNA分子,使它們代表要求解的問題,然后通過生物酶的作用(相當于加減乘除運算),使他們相互反應,形成各種組合,最后過濾掉非正確的組合而得到的編碼分子序列就是正確答案。
折疊編輯本段研究進展
2011年10月,英國,用細菌研制出生物邏輯門
這是有史以來最先進的"生物電路"。 這種生物邏輯門是模塊化的,它們可以被安裝在一起,從而為未來建立更復雜的生物處理器鋪平了道路。
2011年9月,美國,用生物計算機摧毀癌細胞
這種生物計算機能夠進入人類細胞。通過對5種腫瘤特異性分子進行邏輯組合分析識別出特異癌細胞,從而觸發(fā)癌細胞的毀滅過程。這一成果為開發(fā)出特異的抗癌治療奠定基礎。
2011年7月,以色列,用生物計算機探測多種不同類型分子
這種生物計算機能同時自動探測多種不同類型的分子,可用于診斷疾病、控制藥物釋放,實現(xiàn)診斷治療一體化。
2009年,美國,用大腸桿菌研制成細菌計算機
這種細菌計算機可解決復雜數(shù)學問題。且速度遠快于任何以硅基礎的計算機。
2007年,美國,用DNA計算機實現(xiàn)RNA干擾機制
這種DNA計算機可進行基本邏輯工作,能夠應用于人工培養(yǎng)的腎細胞??茖W家將源于其他物種的單siRNA分子導入細胞,該DNA計算機能使編譯某種熒光蛋白 的目標基因關(guān)閉。
2006年,美國,用DNA計算機快速準確診斷禽流感病毒
這種DNA計算機能夠更快、更準確地檢測西尼羅河病毒 和禽流感 病毒,以及其他疾病。
2005年,以色列,用DNA計算機運行10億種由DNA軟件分子設計的程序
這種DNA計算機采用了新的溶液處理工藝等技術(shù),能夠運行10億種用DNA軟件分子設計的程序,有潛力覺察到細胞中與多種癌癥有關(guān)的異常信使RNA。為癌癥診斷提供信息。
2004年,中國,第一臺DNA計算機在上海交大問世
這種DNA計算機是在以色列魏茨曼研究所的DNA計算機的基礎上進行改進后完成,其中包括用雙色熒光標記對輸入與輸出分子進行同時檢測,用測序儀對自動運行過程進行實時監(jiān)測,用磁珠表面反應法固化反應提高可控性操作技術(shù)等,可在一定程度上完成模擬電子計算機處理0,1信號的功能。
2003年,美國,世界首臺可玩游戲的互動式DNA計算機問世
這種DNA計算機主要以生化酶為計算基礎來運算簡單游戲。
2002年2月,DNA計算機的研究則更進一步,日本奧林巴斯(Olympus) 公司宣布,該公司與東京大學聯(lián)合開發(fā)出了全球第一臺能夠真正投入商業(yè)應用的DNA計算機。他們開發(fā)的這種DNA計算機有分子計算組件和電子計算機部件兩部分組成。前者用來計算分子的DNA組合,以實現(xiàn)生化反應,搜索并篩選出正確的DNA結(jié)果,后者則可以對這些結(jié)果進行分析。據(jù)息,今年將正式投入商業(yè)化應用。
2001年11月,以色列科學家成功研制成世界第一臺DNA計算機,它的輸出、輸入和軟硬件全由在活性有機體中儲存和處理編碼信息的DNA分子組成。該計算機不過一滴水大小,比較原始,也沒有任何相關(guān)應用產(chǎn)生,但這是未來DNA計算機的雛形。次年,研究人員又作了改進,
2000年,以色列,世界上第一臺DNA計算機問世
這是世界上第一臺成型的DNA計算機,可以解決一些相對復雜的運算問題。在當時它沒有什么實際用途,但它代表著DNA計算機已經(jīng)邁出科幻時代,并成為現(xiàn)實中一種初露端倪的技術(shù)。
2000年,美國威斯康星麥迪遜大學的科學家在簡化和按比例放大這種技術(shù)方面邁出了重要一步,他們采取了不同于阿德勒曼和其他先驅(qū)者所進行的試管實驗的辦法,把DNA固定到了一塊鍍金的玻璃載片(一種DNA芯片)上。其他研究人員則希望把DNA計算技術(shù)送回活的細胞中。在英國,一些科學家開展了在轉(zhuǎn)基因細胞內(nèi)部
模擬計算機邏輯電路的研究。
1994年,美國,DNA計算機概念首次提出
科學家用一支裝有特殊DNA的試管,解決了著名的"推銷員問題":有n個城市,一個推銷員要從其中某一個城市出發(fā),唯一走遍所有城市,再回到他出發(fā)的城市,求最短的路線。這個問題在當時即使用最快的半導體來推算,也需要至少兩年以上的時間,但是科學家用DNA計算只花了7天時間,令人嘆為觀止,從而開辟了DNA計算機研究的新紀元。
1994年11月,美國計算機科學家L.阿德勒曼(Leonard M. Adleman)用一種非同尋常的方式-DNA方式,解決了一個非常著名問題-哈密爾敦直接路役問題,俗稱"售貨員旅游問題"。其基本內(nèi)容是:假定有一個售貨員必須向他經(jīng)過的每一座城市推銷產(chǎn)品,但是為了節(jié)約時間,每座城市他只能途徑一次,路徑不能重復,而且路徑最短,而這個問題就是讓你為這個推銷員設計這樣一條路徑。
隨著城市數(shù)目的增加,問題會變的越來越困難。隨著難度的增加,要搜索到正確的路徑就需要更加強大的計算能力,最終會復雜到需要運用目前最先進的
阿德勒曼教授就是根據(jù)DNA分子信息表達的啟發(fā),他巧妙地利用DNA單鏈代表每座城市及
科學家認為,由于硅工業(yè)領域材料尺寸限制,傳統(tǒng)的電子技術(shù)在2020年后的某個時候?qū)⑦_到物理極限,因此,尋求新的替代技術(shù)具有非同尋常的意義。盡管阿德勒曼的實驗僅僅解決了7座城市的問題,然而這個問題的解決,突破了晶體硅材料的尺寸限制,使傳統(tǒng)的計算方法以前很難解決或根本無法解決的問題將變得輕而易舉,開創(chuàng)了在分子水平進行計算的先例,成為分子計算領域的里程碑。
阿德勒曼的成功,引起世界各國科學家極大關(guān)注,1995年,來自各國的200多位有關(guān)專家一起進一步探討了DNA計算機的可行性,認為DNA分子間在酶的作用下,某基因代碼通過生物化學的反應可以轉(zhuǎn)變成為另一種基因代碼,轉(zhuǎn)變前的基因代碼可以作為輸入數(shù)據(jù),反應后的基因代碼作為運算結(jié)果。利用這個過程完全可以制造新型的生物計算機。DNA計算技術(shù)被認為是代替?zhèn)鹘y(tǒng)電子技術(shù)的各種新技術(shù)中主要候選技術(shù)。
DNA計算機已經(jīng)成為當前世界許多國家科研人員研究的熱點之一,而且取得了突破性進展,但主要還處在理論研究和應用探索階段。
折疊應用前景
折疊獨特優(yōu)勢
未來的DNA計算機在研究邏輯、破譯密碼、基因編程、疑難病癥防治以及航空航天等領域應用的獨特優(yōu)勢, 現(xiàn)在電子計算機是望塵莫及,應用前景十分樂觀。比如,DNA計算機的出現(xiàn),使在人體內(nèi)、在細胞內(nèi)運行的計算機研制成為可能,它能夠充當監(jiān)控裝置,發(fā)現(xiàn)潛在的致病變化,還可以在人體內(nèi)合成所需的藥物,治療癌癥、心臟病、動脈硬化等各種疑難病癥,甚至在恢復盲人視覺方面,也將大顯身手。
折疊人機合一
完全可以想象,一旦DNA計算技術(shù)全面成熟,那么真正的"人機合一"就會實現(xiàn)。因為大腦本身就是一臺自然的DNA計算機,只要有一個接口,DNA計算機通過接口可以直接接受人腦的指揮,成為人腦的外延或擴充部分,而且它以從人體細胞吸收營養(yǎng)的方式來補充能量,不用外界的能量供應。像科幻小說中向大腦植入以DNA為基礎的人造智能芯片,未來就像接種疫苗一樣簡單。無疑,DNA計算機的出現(xiàn)將給人類文明帶來一個質(zhì)的飛躍,給整個世界帶來巨大的變化,有著無限美好的應用前景。
折疊水平限制
不過,由于受目前生物技術(shù)水平的限制,DNA計算過程中,前期DNA分子鏈的創(chuàng)造和后期DNA分子鏈的挑選,要耗費相當?shù)墓ぷ髁俊1热?,阿德勒曼?試管電腦"在幾秒鐘內(nèi)就得出結(jié)果,但是他卻花掉數(shù)周的時間去挑選正確的結(jié)果。還有,如果實驗中城市數(shù)目增加到200個,那么計算所需的DNA重量將會超過地球的重量。而且數(shù)以億計的DNA分子非常復雜,在反應過程中很容易發(fā)生變質(zhì)和損傷,甚至試管壁吸附殘留都可能發(fā)生致命錯誤。因此,DNA計算機真正進入現(xiàn)實生活尚需時日。
當前,世界許多國家包括我國的科學家正在積極克服和解決上述難題,預計10至20年后,DNA計算機將進入實用階段。
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