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作者：Jevin
導讀：SARS-CoV-2 的一個未解決的問題是，在沒有病毒復制證據(jù)的情況下，患者在初次感染數(shù)周后通過 PCR 檢測到的病毒RNA通常保持陽性。這說明，SARS-CoV-2 RNA可以被逆轉(zhuǎn)錄并整合到感染細胞的基因組中，并表達為將病毒與細胞序列融合的嵌合轉(zhuǎn)錄本。重要的是，這種嵌合轉(zhuǎn)錄本在患者來源的組織中被檢測到。數(shù)據(jù)表明，在一些患者組織中，大多數(shù)病毒轉(zhuǎn)錄本都來自整合序列。
美國麻省理工學院在《Proceedings of the National Academy of Sciences》發(fā)表的研究表明新冠病毒的基因序列可以通過逆轉(zhuǎn)錄過程整合到宿主細胞的基因組中，然后基因組的這些部分可以被'讀取'成RNA，這些RNA可能會被核酸檢測檢出。
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2105968118
研究背景
01
在病毒沒有繁殖的情況下，新冠病毒RNA持續(xù)被檢出的一個可能解釋是病毒亞基因組RNA的DNA拷貝可能通過逆轉(zhuǎn)錄機制整合到宿主細胞的DNA中。整合到人類基因組中的新冠病毒DNA拷貝，可以再次轉(zhuǎn)錄成新冠病毒RNA。這可能是在最初感染的新冠病毒被清除很久之后，核酸檢測仍呈陽性的原因。
研究過程
02
為了驗證新冠病毒是否可能整合到人類基因組中，麻省理工學院研究人員在實驗室用新冠病毒感染人類細胞，然后在兩天后對感染細胞進行DNA測序，以確認是否包含新冠病毒的遺傳物質(zhì)。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，3種DNA檢測技術均在所有樣本中檢測出新冠病毒整合序列；整合進人類基因的新冠病毒序列，29％進入外顯子，42％進入內(nèi)含子，還有29％進入基因間序列。嵌入人體染色體的新冠病毒基因序列周圍，出現(xiàn)一些特征性的DNA片段，這說明病毒利用了細胞的逆轉(zhuǎn)錄機制，將自身的RNA逆轉(zhuǎn)錄成DNA，并插入染色體中。
研究人員發(fā)現(xiàn)，在一些患者來源的組織中，有證據(jù)表明，很大一部分病毒序列是從病毒序列的整合DNA拷貝轉(zhuǎn)錄而來的，從而產(chǎn)生病毒-宿主嵌合轉(zhuǎn)錄本。因此，病毒序列的整合和轉(zhuǎn)錄可能導致感染和臨床恢復后患者通過PCR檢測病毒RNA。由于僅檢測到主要來自整合到宿主細胞DNA中的病毒基因組末端的亞基因組序列，因此無法從整合的亞基因組SARS-CoV-2序列中產(chǎn)生傳染性病毒。
研究意義
03
研究結(jié)果表明有可能只有極少數(shù)的人類細胞經(jīng)歷病毒整合。在另一種RNA病毒整合到宿主細胞基因組的情況下，只有百分之一的感染細胞含有整合的病毒DNA。對于新冠病毒，人類的整合頻率仍然未知。此外，新冠病毒基因整合的人類細胞的比例可能非常小，但是全球也已經(jīng)有6.5億多人被感染，研究者懷疑這些整合的病毒基因是導致長期新冠的原因。因為這些整合片段可能被細胞合成蛋白質(zhì)，引發(fā)一系列免疫反應。
參考資料：
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2105968118
注：本文旨在介紹醫(yī)學研究進展，不能作為治療方案參考。如需獲得健康指導，請至正規(guī)醫(yī)院就診。
