牡丹的修剪工作重點應該放在秋季牡丹落葉后進行，春季只要進行一次疏蕾、除土芽即可達到植株健壯、花大色艷的目的。原因主要有三點：一是牡丹有枯梢退枝習性，俗話說：“牡丹長一尺縮八寸”即指此而言，由于當年生枝條上部各葉腋內(nèi)無芽點的部分不能木質(zhì)化，抗寒性差，冬天來臨便自行枯死，僅剩下半部分越冬，這一部分才是牡丹枝條當年的實際生長量。
10月下旬枝條的生長勢已定，需要有的放矢的修剪。二是牡丹的花芽分化開始于6月上中旬，結束于9月下旬至10月中旬，此時進行修剪可以根據(jù)觀賞需要選留花芽和枝條的數(shù)量。三是當年生的土芽枝此時可以根據(jù)株形的需要，進行適當?shù)倪x留，以免春季發(fā)芽后再修剪對自身養(yǎng)分的浪費。
修剪要根據(jù)牡丹的用途和株齡進行。筆者多年的管理實踐是：觀賞牡丹要勻枝疏蕾，生產(chǎn)牡丹要除蕾壯枝，新栽植牡丹要平頭，2～5年生牡丹要定枝，5～10年生牡丹要壯枝，老牡丹要惜枝。
觀賞牡丹要求植株健壯、花大色艷，所以要將過多花蕾疏除，若是一個枝條上著生了多個花蕾，開花時肯定不能花大色艷。同時要控制枝條數(shù)量，將個別用作更新枝或矯正冠形的土芽枝保留，其余的土芽枝一定要齊根部剪掉。生產(chǎn)用牡丹的土芽枝可以保留，只將過密枝、并生枝、交叉枝、內(nèi)向枝及病蟲枝等剪除，但春季一定要將花蕾打掉。牡丹春長枝、秋發(fā)根，開花會消耗掉大量養(yǎng)分，打蕾會促使牡丹多發(fā)枝、長壯枝，較快生長成商品苗。
新栽植的牡丹應澆透水，進地要先平頭，即齊根部平茬。結合鋤地封墑堆土進行，平茬要齊根部才會越長越壯。常有種植者反映牡丹平茬后越長越弱，有的甚至死掉了，其實是平茬時擔心剪死，在看見有芽子的地方下剪子，留5～10cm的樁的原因。其實牡丹有不定芽，即著生在根莖上出土后抽生為萌蘗枝，俗稱“土芽”，不定芽的萌發(fā)力很強，平頭后來年春季生長旺盛但不會開花，秋季發(fā)育分化形成花芽，翌年開花。
2～5年生牡丹要定枝，從栽植第2年起，應根據(jù)長勢定枝，春天新芽長至10cm左右時，挑選4～5個生長健壯、分布均勻的保留下來，作為主要枝干(俗稱定枝)，其余全部剪掉。以后每年秋季視株形、長勢選留土芽枝作為枝干培養(yǎng)，使植株逐年壯大、豐滿。
5～10年生牡丹要壯枝，栽種5年以上的牡丹長勢強勁，主要通過修剪控制枝條的數(shù)量，使植株健壯、株形圓整。秋季根據(jù)株形選留土芽枝，留壯去弱，剪掉弱枝、病枝、枯枝，并及時清園，減少病蟲害的發(fā)生。
老牡丹要惜枝。只要修剪得當、管理到位，栽種多年的牡丹仍會保持較好的長勢。注意保護枝條，避免意外傷害，修剪時老枝干上的萌芽枝要剪掉，否則會造成上部老枝條衰退，根部的土芽枝除更新復壯時一般不保留。
