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炎癥研究沒(méi)思路?看看這篇NC吧!

炎性小體(inflammasome)也算是國(guó)自然一個(gè)不小的熱點(diǎn),近年來(lái)的項(xiàng)目也是逐漸增長(zhǎng)。

今天就給大家分享一篇有關(guān)炎性小體相關(guān)的思路:The lncRNA Neat1promotes activation of inflammasomes in macrophages,文章發(fā)表在NC雜志上(IF=10分 )。

炎性小體是是由多種蛋白質(zhì)組成的復(fù)合體,是細(xì)胞質(zhì)中控制炎癥反應(yīng)和抗病原體感染或損傷的的重要信號(hào)傳導(dǎo)介質(zhì),其還能調(diào)節(jié)caspase-1依賴(lài)的形式編程性細(xì)胞焦亡(pyroptosis),誘導(dǎo)細(xì)胞在炎性和應(yīng)激的病理?xiàng)l件下死亡。目前已發(fā)現(xiàn)的炎性小體主要有5種,即NLRP1炎性小體、NLRP3炎性小體、NLRC4炎性小體、IPAF炎性小體和AIM2炎性小體。已知發(fā)現(xiàn)的炎性小體一般均含有凋亡相關(guān)微粒蛋白(apoptosis-associated speck-like protein containing CARD,,ASC)、caspase蛋白酶以及一種NOD樣受體(NOD-like receptor,NLR)家族蛋白(如NLRP1)或HIN200家族蛋白(如AIM2)。

作者首先通過(guò)lncRNA測(cè)序找到與小鼠骨髓來(lái)源的巨噬細(xì)胞炎性小體相關(guān)的lncRNA,結(jié)果發(fā)現(xiàn)4個(gè)lncRNA Gm26917,Gm42418,Gm26767和Neat1在NLRP3炎性小體中存在富集。其中通過(guò)敲減實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證這4個(gè)lncRNA對(duì)NLRP3炎性小體的激活作用,最終篩選出Neat1作為進(jìn)一步的研究對(duì)象。在Neat1敲除的基因鼠中也同樣驗(yàn)證了Neat1對(duì)NLRP3炎性小體的激活作用。

進(jìn)一步的分子機(jī)制研究表明,Neat1能夠激活NLRC4和AIM2炎性小體(這二者均介導(dǎo)激活caspase-1,誘發(fā)細(xì)胞凋亡),增強(qiáng)了介導(dǎo)caspase-1活化的各種經(jīng)典炎性體的組裝和活化。

進(jìn)一步的研究表明,Neat1對(duì)炎性小體的作用并不依賴(lài)于IL-6(一種促進(jìn)炎癥
和免疫反應(yīng)的細(xì)胞因子。

既然Neat1對(duì)炎性小體的作用不依賴(lài)于IL-6,作者便考慮Neat1是否與炎性小體之間存在直接的相互作用。利用免疫共沉淀,作者分析出Neat1與pro-caspase-1之間存在著持續(xù)的相互作用,并且是與其p20 domain的作用更為顯著。CLIP-seq實(shí)驗(yàn)則表明,Neat1是通過(guò)其5′ region與pro-caspase-1進(jìn)行相互作用的。

那么Neat1與pro-caspase-1的相互作用,到底對(duì)pro-caspase-1產(chǎn)生了怎樣的影響呢?結(jié)果表明,Neat1是通過(guò)增強(qiáng)pro-caspase-1的P20和P10兩個(gè)亞基之間的相互作用,來(lái)增加pro-caspase-1雜四聚體的穩(wěn)定性的,提高caspase-1的活性,從而進(jìn)一步的促進(jìn)caspase-1依賴(lài)的細(xì)胞凋亡。

到這里,Neat1的下游機(jī)制基本研究完了,下面便研究炎癥與Neat1之間的關(guān)系。

成熟的Neat1一般定位于細(xì)胞質(zhì)內(nèi),而當(dāng)炎癥反應(yīng)激活以后,Neat1會(huì)被釋放到細(xì)胞質(zhì)中,從而參與到整個(gè)炎癥應(yīng)激反應(yīng)之中。

Neat1的缺失則會(huì)削弱體內(nèi)的炎癥反應(yīng)。

到這里,整個(gè)研究主題lncRNA Neat1在炎癥中的作用便研究透徹了。整個(gè)研究的難點(diǎn)在于,首先要找到合適的lncRNA,其次,炎性小體分為多種,這也是要進(jìn)行大量的嘗試,其中必定包含許多失敗,所以整個(gè)研究的工作量還是相當(dāng)可觀的,能發(fā)NC也是相當(dāng)不易呀!

2021年度國(guó)自然醫(yī)學(xué)部國(guó)自32大科研熱點(diǎn)的中標(biāo)數(shù)統(tǒng)計(jì)如下:

2022熱點(diǎn)

2021年醫(yī)學(xué)部總中標(biāo)數(shù)

2022熱點(diǎn)

2021年醫(yī)學(xué)部總中標(biāo)數(shù)

免疫調(diào)控

852

細(xì)胞焦亡

118

血管生成、重構(gòu)

531

代謝重編程

118

線(xiàn)粒體

485

單細(xì)胞測(cè)序

105

外泌體

430

DNA甲基化

97

miRNA

413

組蛋白修飾

80

干細(xì)胞

371

內(nèi)質(zhì)網(wǎng)

76

lncRNA

371

炎性小體

76

細(xì)胞自噬

358

中性粒細(xì)胞誘捕網(wǎng)

67

腸道菌群

312

糖酵解

55

circRNA

287

氧化應(yīng)激

46

m6A、m5C、m7G

270

類(lèi)器官

46

鐵死亡

257

超級(jí)增強(qiáng)子

25

轉(zhuǎn)錄調(diào)控

232

精氨酸甲基化

25

缺氧、低氧

211

相分離

21

泛素化

186

乳酸化修飾

21

乙?;?/span>

135

遷移體

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