免费视频淫片aa毛片_日韩高清在线亚洲专区vr_日韩大片免费观看视频播放_亚洲欧美国产精品完整版

植物簡化基因組甲基化--（Plant-RRBS）DNA甲基化在植物基因組中以CG、CHG和CHH三種堿基序列的胞嘧啶上發(fā)生（H=A，T或C），甲基化轉(zhuǎn)移酶包括DRM，CMT和MET等。在植物中，DNA胞嘧啶的甲基化會導(dǎo)致基因表達的改變和轉(zhuǎn)座因子的失活，修飾狀態(tài)的改變可能產(chǎn)生具有不同表型狀態(tài)的表觀等位基因。全基因組亞硫酸鹽測序（WGBS）是植物甲基化檢測金標準。RRBS在哺乳動物甲基化檢測中廣泛應(yīng)用，但對植物基因組C堿基甲基化檢測覆蓋度極為有限。易基因研究團隊創(chuàng)建的雙酶切DRRBS（Plant-RRBS）被同行研究證明，對于大基因組或植物群體基因組甲基化的檢測極為有效，胞嘧啶覆蓋廣泛。技術(shù)優(yōu)勢精確度高：在其覆蓋范圍內(nèi)可達到單堿基分辨率；重復(fù)性好：多樣本的覆蓋區(qū)域重復(fù)性可達到85%-95%，適用于多樣本間的差異分析；性價比高：測序區(qū)域針對高CpG區(qū)域，數(shù)據(jù)利用率更高；原創(chuàng)技術(shù)：雙酶切DRRBS原創(chuàng)技術(shù)；發(fā)表BMC genomics；陶謙教授極力推薦。技術(shù)開發(fā)1、背景：基于RRBS位點覆蓋缺陷性，研發(fā)更具代表性的簡化基因組甲基化測序技術(shù)。2、方法：通過幾十種不同的限制性內(nèi)切酶模擬評估，篩選MspI、ApekI和DpnII等酶切組合應(yīng)用于動物、植物樣本基因組甲基化檢測，提高CG、CHG和CHH位點的覆蓋度。3、結(jié)論：雙酶切RRBS可以顯著提高哺乳動物基因組，特別是調(diào)控區(qū)域的CG位點覆蓋度，對于MRD檢測更加準確；Plant-RRBS對于植物基因組甲基化檢測而言，與全基因組甲基化檢測相比，可分析位點相當，但是測序深度更高。參考文獻Junwen Wang, et al. Double restriction-enzyme digestion improves the coverage and accuracy of genome-wide CpG methylation profiling by reduced representation bisulfite sequencing, BMC Genomics. 2013 Jan 16;14:11.Martin Schmidt, et al. Plant-RRBS, a bisulfite and next-generation sequencing-based methylome profiling method enriching for coverage of cytosine positions, BMC Plant Biol. 2017 Jul 6;17(1):115.Martin Schmidt, et al. Plant-RRBS: DNA Methylome Profiling Adjusted to Plant Genomes, Utilizing Efficient Endonuclease Combinations, for Multi-Sample Studies, Methods Mol Biol. 2020;2093:65-80.您可能還想知道：常用的6種DNA甲基化測序方法，你知道幾個？植物發(fā)育｜大豆：多組學揭示體細胞胚胎發(fā)生過程DNA甲基化與發(fā)育轉(zhuǎn)變的關(guān)系植物DNA甲基化專題|NAR：擬南芥AtHDA6與著絲粒周圍DNA甲基化關(guān)系研究植物DNA甲基化專題 | nature：油棕Karma轉(zhuǎn)座子表觀遺傳重要發(fā)現(xiàn)植物DNA甲基化專題 | 玉米：從群體水平揭示DNA甲基化變異對表型的貢獻原文解讀：表觀技術(shù)｜植物簡化基因組甲基化--（Plant-RRBS）mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAwNTY3NDIxMw==&mid=2650649479&idx=1&sn=30bfb9c4f1b92b53ba9b3341de25ee18&chksm=8310160db4679f1bed057d350e0016abc14928163d9241fb3c1630adc9019c32e4b90859d150&token=96951744&lang=zh_CN#rd