一天，一個同事問我說ggpubr包安裝不成功，我就自己試了一下，真的是……安裝不成功。
當(dāng)你到了我這個年紀(jì)（破罐子破摔），你就會知道，「如果有包安裝不上，那就不安裝了」。所以我就用資深數(shù)據(jù)分析師那意味深長的語氣勸他（而且一定要營造出分析結(jié)果不理想是他數(shù)據(jù)的問題），R包有很多，為何不換一個呢？
今天，另一個同事告訴我，說服務(wù)器的clusterProfiler和enrichplot自從重新裝了服務(wù)器，就沒有安裝成功做，做分析都是放到個人電腦上去做的。不能忍，今天就解決。因為我知道，折騰一下總能解決，但是我只想躺平。
centos7MRO4.0.2clusterProfiler和enrichplot包我有一個設(shè)想：
R4.1，然后在里面安裝R4.1我的顧慮：
因為conda環(huán)境還挺大，所以我在空間大的地方，新建文件夾R4.1_and_Rstudio
「新建環(huán)境：」
conda create -p /mnt/data/R4.1_and_Rstudio
「激活進(jìn)入環(huán)境：」
source activate /mnt/data/R4.1_and_Rstudio/
R4.1.0一行代碼搞定：
conda install -c conda-forge r-base
安裝成功之后，進(jìn)入R：
R version 4.1.0 (2021-05-18) -- "Camp Pontanezen"
Copyright (C) 2021 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-conda-linux-gnu (64-bit)
R是自由軟件，不帶任何擔(dān)保。
在某些條件下你可以將其自由散布。
用'license()'或'licence()'來看散布的詳細(xì)條件。
R是個合作計劃，有許多人為之做出了貢獻(xiàn).
用'contributors()'來看合作者的詳細(xì)情況
用'citation()'會告訴你如何在出版物中正確地引用R或R程序包。
用'demo()'來看一些示范程序，用'help()'來閱讀在線幫助文件，或
用'help.start()'通過HTML瀏覽器來看幫助文件。
用'q()'退出R.
>
可以看到，R4.1.0安裝成功。
一行代碼搞定：
wget https://download2.rstudio.org/server/centos7/x86_64/rstudio-server-rhel-1.4.1717-x86_64.rpm
sudo yum install rstudio-server-rhel-1.4.1717-x86_64.rpm
?好吧，這是兩行。
?
修改參數(shù)：
vi /etc/rstudio/rserver.conf
將下面代碼放到里面：
rsession-which-r=/mnt/data/R4.1_and_Rstudio/bin/R # 注意，這里是我們服務(wù)器上R4.1.0的路徑
「重啟Rstudio-server」
sudo rstudio-server status #查看RStudio-server
sudo rstudio-server stop #關(guān)閉RStudio-server
sudo rstudio-server restart #重啟RStudio-server
重啟之后，打開Rstudio-server，發(fā)現(xiàn)R版本已經(jīng)變?yōu)?code style="overflow-wrap: break-word;margin-right: 2px;margin-left: 2px;font-family: "Operator Mono", Consolas, Monaco, Menlo, monospace;word-break: break-all;color: rgb(53, 148, 247);background: rgba(59, 170, 250, 0.1);padding-right: 2px;padding-left: 2px;border-radius: 2px;height: 21px;line-height: 22px;">R4.1.0了，搞定！
「R4.1.0」
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("clusterProfiler")
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("enrichplot")
原本以為能安裝成功，結(jié)果發(fā)現(xiàn)報錯，類似這樣：
勝利的喜悅：
version ZLIB_1.2.9 not found其實，在R終端下，載入上面的軟件包沒問題，但是在Rstudio中載入就出錯：
> library(clusterProfiler)
錯誤: package or namespace load failed for 'clusterProfiler’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
無法載入共享目標(biāo)對象'/mnt/data/R4.1_and_Rstudio/lib/R/library/png/libs/png.so’：:
/lib64/libz.so.1: version `ZLIB_1.2.9' not found (required by /mnt/data/R4.1_and_Rstudio/lib/libpng16.so.16)
> library(clusterProfiler)
錯誤: package or namespace load failed for 'clusterProfiler’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
無法載入共享目標(biāo)對象'/mnt/data/R4.1_and_Rstudio/lib/R/library/png/libs/png.so’：:
/lib64/libz.so.1: version `ZLIB_1.2.9' not found (required by /mnt/data/R4.1_and_Rstudio/lib/libpng16.so.16)
然后作圖也報錯：
> plot(1)
Error in RStudioGD() :
Shadow graphics device error: r error 4 (R code execution error)
此外: There were 50 or more warnings (use warnings() to see the first 50)
太難了，以為所有問題都解決了，出了這幺蛾子。
多年的（摸魚）經(jīng)驗告訴我，不慌，先解決這個問題/lib64/libz.so.1: versionZLIB_1.2.9' not found`
先查看這個lib有哪些版本：
strings /lib64/libz.so.1 |grep "ZLIB*"
結(jié)果：
ZLIB_1.2.0
ZLIB_1.2.0.2
ZLIB_1.2.0.8
ZLIB_1.2.2
ZLIB_1.2.2.3
ZLIB_1.2.2.4
ZLIB_1.2.3.3
ZLIB_1.2.3.4
ZLIB_1.2.3.5
ZLIB_1.2.5.1
ZLIB_1.2.5.2
ZLIB_1.2.7.1
果然沒有ZLIB_1.2.9，那我看看服務(wù)器都有哪些/libz.so.1：
find / -name "libz.so.1"
選幾個看看看有沒有ZLIB_1.2.9，然后將lib64的lib刪掉，重新建立軟鏈接。
# 確認(rèn)其中的某一個libz.so.1含有ZLIB_1.2.9
strings /home/softwares/anaconda3/lib/libz.so.1 |grep "ZLIB*"
# 替換
rm /usr/lib64/libz.so.1
# 也可以使用ln -s來創(chuàng)建軟連接
cp /home/softwares/anaconda3/lib/libz.so.1 /usr/lib64/
再次運行Rstudio-server，搞定！
因為現(xiàn)在Rstudio-server用的是conda環(huán)境中的R4.1，它會在conda環(huán)境中有一個library，普通用戶沒有寫入的權(quán)限，安裝R包時會在自己的路徑下自動新建一個library。如果安裝包出錯，就進(jìn)入conda的環(huán)境，安裝即可，絕對可以成功。
特別好使！
1，conda新建環(huán)境安裝R4.1.0，因為是全新的環(huán)境，可以安裝任何包都不會報錯，如果報錯了，就分開安裝，然后再安裝，一般都能解決問題。
2，外部是可以用conda環(huán)境中的程序的，指定路徑就行。
3，Rstudio-server可以指定R版本，在/etc/rstudio/rserver.conf設(shè)置一下就行
4，如果有些軟件安裝比較麻煩，各種報錯，不要在root下安裝了，直接新建conda環(huán)境，在環(huán)境中安裝配置好，用得時候絕對調(diào)用就行。
5，沒有安裝不了的R包，折騰一下總能實現(xiàn)。
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