高新技術(shù)企業(yè)會計核算要點主要表現(xiàn)在以下幾個方面：
一：建立研發(fā)費用會計核算制度，做到單獨建賬，獨立核算。
研發(fā)費用需要進行單獨建賬，獨立核算，是會計核算的基本要求，也是財務(wù)管理的多方面需求。（企業(yè)經(jīng)濟要素六大內(nèi)容：資產(chǎn)、負債、所有者權(quán)益、收入、成本、利潤）
首先，高新技術(shù)企業(yè)認定中研發(fā)費用的歸集中要做到單獨建賬，獨立核算，能完整、準確反映研發(fā)經(jīng)費支出。
其次，研發(fā)費用所得稅稅前加計扣除也需要做到單獨建賬，獨立核算。根據(jù)規(guī)定，企業(yè)必須對研究開發(fā)費用實行專賬管理，按照項目規(guī)定準確歸集填寫年度可加計扣除的各項研究開發(fā)費用實際發(fā)生金額。
最后，財政分期補助等項目也需要對研究開發(fā)費用進行單獨建賬，獨立核算。項目和課題經(jīng)費應(yīng)當納入單位財務(wù)同意核算，確保?？顚Ｓ?。
二：科學設(shè)置研發(fā)費用會計核算科目體系
研發(fā)費用單獨建賬，獨立核算，要在“研發(fā)支出”科目下按項目名稱、經(jīng)費來源、費用明細進行會計核算。
在設(shè)置會計科目時還需同時兼顧不同會計核算的需求，因為高新技術(shù)企業(yè)認定、所得稅稅前加計扣除、財政補助項目等對研發(fā)費用的核算口徑不一致，為了滿足研發(fā)費用不同的歸集需要，在設(shè)置研發(fā)費用明細科目時需根據(jù)需要進行增減。
如高新技術(shù)企業(yè)往往會申請研發(fā)費用加計扣除，在設(shè)置會計科目時應(yīng)兼顧兩者需要，在“直接投入”、“其他費用”下增加加計扣除需要歸集的而高新技術(shù)企業(yè)認定中項目。
三、高新企業(yè)核算重點：
1.研發(fā)費用歸集要求
企業(yè)從事研發(fā)活動發(fā)生的下列費用支出，可納入稅前加計扣除的研究開發(fā)費用范圍：
1）企業(yè)依照國務(wù)院有關(guān)主管部門或者省級人民政府規(guī)定的 范圍和標準為在職直接從事研發(fā)活動人員繳納的基本養(yǎng)老保險金、基本醫(yī)療保險費、失業(yè)保險費、工傷保險費、生育保險費和住房公積金。
2）專門用于研發(fā)活動的儀器、設(shè)備的運行調(diào)整、檢驗、維修等費用。
3）不構(gòu)成固定資產(chǎn)的樣機、樣品及一般測試手段購置費。
4）新藥研制的臨床試驗費
5）研發(fā)成果的鑒定費用
3.企業(yè)可以聘請具有資質(zhì)的會計師事務(wù)所或稅務(wù)師事務(wù)所，出具當年可加計扣除研發(fā)費用專項審計報告或鑒定報告
4.主管稅務(wù)機關(guān)對企業(yè)申報的研究開發(fā)項目有異議的，可要求企業(yè)提供地方級（含）以上政府科技部門出具的研究開發(fā)項目鑒定意見書。
5.研發(fā)費用核算
6.研發(fā)費用資本化
7.營業(yè)收入明細核算
8.成長性指標
