扣除基數(shù)有變化
原內(nèi)資稅法規(guī)定的扣除基數(shù)為計稅工資總額，《國家稅務(wù)總局關(guān)于修訂企業(yè)所得稅納稅申報表的通知》（國稅發(fā)〔2006〕56號）第四條對于工會經(jīng)費的扣除基數(shù)作了明確解釋，“《國家稅務(wù)總局關(guān)于工會經(jīng)費稅前扣除問題的通知》（國稅函〔2000〕678號）中所稱每月全部職工工資，是指按稅收規(guī)定允許稅前扣除的工資額。該數(shù)額是允許稅前扣除的工會經(jīng)費的計算基數(shù)。”
外資企業(yè)規(guī)定的扣除基數(shù)為職工實發(fā)工資總額，《中華人民共和國外資企業(yè)法實施細則》第六十九條規(guī)定，“外資企業(yè)每月按照企業(yè)職工實發(fā)工資總額的2％撥交工會經(jīng)費，由本企業(yè)工會依照中華全國總工會制定的有關(guān)工會經(jīng)費管理辦法使用。”
新企業(yè)所得稅法下的扣除基數(shù)為工資薪金總額，《中華人民共和國企業(yè)所得稅法實施條例》第四十一條規(guī)定“企業(yè)撥繳的工會經(jīng)費，不超過工資薪金總額2%的部分，準予扣除”。而根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法實施條例》第三十四條對于工資薪金有著明確的規(guī)定，即：“工資薪金，是指企業(yè)每一納稅年度支付給在本企業(yè)任職或者受雇的員工的所有現(xiàn)金形式或者非現(xiàn)金形式的勞動報酬，包括基本工資、獎金、津貼、補貼、年終加薪、加班工資，以及與員工任職或者受雇有關(guān)的其他支出。”可以看出，隨著工資薪金范圍的擴大，工會經(jīng)費的扣除基數(shù)也一并提高。
扣除須有專用收據(jù)
2000年，國家稅務(wù)總局下發(fā)的《關(guān)于工會經(jīng)費稅前扣除問題的通知》（國稅函〔2000〕678號）中規(guī)定，建立工會組織的企業(yè)、事業(yè)單位、社會團體，按每月全部職工工資總額的2%向工會撥交的經(jīng)費，憑工會組織開具的《工會經(jīng)費撥繳款專用收據(jù)》在稅前扣除。凡不能出具《工會經(jīng)費撥繳款專用收據(jù)》的，其提取的職工工會經(jīng)費不得在企業(yè)所得稅前扣除。
2005年，中華全國總工會和國家稅務(wù)總局聯(lián)合下發(fā)了《關(guān)于進一步加強工會經(jīng)費稅前扣除管理的通知》（總工發(fā)〔2005〕9號），對工會經(jīng)費的稅前扣除作了進一步明確：凡依法建立工會組織的企業(yè)、事業(yè)單位以及其他組織，每月按照全部職工工資總額的2%向工會撥繳工會經(jīng)費，并憑工會組織開具的工會經(jīng)費撥繳款專用收據(jù)在稅前扣除。
新企業(yè)所得稅法實施條例中對此問題也明確提出了“撥繳”的概念。在此提醒企業(yè)：在扣除工會經(jīng)費時一定要注意工會經(jīng)費的扣除需憑專用收據(jù)才行。
