軍隊的基礎(chǔ)是可靠的民眾，清朝擊敗了準噶爾汗國，覆滅了和卓政權(quán)，但滿清和民國在新疆的軍事力量都不強，總兵力只有四萬人的浩罕國就多次入侵新疆，沙俄也對新疆虎視眈眈，這些問題的根源就是新疆中國政權(quán)可以依賴的民眾太少。
乾隆把新疆歸入版圖后，還一度遭到了阿富汗帝國的挑戰(zhàn)，皇阿瑪?shù)姆磻?yīng)就是不理睬自己的屬國，兩眼一閉全當(dāng)沒看見。這是很正常的反應(yīng)，因為乾隆時期清軍綠營在新疆的總兵力是11，000人，兵力最多時達到過16，000人。滿清還把索倫人等新滿洲兵力調(diào)往新疆，當(dāng)時新疆有卡倫七十多座，索倫、錫伯、察哈爾、額魯特四營按照每個卡倫十幾到三十人的兵力進行常駐，兵力最多為6000人，平時只能保持2000人左右的常駐兵力。
截至到1944年，新疆進行人口統(tǒng)計時，錫伯族人口僅僅時1萬零624人，達斡爾族更是只有2508人。整個新疆，滿清可以動用的兵力最多不超過兩萬人。阿富汗杜蘭尼王朝最多能出動20萬人，它在乾隆時期重創(chuàng)了莫臥兒帝國，還多次和此大陸強權(quán)馬拉塔聯(lián)盟開戰(zhàn)并獲勝，當(dāng)時的阿富汗帝國可是非常不好惹。乾隆時期滿清還能和阿富汗人掰掰腕子，到了嘉慶、道光時期，滿清就難以應(yīng)對浩罕國的挑戰(zhàn)。
浩罕國多次支持和卓的后裔在新疆鬧大新聞，還派出自己的上萬部隊參與其中。嘉慶道光年間，滿清在新疆的總兵力不超過15000人，有半數(shù)還集中在北疆烏魯木齊一帶（烏魯木齊4500多人，鎮(zhèn)西府2000多人），和卓后裔、浩罕國一聯(lián)手就能在新疆拉起三四萬的隊伍，對南疆的清軍形成兵力優(yōu)勢。
好在當(dāng)時浩罕國的軍隊?wèi)?zhàn)力并不強，鴉片戰(zhàn)爭時期的敗將奕山都帶著4700多名清軍擊敗3萬多人的浩罕國大軍。滿清雖然能擊敗浩罕國，卻無法徹底征服這個國家。浩罕國反而借助同道光簽訂的條約，把6000多名本國商人派到新疆。除了浩罕國商人，清朝末年新疆還有12萬來自中亞的各色人等。這些人對中國政府的統(tǒng)治形成了巨大威脅，因為新疆直到1850年才有各族人口73萬4389人，他們相當(dāng)于新疆人口的六分之一。
滿清可以利用的綠營及其家屬不超過十萬人，漢人民戶最多有十五萬人，遣犯及其家屬也有五萬人，加上商戶，滿清手中的漢人只有30萬人左右。新疆的滿洲八旗、索倫、錫伯、察哈爾、額魯特四營加起來也只有兩萬人左右的兵力儲備（這還是人多時），整個新疆滿清最放心的人力資源只有三十多萬。
中亞各國不請自來的人員已經(jīng)是漢人的四成，他們還被浩漢國商人憑借特權(quán)集合在一起，成了新疆的重大威脅。在歷次和卓之亂中，他們都給浩罕國帶路。阿古柏侵入新疆時，也是他們給了阿古柏支持，讓阿古柏從幾十個手下的流亡軍頭變成了擁兵上萬的新疆巨頭。浩罕國滅亡、阿古柏政權(quán)覆滅后，這些中亞人士又都換了沙俄的身份證，幫助沙俄侵略新疆。
民國建立后，新疆的漢族人口依舊稀少，1948年新疆的漢人也只有29萬人，青壯年男子更是只有4萬多人。新疆的主體民族人口過少，周邊涌入的外來人口過多，讓清末、民國時期的新疆烽火不斷。
