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(文章篇)S4E09: 做microRNA研究,提升文章檔次的三個錦囊。

大家好,今天我們介紹這篇文章:MicroRNA-143 Activation Regulates Smooth Muscle and Endothelial Cell Crosstalk in Pulmonary Arterial Hypertension.Circ Res(IF 11.0). 2015 Oct 23;117(10):870-83. (全文下載鏈接:http://pan.baidu.com/s/1nvkw6ed 密碼:ytw9),并在文后總結(jié)部分給大家提升文章檔次的三個錦囊。

首先我們看文章的機制圖:


在PASMC(肺動脈平滑肌細胞)中,肺動脈高壓發(fā)生相關(guān)信號通路通過激活miR-143/145啟動子活性調(diào)節(jié)miR-143/145的表達。 在血管重構(gòu)過程準哦功能,MiR-143-3p作為旁分泌信號來介導細胞運動、調(diào)控凋亡。在PAH(肺動脈高壓)進展過程中,PASMC分泌包含miR-143-3p的外泌體,并被轉(zhuǎn)運到PAEC(肺動脈內(nèi)皮細胞)誘導細胞的運動和血管生成。

這篇文章的內(nèi)容包括三部分:

1. MiR-143在PAH動物模型、病人樣本中高表達,而且miR-143/145的表達激活是由于其啟動子上游區(qū)域含PAH相關(guān)信號通路中轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點所導致;


2. MiR-143體外功能:影響PASMC的運動和凋亡;而MiR-143敲除或者抑制后改良了缺氧導致的PAH表型;


3. MiR-143通過PASMC分泌的外泌體傳遞到PAEC,并調(diào)節(jié)PAEC的運動和血管形成能力。

我們先看一下PASMC與PAEC的共培養(yǎng)體系(與Transwell非常像):


作者分別用共培養(yǎng)體系和來源于PASMC的培養(yǎng)基,來評估含MiR-143的外泌體從PASMC分泌到PAEC,并對PAEC運動能力的影響。



然后評估PASMC來源的外泌體中miR143對PAEC運動和血管形成能力的影響。



最后總結(jié)一下,這篇文章有幾個關(guān)鍵詞:microRNA;外泌體;肺高血壓;轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié),這篇文章之所以能發(fā)11分,我們有哪些亮點可供參考,以幫我們提升文章的檔次:

  1. 不走下游走上游:作者選microRNA143/145簇(cluster)作為關(guān)鍵分子,對microRNA的經(jīng)典套路來說,一般會從下游著手,比如預測靶基因,然后在PASMC中驗證microRNA143/145在PASMC中的功能(運動、凋亡),然后通過熒光素酶報告基因?qū)嶒炞C明microRNA143/145對靶基因的調(diào)控;而作者呢,則反其道而行之,研究microRNA上游的因子對表達的調(diào)控,此為亮點一;當然,對microRNA啟動子和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點的分析驗證、以及對甲基化等其他可能調(diào)控microRNA表達因素的排除也是我們學習的地方;

  2. 引入熱點:外泌體,在通過PASMC驗證了microRNA143的功能后,作者進一步研究了外泌體中的microRNA143在PASMC與PAEC細胞通訊中的作用,在對外泌體進行大小、電鏡、Marker等方式進行鑒定后,通過共培養(yǎng)體系、條件性培養(yǎng)基兩方面驗證外泌體在PASMC與PAEC細胞通訊中的作用,實驗設計和方法都很經(jīng)典,所以做microRNA研究的小伙伴,除了常規(guī)實驗外,可以考慮外泌體作為加分點哦!

  3. 體內(nèi)實驗表型逆轉(zhuǎn)考慮到動物實驗的復雜性,體外細胞實驗的表型有一定概率在動物實驗難以重復,不可否認,作者通過體內(nèi)動物模型實驗對microRNA143的進行了干預,并逆轉(zhuǎn)了PH的表型,這是本文加分的第三點。

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