近些年來,隨著國家對(duì)基礎(chǔ)科研領(lǐng)域的大力支持,國內(nèi)涌現(xiàn)出了大量的優(yōu)秀科學(xué)家,他們在各自的領(lǐng)域都取得了重大的突破。在最新一期science雜志上同時(shí)發(fā)表了四篇炎癥小體(inflammasome)相關(guān)文章,其中有兩篇是由清華大學(xué)柴繼杰教授完成,由此可見,在這個(gè)領(lǐng)域國內(nèi)學(xué)者還是相當(dāng)杰出的。
首先給大家介紹一下炎癥小體(inflammasome)的概念,炎癥小體是由細(xì)胞中的NOD樣受體家族成員,ASC和蛋白剪切酶caspase-1組成的多聚蛋白復(fù)合物,在受到外界病原相關(guān)分子模式或者危險(xiǎn)相關(guān)分子模式刺激時(shí),NOD樣受體會(huì)感知這些信號(hào),誘導(dǎo)炎癥小體復(fù)合物組裝活化,隨后caspase-1變成活化狀態(tài),一方面剪切炎性細(xì)胞因子IL-1β和IL-18,誘導(dǎo)后者活化釋放,介導(dǎo)炎癥反應(yīng)清楚病原微生物和危險(xiǎn)信號(hào);另一方面,caspase-1還能夠剪切GSDMD,導(dǎo)致GSDMD活化,誘導(dǎo)細(xì)胞膜穿孔,介導(dǎo)細(xì)胞焦亡(Pyroptosis)。
細(xì)胞焦亡相關(guān)推文:
在炎癥小體相關(guān)領(lǐng)域,除了柴教授,還有幾位國內(nèi)學(xué)者也相當(dāng)突出。首先要說的是北京生命科學(xué)研究所的邵峰院士,他首次發(fā)現(xiàn)了炎癥小體的非經(jīng)典通路,并且鑒定出了介導(dǎo)細(xì)胞焦亡的關(guān)鍵蛋白GSDMD,在這個(gè)領(lǐng)域已經(jīng)發(fā)表了二十多篇主刊。
還有就是中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)的周榮斌教授,他的主要貢獻(xiàn)是首次闡明了線粒體活性氧(ROS)在炎癥小體活化過程中的關(guān)鍵作用,是炎癥小體活化的三大假說之一,相關(guān)文章于2011年發(fā)表在nature雜志上,目前已經(jīng)被引用2400次,是炎癥小體領(lǐng)域引用次數(shù)最高的文章。
除此之外,華人學(xué)者陳志堅(jiān)教授在炎癥小體領(lǐng)域也有較大建樹,特別是他近期發(fā)表在nature上的文章闡明了高爾基體在NLRP3炎癥小體活化過程中的重要作用。
閑話少說,下面簡要看看這期science上的四篇關(guān)于炎癥小體的文章。
首先是兩篇關(guān)于NLRP1B炎癥小體的文章,通訊作者分別為加州大學(xué)伯克利分校的Russell E. Vance教授和隆凱特琳癌癥中心的Daniel A. Bachovchin教授。在這兩篇文章中,作者推翻了以往關(guān)于NLRP1B炎癥小體活化機(jī)制的自抑制理論,闡明了NLRP1B的功能性降解對(duì)其活化至關(guān)重要。
研究背景:NLRP1B炎癥小體是由NLRP1B受體,接頭蛋白ASC(有時(shí)候不需要)以及caspase-1前體組成的多聚蛋白復(fù)合物。目前的研究表明寄生蟲,弓形蟲以及炭疽桿菌的毒素能夠?qū)LRP1B的N端結(jié)構(gòu)域進(jìn)行水解,解除其自抑制功能,誘導(dǎo)NLRP1B炎癥小體組裝活化。雖然這種自抑制機(jī)制能夠解釋部分毒素活化的NLRP1B炎癥小體,但是卻無法解釋一些蛋白酶體抑制劑,比如MG132和Bortezomib為何也能一直NLRP1B的活化,這表明NLRP1B炎癥小體的活化還存在其他的活化機(jī)制。
研究結(jié)果:為了探究NLRP1B炎癥小體的活化機(jī)制,Russell E. Vance教授課題組對(duì)NLRP1B的N端結(jié)構(gòu)域進(jìn)行逐次突變,發(fā)現(xiàn)無論怎樣突變都不影響N端對(duì)NLRP1B的抑制作用,這表明N端的功能無氨基酸序列特異性。后期研究表明受到毒素刺激后,NLRP1B的N端序列發(fā)生水解導(dǎo)致不穩(wěn)定,隨后在泛素連接酶IpaH7.8的幫助下,N端發(fā)生蛋白酶體途徑降解,釋放出C端的UPA-CARD肽段與caspase-1結(jié)合形成NLRP1B炎癥小體。
Daniel A. Bachovchin教授課題組通過cas9技術(shù)進(jìn)行全基因組篩選參與NLRP1B炎癥小體活化的基因,發(fā)現(xiàn)大量介導(dǎo)蛋白酶體降解的基因參與炎癥小體活化,這暗示NLRP1B的降解與其活化密切相關(guān)。
隨后作者發(fā)現(xiàn)毒素的致死因子能夠?qū)LRP1B N端結(jié)構(gòu)域的44-45位點(diǎn)進(jìn)行剪切,在UBR2/4的幫助下發(fā)生降解,釋放C端結(jié)構(gòu)域和caspase-1組裝成NLRP1B炎癥小體。
可以看到,這兩篇文章雖然用了不同的研究思路和策略,但是殊途同歸,獲得了一致的結(jié)論,提出了NLRP1B炎癥小體活化的新機(jī)制,同時(shí)也表明了蛋白酶體的功能獲得性降解,顛覆了以往的認(rèn)知。
后面兩篇文章講述的植物抗病小體在抑制狀態(tài),中間狀態(tài)和活化狀態(tài)時(shí)冷凍電鏡結(jié)構(gòu),通訊作者是清華大學(xué)柴繼杰教授、王宏偉教授和中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所周儉民教授。
研究背景:與動(dòng)物的免疫系統(tǒng)一樣,植物在長期抵抗病原微生物入侵過程中也逐漸進(jìn)化出了一套免疫系統(tǒng),植物的免疫防御功能主要由抗病蛋白介導(dǎo),雖然已經(jīng)有多種抗病蛋白被報(bào)道,但是抗病蛋白究竟如何發(fā)揮功能目前還不清楚。
研究結(jié)果:為了探究抗病蛋白作用的具體機(jī)制,作者使用冷凍電鏡技術(shù),成功解析了RKS1-ZAR1復(fù)合物的結(jié)構(gòu)。通過對(duì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,作者發(fā)現(xiàn)在正常情況下,ZAR1-RKS1復(fù)合體結(jié)合ADP,導(dǎo)致其ZAR1處于失活狀態(tài),當(dāng)受到病原微生物感染時(shí),ZAR1識(shí)別病原蛋白的AvrAC,導(dǎo)致其NBD結(jié)構(gòu)域的構(gòu)象發(fā)生改變,釋放ADP,ZAR1活化,進(jìn)而發(fā)生寡聚,誘導(dǎo)抗病小體的活化,啟動(dòng)免疫反應(yīng),抵御病原微生物入侵。
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