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近年來,受益于靶向治療,非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者的治療和預(yù)后有了極大改善,這也主要依托組織測序的廣泛應(yīng)用,但在真實世界中,由于各種原因無法進行組織測序的患者很多[1-3],于是,更易于獲取樣本并進行檢測的血液循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)“順勢上位”。
不過,年輕的ctDNA也還存在一些不確定性,比如,經(jīng)ctDNA匹配到的靶向治療與組織測序匹配到的緩解率相近,但研究主要在小型隊列中進行,且沒有足夠的隨訪時間來確定其能否轉(zhuǎn)化為同樣的總生存期獲益,還有,ctDNA可以反映腫瘤侵襲性和疾病負(fù)擔(dān),但它預(yù)測預(yù)后的價值是否是獨立于腫瘤體積或其他臨床因素存在的呢?解決了這些問題,ctDNA才能“更上一層樓”。
今天,《自然·醫(yī)學(xué)》雜志刊登了一項研究結(jié)果[4],紀(jì)念斯隆·凱特林癌癥中心(MSKCC)的研究人員在一項大型前瞻性NSCLC國際隊列中,驗證了ctDNA陽性結(jié)果與更低的總生存率(OS)有關(guān)(HR=2.05,p<0.001),且獨立于臨床病理特征和腫瘤代謝體積,接受ctDNA測序后匹配的靶向治療的患者相比未接受的,OS更高(HR=0.63,p<0.001)。
研究人員在1/4的患者中發(fā)現(xiàn)了組織測序未檢測到的ctDNA基因組變異,它們表征了一些驅(qū)動耐藥性的基因變異,包括RICTOR和PIK3CA變異。
這項研究表明,ctDNA不僅可以指導(dǎo)治療決策,它本身也具有預(yù)測預(yù)后的價值。
這項研究共納入了1127例IV期或復(fù)發(fā)性NSCLC患者,要么在入組前沒有已知的驅(qū)動突變,要么在靶向治療后疾病進展。
所有患者都接受了ctDNA測序,血樣在入組第一天獲取,患者可自行選擇在之后再次提供血樣,不過大部分(89%)患者只提供了一次血樣。所有在MSKCC登記的患者都進行了組織測序。患者可根據(jù)個人意愿接受額外的血漿循環(huán)游離DNA(cfDNA)測序。
與組織相比,ctDNA測序的失敗率更低,周轉(zhuǎn)時間更短。1219次組織測序中有164次(13%)因材料不足或測序失敗而失敗,而1919次血漿測序(ctDNA或cfDNA)中只有37次(2%),有2例患者血漿和組織測序均未成功。從樣本采集到得到測序報告,組織測序花費了33天,而血漿測序僅為11天。
64%(722/1127)的患者至少有一種ctDNA變異,有ctDNA變異的患者OS較低(HR=2.05,p<0.001),這一結(jié)果可以推廣到MSKCC和悉尼隊列的初治和經(jīng)治患者中,并且ctDNA變異數(shù)量越多,OS越低。一些患者只有影響不明的變異,但他們和沒有變異的相比,OS也更低,這表明,即使沒有致病性變異,ctDNA陽性結(jié)果也預(yù)示著更差的預(yù)后。
有ctDNA變異(藍(lán))和無變異的患者的OS
腫瘤突變負(fù)荷(TMB)與ctDNA無關(guān),在接受靶向治療、免疫治療或化療的患者中,ctDNA均是更差預(yù)后的獨立預(yù)測因素。因此,ctDNA的預(yù)測作用獨立于治療模式和腫瘤基因組學(xué)。
除這兩者外,多個多變量分析還證實了,ctDNA具有獨立于腫瘤代謝體積等多種因素的獨立預(yù)后價值。
在得到測序結(jié)果后,共有418例(37%)患者接受了靶向治療,其中255例(23%)經(jīng)ctDNA匹配,163例(14%)經(jīng)組織測序匹配。所有接受靶向治療的患者中,可檢測到ctDNA的OS較低,經(jīng)ctDNA匹配到靶向治療的患者相比未接受靶向治療的,OS提高(HR=0.63,p<0.001),而未檢測到ctDNA的,是否接受靶向治療不影響OS。
這表明,在ctDNA陽性的患者中,靶向治療具有更大的相對獲益。
429例在ctDNA測序后30天內(nèi)接受組織測序的患者中,109例(25%)只在ctDNA測序中檢測到突變或拷貝數(shù)變化,其中有3例為EGFR T790M突變,患者因此轉(zhuǎn)換治療,其他可靶向突變還包括1例KRAS G12C突變、1例BRAF V600E突變和1例RET融合,但沒有轉(zhuǎn)換治療。
這種僅具有ctDNA檢測到的變異的患者,相比具有同時能夠被ctDNA和組織測序檢測到的變異的患者,OS降低,無論是突變還是拷貝數(shù)變化,結(jié)果都是一致的。這表明,僅ctDNA能檢測到的變異也是較為常見的,并且同樣具有預(yù)測預(yù)后的價值。
僅ctDNA檢測到變異的患者(紫)與ctDNA和組織測序均檢測到變異的患者(藍(lán))的OS
研究人員發(fā)現(xiàn)的僅ctDNA檢測到的變異其實也是組織中的常見變異,這些變異中,繼發(fā)性耐藥基因的比例很高,尤其是RICTOR、NTRK1、MET和ERBB2擴增和PIK3CA突變。
僅ctDNA和組織變異中,致病性變異的基因水平的分布
這些繼發(fā)性耐藥基因變異通常與更糟糕的預(yù)后有關(guān),但分析結(jié)果顯示,檢測到有ALK、RET和EGFR變異的患者有較高的OS,有STK11變異的患者有較低的OS,而RICTOR、NTRK1、MET和ERBB2和PIK3CA變異與較低的OS沒有關(guān)聯(lián)。這表明,ctDNA-組織測序結(jié)果的差異是一個關(guān)鍵預(yù)后因素,而不是基因組變異。
總的來看,這項研究表明,ctDNA一方面可以指導(dǎo)NSCLC患者的靶向治療用藥,改善患者預(yù)后,另一方面還可以作為一個獨立的OS預(yù)測因素,它是腫瘤微轉(zhuǎn)移或腫瘤侵襲性增加的標(biāo)志,在評估系統(tǒng)性治療后的疾病負(fù)擔(dān)和復(fù)發(fā)風(fēng)險時,可與放射性檢查結(jié)果結(jié)合。
當(dāng)然,這些結(jié)果也給研究人員提出了新的問題,比如,為什么ctDNA陰性的患者OS更高?是因為他們的腫瘤增殖緩慢嗎?是否與影響藥物攝取的腫瘤微環(huán)境特定特征有關(guān)?我們能否通過藥物將ctDNA陽性轉(zhuǎn)變?yōu)殛幮??這些問題需要基于ctDNA動力學(xué),分別從腫瘤和患者入手,來闡明其中的臨床和生物學(xué)機制[5]。
參考文獻(xiàn):
[1] Bruno D S, Hess L M, Li X, et al. Racial disparities in biomarker testing and clinical trial enrollment in non-small cell lung cancer (NSCLC)[J]. J Clin Oncol, 2021.
[2] Robert N J, Nwokeji E D, Espirito J L, et al. Biomarker tissue journey among patients (pts) with untreated metastatic non-small cell lung cancer (metastatic NSCLC) in the US Oncology Network community practices[J]. J Clin Oncol, 2021, 39.
[3] Zugazagoitia J, Ramos I, Trigo J M, et al. Clinical utility of plasma-based digital next-generation sequencing in patients with advance-stage lung adenocarcinomas with insufficient tumor samples for tissue genotyping[J]. Annals of Oncology, 2019, 30(2): 290-296.
[4] https://www.nature.com/articles/s41591-022-02047-z
[5] https://www.nature.com/articles/s41591-022-02068-8
本文作者丨應(yīng)雨妍